MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 6533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015067	TTTCC	2	10	1120376	1120385	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3002	NC_015067	TCC	2	6	1120391	1120396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_015067	CG	3	6	1120427	1120432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015067	CGG	2	6	1120463	1120468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_015067	GCC	2	6	1120565	1120570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_015067	ACG	2	6	1120639	1120644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015067	GCGG	2	8	1120746	1120753	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_015067	GGC	2	6	1120756	1120761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_015067	GCG	2	6	1120883	1120888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_015067	CGGAC	2	10	1120933	1120942	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3011	NC_015067	AG	3	6	1121252	1121257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015067	CAT	2	6	1121265	1121270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015067	GAT	2	6	1121281	1121286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015067	CCG	2	6	1121367	1121372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_015067	CAT	2	6	1121427	1121432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015067	CCAC	2	8	1121545	1121552	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3017	NC_015067	TGC	2	6	1121564	1121569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015067	TCG	2	6	1121701	1121706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_015067	GAC	2	6	1121721	1121726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015067	GCA	2	6	1121739	1121744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015067	T	7	7	1121820	1121826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015067	GA	4	8	1122052	1122059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015067	AGAGA	3	15	1122055	1122069	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015067	CGTG	2	8	1122100	1122107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_015067	CGT	2	6	1122183	1122188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015067	ACA	2	6	1122227	1122232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_015067	ATCGA	2	10	1122236	1122245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_015067	TGC	2	6	1122271	1122276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015067	CTC	3	9	1122284	1122292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_015067	TGC	2	6	1122332	1122337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_015067	AGG	2	6	1122348	1122353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015067	GC	3	6	1122357	1122362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_015067	T	6	6	1122416	1122421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015067	GCCG	2	8	1122422	1122429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_015067	CCAT	2	8	1122554	1122561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_015067	GGA	2	6	1122649	1122654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015067	CTG	2	6	1122680	1122685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_015067	CCA	2	6	1122716	1122721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_015067	T	8	8	1122910	1122917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015067	TTG	2	6	1122924	1122929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015067	CTT	2	6	1122955	1122960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015067	CG	3	6	1122963	1122968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_015067	ACC	2	6	1122981	1122986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_015067	CGT	2	6	1123027	1123032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015067	AG	3	6	1123167	1123172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015067	GAA	2	6	1123198	1123203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015067	ACG	2	6	1123256	1123261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_015067	AGT	2	6	1123307	1123312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015067	CACC	2	8	1123362	1123369	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3050	NC_015067	ACG	2	6	1123556	1123561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015067	TCC	2	6	1123636	1123641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_015067	ACC	2	6	1123763	1123768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_015067	GT	3	6	1123995	1124000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015067	TTCC	2	8	1124001	1124008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_015067	CG	4	8	1124016	1124023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_015067	GGA	2	6	1124027	1124032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015067	ATA	2	6	1124055	1124060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015067	C	6	6	1124101	1124106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3059	NC_015067	AGGA	2	8	1124194	1124201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015067	TCG	2	6	1124237	1124242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_015067	GCG	2	6	1124279	1124284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_015067	CAT	2	6	1124292	1124297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015067	CAC	2	6	1124313	1124318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_015067	TTG	2	6	1124369	1124374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015067	TGT	3	9	1124410	1124418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015067	CA	3	6	1124473	1124478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_015067	GTC	2	6	1124512	1124517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015067	AG	3	6	1124606	1124611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015067	TCGA	2	8	1124677	1124684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_015067	TCC	2	6	1124707	1124712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_015067	CTT	2	6	1124715	1124720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_015067	GAT	2	6	1124742	1124747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015067	CATC	2	8	1124781	1124788	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_015067	TCA	2	6	1124804	1124809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_015067	TGT	2	6	1124886	1124891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_015067	AC	3	6	1124903	1124908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_015067	GTG	2	6	1124924	1124929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015067	TCC	2	6	1124942	1124947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_015067	CTG	2	6	1125001	1125006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_015067	AT	3	6	1125074	1125079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015067	AAGAAA	2	12	1125098	1125109	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015067	CCAC	2	8	1125140	1125147	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3083	NC_015067	GTTC	2	8	1125159	1125166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_015067	AAT	2	6	1125202	1125207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015067	TGC	2	6	1125276	1125281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_015067	CAC	2	6	1125287	1125292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_015067	GCCG	2	8	1125313	1125320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_015067	ATTCC	2	10	1125337	1125346	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3089	NC_015067	GC	3	6	1125351	1125356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_015067	