MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 6533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015067	TC	3	6	1511584	1511589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_015067	AAC	2	6	1511607	1511612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_015067	AAC	2	6	1511682	1511687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_015067	CCA	2	6	1512458	1512463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_015067	TCG	2	6	1512544	1512549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_015067	CAG	2	6	1513577	1513582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_015067	A	6	6	1513588	1513593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015067	AGGT	2	8	1513642	1513649	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015067	T	6	6	1513688	1513693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015067	CT	3	6	1514669	1514674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_015067	CTG	2	6	1514686	1514691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_015067	TAAC	2	8	1514709	1514716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_015067	CAC	2	6	1514759	1514764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_015067	GTT	2	6	1514799	1514804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015067	TTGG	2	8	1516355	1516362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015067	TTC	2	6	1516375	1516380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015067	TAT	2	6	1516391	1516396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015067	GCG	2	6	1516473	1516478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_015067	CGC	2	6	1516547	1516552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_015067	GCCG	2	8	1522776	1522783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_015067	CG	3	6	1522787	1522792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_015067	CT	3	6	1522821	1522826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_015067	CTCG	2	8	1522835	1522842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_015067	TAC	2	6	1522843	1522848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015067	TCG	2	6	1522857	1522862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015067	T	6	6	1522876	1522881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015067	CAC	3	9	1522927	1522935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_015067	CCG	2	6	1522954	1522959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_015067	ATC	2	6	1522967	1522972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015067	TCA	2	6	1524419	1524424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_015067	CGGCA	2	10	1524467	1524476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4032	NC_015067	AGG	2	6	1525958	1525963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015067	AAG	2	6	1526754	1526759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015067	TTC	2	6	1526765	1526770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_015067	TGGTT	2	10	1527490	1527499	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015067	TG	3	6	1528908	1528913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015067	GCG	2	6	1528931	1528936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_015067	CGC	2	6	1528959	1528964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_015067	GAAA	2	8	1528970	1528977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015067	GCG	2	6	1531571	1531576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_015067	CGTG	2	8	1531612	1531619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_015067	TAC	2	6	1533510	1533515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015067	GTCTT	2	10	1534473	1534482	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4044	NC_015067	GTG	2	6	1534543	1534548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015067	CGG	2	6	1534549	1534554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015067	GCC	2	6	1534654	1534659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_015067	TCT	2	6	1534665	1534670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015067	GGC	2	6	1534706	1534711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_015067	AGG	2	6	1534795	1534800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015067	CCT	2	6	1535092	1535097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_015067	ACG	2	6	1535140	1535145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015067	CGA	2	6	1535220	1535225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_015067	CGT	2	6	1535376	1535381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015067	TGCACT	2	12	1535403	1535414	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_015067	CG	3	6	1535581	1535586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_015067	ACC	2	6	1535825	1535830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_015067	GT	3	6	1536010	1536015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015067	ACC	2	6	1536112	1536117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_015067	GGC	2	6	1536137	1536142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015067	CAT	2	6	1536208	1536213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015067	ACC	2	6	1536278	1536283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_015067	CGGC	2	8	1536288	1536295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_015067	CTA	2	6	1536324	1536329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_015067	CCCGGA	2	12	1536382	1536393	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_015067	GGC	2	6	1536419	1536424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_015067	TC	3	6	1536563	1536568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_015067	GGT	2	6	1536679	1536684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015067	GCT	2	6	1536758	1536763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015067	CCT	2	6	1536774	1536779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_015067	GAC	2	6	1536835	1536840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_015067	CGA	3	9	1536861	1536869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_015067	CCG	2	6	1536880	1536885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_015067	GA	3	6	1537017	1537022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015067	C	6	6	1537073	1537078	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4075	NC_015067	TCC	2	6	1537103	1537108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_015067	ATC	2	6	1537147	1537152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_015067	CTCCC	2	10	1537336	1537345	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4078	NC_015067	GCCG	2	8	1537566	1537573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_015067	CG	3	6	1537611	1537616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_015067	CAT	2	6	1537653	1537658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_015067	TCGC	2	8	1537665	1537672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_015067	ACT	2	6	1537674	1537679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_015067	C	6	6	1537730	1537735	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4084	NC_015067	CGGT	2	8	1537761	1537768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_015067	GGC	2	6	1537809	1537814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_015067	CCA	2	6	1537872	1537877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_015067	GCAA	2	8	1537887	1537894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4088	NC_015067	CA	3	6	1537895	1537900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_015067	GAC	2	6	1537944	1537949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_015067	ATC	2	6	1537952	1537957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_015067	TTCGA	2	10	1538000	1538009	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_015067	CCA	2	6	1538075	1538080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_015067	CGCCA	2	10	1538086	1538095	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4094	NC_015067	CGGC	2	8	1538109	1538116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_015067	ACG	2	6	1538125	1538130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_015067	ACC	2	6	1538195	1538200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_015067	CACC	2	8	1538205	1538212	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4098	NC_015067	ACG	2	6	1538236	1538241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_015067	CGC	2	6	1538261	1538266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_015067	CG	3	6	1538282	1538287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_015067	AGG	2	6	1538333	1538338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015067	TGC	2	6	1538448	1538453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_015067	GT	3	6	1538477	1538482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015067	TCCGC	2	10	1538597	1538606	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4105	NC_015067	CGC	2	6	1538609	1538614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_015067	ATG	2	6	1538672	1538677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015067	TCC	2	6	1538698	1538703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_015067	CGG	2	6	1538714	1538719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_015067	CACGA	2	10	1538799	1538808	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4110	NC_015067	GAC	3	9	1538812	1538820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_015067	CAC	2	6	1538825	1538830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_015067	TTC	2	6	1538899	1538904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015067	CCG	2	6	1538932	1538937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_015067	CTC	2	6	1539116	1539121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_015067	TTC	2	6	1539163	1539168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015067	GCCC	2	8	1539228	1539235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4117	NC_015067	CGA	2	6	1539284	1539289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015067	AAT	2	6	1539314	1539319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015067	GCT	2	6	1539354	1539359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015067	ACTC	2	8	1539395	1539402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_015067	CTG	2	6	1539502	1539507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_015067	CCG	2	6	1539601	1539606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_015067	CCCAT	2	10	1539627	1539636	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4124	NC_015067	AGA	2	6	1539654	1539659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015067	ACC	2	6	1539689	1539694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_015067	GGTC	2	8	1539727	1539734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_015067	CAC	2	6	1539762	1539767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_015067	CAAG	2	8	1539768	1539775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_015067	CGC	2	6	1539812	1539817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_015067	A	7	7	1539853	1539859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015067	CAAAA	2	10	1539891	1539900	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4256	NC_015067	ACC	2	6	1588800	1588805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_015067	CCTC	2	8	1590371	1590378	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4258	NC_015067	GAGG	2	8	1590383	1590390	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_015067	T	6	6	1590391	1590396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_015067	GGC	2	6	1591391	1591396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4384	NC_015067	ACC	2	6	1646248	1646253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4385	NC_015067	CAG	2	6	1646289	1646294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4387	NC_015067	TCC	2	6	1647473	1647478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4388	NC_015067	GCG	2	6	1647509	1647514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4389	NC_015067	GGAGT	2	10	1647526	1647535	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4488	NC_015067	ATA	2	6	1701344	1701349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4489	NC_015067	CAGA	2	8	1702916	1702923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4491	NC_015067	CGT	2	6	1703022	1703027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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