MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 6533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015067	CA	3	6	495199	495204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_015067	CGA	2	6	495271	495276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015067	TGA	2	6	496069	496074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015067	CGG	2	6	500071	500076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_015067	TCGGC	2	10	501424	501433	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1506	NC_015067	AGA	2	6	501434	501439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015067	CGC	2	6	501477	501482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_015067	GTC	2	6	501503	501508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015067	GA	3	6	501615	501620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015067	GGTTT	2	10	501643	501652	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015067	TG	3	6	501662	501667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015067	AGAA	2	8	503741	503748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015067	GGC	2	6	505362	505367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_015067	CAG	2	6	505373	505378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_015067	GCC	2	6	505379	505384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_015067	GAG	2	6	505391	505396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015067	TGA	2	6	505445	505450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015067	TCAA	2	8	506930	506937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_015067	GAT	2	6	507074	507079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015067	TGC	2	6	507085	507090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015067	CT	3	6	507106	507111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_015067	CGTT	2	8	507124	507131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_015067	GCT	2	6	507832	507837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_015067	TGG	2	6	508850	508855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015067	GTG	2	6	508877	508882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015067	GT	3	6	509664	509669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015067	TGG	2	6	509716	509721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015067	AGCG	2	8	509757	509764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_015067	CGC	2	6	513368	513373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_015067	TCAG	2	8	513435	513442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_015067	GCAG	2	8	517679	517686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_015067	CCT	2	6	518877	518882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_015067	TGT	2	6	531028	531033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015067	CGC	2	6	531048	531053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_015067	TCCC	2	8	532544	532551	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1536	NC_015067	TTC	2	6	532609	532614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_015067	GA	3	6	541057	541062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015067	CGA	2	6	541086	541091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_015067	GAC	2	6	541096	541101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_015067	GGGC	2	8	541178	541185	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_015067	GATG	2	8	542561	542568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015067	GGC	2	6	542572	542577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_015067	TC	3	6	542588	542593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_015067	ATG	2	6	542630	542635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015067	ATT	2	6	542652	542657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015067	TTC	2	6	542700	542705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_015067	TCA	2	6	542716	542721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_015067	GAA	2	6	542867	542872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015067	AGT	2	6	543649	543654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015067	CAGG	2	8	543668	543675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_015067	GC	3	6	543679	543684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_015067	CAA	2	6	543740	543745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_015067	CGC	2	6	544730	544735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_015067	CAGAG	2	10	544746	544755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1555	NC_015067	CAC	2	6	544757	544762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_015067	GAC	2	6	546650	546655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_015067	ACC	2	6	550924	550929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_015067	CGT	2	6	550986	550991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_015067	TCG	2	6	551042	551047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_015067	TCA	2	6	551165	551170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015067	CCG	2	6	551176	551181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_015067	T	6	6	551267	551272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015067	A	7	7	552749	552755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015067	CCGG	2	8	555102	555109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_015067	AGGC	2	8	555119	555126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_015067	CAA	2	6	555215	555220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015067	TGA	2	6	558499	558504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015067	GGTT	2	8	559936	559943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015067	AT	3	6	559950	559955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015067	TCG	2	6	560017	560022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_015067	GTTGC	2	10	560026	560035	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1572	NC_015067	AGG	2	6	560046	560051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015067	GA	3	6	560680	560685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015067	GTTC	2	8	561667	561674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_015067	GGT	2	6	561709	561714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015067	CCA	2	6	561729	561734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_015067	GCG	2	6	561751	561756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015067	TGTATA	2	12	561776	561787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015067	TTG	2	6	561813	561818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015067	GGC	2	6	561832	561837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_015067	AGA	3	9	561845	561853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015067	GA	4	8	561852	561859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015067	GTT	2	6	564775	564780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015067	TGA	2	6	564801	564806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015067	T	7	7	564819	564825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015067	GAA	2	6	564854	564859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015067	GGC	2	6	564921	564926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_015067	AAT	2	6	564947	564952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015067	ATG	2	6	569114	569119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015067	CTG	2	6	570101	570106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_015067	GAT	3	9	570123	570131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015067	TGG	2	6	571177	571182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015067	AGG	2	6	571219	571224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015067	TTG	2	6	571245	571250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015067	CCT	2	6	571266	571271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_015067	TG	3	6	571272	571277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015067	ATC	2	6	571345	571350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_015067	CTG	2	6	573462	573467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_015067	GGT	2	6	573517	573522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_015067	CGTGT	2	10	576432	576441	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1601	NC_015067	CGT	2	6	576512	576517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_015067	AAGG	2	8	576528	576535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015067	CAG	2	6	577906	577911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_015067	TCC	2	6	577915	577920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_015067	GC	3	6	578004	578009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_015067	GAA	2	6	578039	578044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015067	TAA	2	6	578051	578056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015067	ACT	2	6	578109	578114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_015067	GAC	2	6	578145	578150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_015067	GAG	2	6	578151	578156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015067	TGT	2	6	578168	578173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015067	CCG	2	6	578192	578197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_015067	AAGG	2	8	578209	578216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015067	AGAAC	2	10	578217	578226	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1615	NC_015067	TAC	2	6	581161	581166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_015067	ATG	2	6	581994	581999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015067	GGT	2	6	582006	582011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015067	GGC	2	6	582023	582028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_015067	ACA	2	6	582041	582046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015067	GAA	2	6	582056	582061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015067	AAGTA	2	10	583732	583741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015067	T	6	6	587194	587199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015067	CT	3	6	587206	587211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_015067	CGT	2	6	587258	587263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_015067	AGGG	2	8	587299	587306	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015067	GCC	2	6	587315	587320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_015067	TGT	3	9	587377	587385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015067	CG	3	6	587507	587512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_015067	AACGC	2	10	587627	587636	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1630	NC_015067	AACC	2	8	588774	588781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_015067	TGG	2	6	590033	590038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015067	CCA	2	6	590055	590060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_015067	CGG	2	6	590068	590073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_015067	A	6	6	590097	590102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015067	TC	3	6	591899	591904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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