CGT	2	6	1125370	1125375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015067	CGG	2	6	1125401	1125406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_015067	CGG	2	6	1125427	1125432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_015067	GGACG	2	10	1125460	1125469	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3094	NC_015067	G	7	7	1125610	1125616	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015067	AGA	2	6	1125665	1125670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015067	CG	3	6	1125703	1125708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_015067	GA	3	6	1125709	1125714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015067	GCGG	2	8	1125732	1125739	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_015067	CGT	2	6	1125920	1125925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_015067	GC	3	6	1125938	1125943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_015067	GC	3	6	1125964	1125969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_015067	GGA	2	6	1125973	1125978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015067	GT	3	6	1126009	1126014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015067	CG	3	6	1126857	1126862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_015067	CGG	3	9	1126864	1126872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_015067	GTC	2	6	1128921	1128926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_015067	TGG	3	9	1128953	1128961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015067	GGA	2	6	1128964	1128969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015067	CTG	2	6	1129008	1129013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_015067	CGC	2	6	1129018	1129023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_015067	GCCAC	2	10	1129027	1129036	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3112	NC_015067	TTGC	2	8	1129170	1129177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_015067	CGC	2	6	1129363	1129368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_015067	GAA	3	9	1129382	1129390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015067	CGTT	2	8	1129401	1129408	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_015067	TGA	2	6	1129422	1129427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015067	GCC	2	6	1129550	1129555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_015067	TCG	2	6	1129662	1129667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_015067	CCGT	2	8	1129672	1129679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_015067	CCGG	2	8	1129746	1129753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_015067	TCT	2	6	1129790	1129795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_015067	CAT	2	6	1129859	1129864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015067	AGGA	2	8	1129889	1129896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015067	TA	4	8	1129955	1129962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015067	T	6	6	1129988	1129993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015067	GAA	2	6	1130044	1130049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015067	TGT	2	6	1130058	1130063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015067	C	6	6	1130098	1130103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3129	NC_015067	GGA	2	6	1130126	1130131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015067	TCC	2	6	1130142	1130147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_015067	TCC	2	6	1130169	1130174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_015067	TCCC	2	8	1130195	1130202	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3133	NC_015067	GGGC	2	8	1130243	1130250	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_015067	TCTTT	2	10	1130313	1130322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3135	NC_015067	CAT	2	6	1130382	1130387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_015067	AGGA	2	8	1130412	1130419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_015067	T	6	6	1130468	1130473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_015067	TTTA	2	8	1130476	1130483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_015067	GCCCC	2	10	1130611	1130620	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3140	NC_015067	GC	3	6	1130637	1130642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3141	NC_015067	CGG	2	6	1133875	1133880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_015067	CG	5	10	1133885	1133894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3143	NC_015067	AAC	2	6	1133919	1133924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_015067	AG	3	6	1135645	1135650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_015067	GAAAAC	2	12	1135674	1135685	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3146	NC_015067	T	6	6	1135710	1135715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_015067	CGG	2	6	1141901	1141906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_015067	TTC	2	6	1144851	1144856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_015067	CAT	2	6	1144880	1144885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3151	NC_015067	CCG	2	6	1144939	1144944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3152	NC_015067	CAT	2	6	1145031	1145036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3154	NC_015067	CGC	2	6	1145066	1145071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3155	NC_015067	GCCG	3	12	1148165	1148176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3156	NC_015067	GGACG	2	10	1148196	1148205	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3157	NC_015067	GCC	2	6	1148222	1148227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3158	NC_015067	AGCC	2	8	1148228	1148235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3159	NC_015067	CGA	3	9	1148286	1148294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_015067	GC	3	6	1148383	1148388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3162	NC_015067	GAC	2	6	1148423	1148428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3164	NC_015067	GTC	2	6	1150110	1150115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3165	NC_015067	TGAT	2	8	1150129	1150136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_015067	CCG	2	6	1151732	1151737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3169	NC_015067	TCA	2	6	1151851	1151856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_015067	A	8	8	1151884	1151891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3177	NC_015067	CG	3	6	1152073	1152078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3180	NC_015067	CCG	2	6	1152170	1152175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3255	NC_015067	G	6	6	1175641	1175646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_015067	GCTT	2	8	1176379	1176386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_015067	TCT	2	6	1176476	1176481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3263	NC_015067	TCA	2	6	1176698	1176703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3392	NC_015067	A	6	6	1222544	1222549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3393	NC_015067	GC	3	6	1222559	1222564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3394	NC_015067	GCCA	2	8	1225850	1225857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3398	NC_015067	ACCG	2	8	1225913	1225920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3495	NC_015067	ACTG	2	8	1263705	1263712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3496	NC_015067	TGCGA	2	10	1264339	1264348	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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