MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 6533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015067	GCGG	2	8	142289	142296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
502	NC_015067	GGC	2	6	142324	142329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015067	GCC	2	6	142358	142363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_015067	AGG	2	6	142492	142497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015067	ATT	2	6	142544	142549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015067	ATG	2	6	142647	142652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015067	T	7	7	142659	142665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015067	CAA	2	6	142728	142733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015067	AAC	3	9	142745	142753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015067	CGCC	2	8	142775	142782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
511	NC_015067	AAAT	2	8	144354	144361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015067	GCC	2	6	145433	145438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_015067	CCG	2	6	145464	145469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_015067	GCG	2	6	145487	145492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015067	TGT	2	6	145499	145504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015067	GC	3	6	145506	145511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_015067	AAC	2	6	145529	145534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015067	GTT	2	6	145643	145648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015067	GCG	2	6	145821	145826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015067	ACT	2	6	145836	145841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015067	TTC	2	6	146912	146917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015067	GGT	2	6	147016	147021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015067	GCC	2	6	147041	147046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_015067	ATTC	2	8	147053	147060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_015067	CGG	2	6	147065	147070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015067	CCT	2	6	148916	148921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_015067	GGTTG	2	10	148938	148947	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015067	CTG	2	6	148965	148970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015067	TG	3	6	148969	148974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015067	ATG	2	6	148995	149000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015067	GGT	2	6	149054	149059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015067	GTC	3	9	150167	150175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015067	CTTG	2	8	152480	152487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_015067	GGTGTT	2	12	152645	152656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015067	CGG	2	6	152708	152713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_015067	TTCG	2	8	153017	153024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_015067	CGG	2	6	153042	153047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015067	GGC	2	6	153072	153077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015067	CCGG	2	8	155725	155732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_015067	CGC	2	6	155753	155758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_015067	CCA	2	6	155765	155770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_015067	ATC	2	6	155801	155806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015067	GCG	2	6	158415	158420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015067	GCC	2	6	158560	158565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_015067	GGC	2	6	158586	158591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015067	CTCG	2	8	158592	158599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_015067	CTGG	2	8	158638	158645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
548	NC_015067	TGA	2	6	158686	158691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015067	AC	3	6	159037	159042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_015067	CG	3	6	159058	159063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_015067	CCG	2	6	159064	159069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_015067	GC	3	6	159097	159102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_015067	CAC	2	6	159153	159158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_015067	GTCA	2	8	159171	159178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_015067	A	6	6	159186	159191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015067	GAC	2	6	159290	159295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015067	CA	3	6	159345	159350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_015067	CT	3	6	161932	161937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015067	AGG	2	6	163003	163008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015067	TGTT	2	8	163644	163651	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015067	TCT	2	6	163685	163690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015067	CTC	2	6	163824	163829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_015067	TCGGC	2	10	163833	163842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
564	NC_015067	GA	4	8	163859	163866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015067	GCA	2	6	167888	167893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015067	GCA	2	6	168788	168793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015067	TG	3	6	169537	169542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015067	TCG	2	6	170418	170423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015067	ACA	2	6	170488	170493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015067	GAC	2	6	170518	170523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015067	ACACC	2	10	170621	170630	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
572	NC_015067	CTA	2	6	170718	170723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015067	CCG	2	6	170728	170733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_015067	CTG	3	9	170950	170958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015067	GCGAT	2	10	171023	171032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
576	NC_015067	TGA	2	6	171044	171049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015067	GC	4	8	171089	171096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_015067	TGG	2	6	171106	171111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015067	ACGA	2	8	171145	171152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_015067	TCG	2	6	171314	171319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015067	TGG	2	6	172654	172659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015067	GGCT	2	8	172708	172715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_015067	CG	3	6	172811	172816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_015067	GGC	2	6	172827	172832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015067	CAG	2	6	172862	172867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015067	GCG	2	6	172922	172927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015067	CGA	2	6	172934	172939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_015067	CCG	2	6	172978	172983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_015067	GCT	2	6	173117	173122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015067	GC	3	6	173125	173130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_015067	CTTG	2	8	173186	173193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
592	NC_015067	TGT	2	6	173232	173237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015067	TGC	2	6	173240	173245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015067	TTG	2	6	173268	173273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015067	CGC	2	6	173308	173313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_015067	GCG	2	6	173324	173329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015067	GTC	2	6	173413	173418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015067	CTC	2	6	173467	173472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_015067	TGG	2	6	173493	173498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015067	CGG	2	6	173509	173514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015067	GCG	2	6	173520	173525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015067	TTG	2	6	173926	173931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015067	TGG	3	9	173974	173982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015067	CA	3	6	174110	174115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_015067	CCT	2	6	174152	174157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_015067	GGC	2	6	174490	174495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015067	GCC	2	6	174506	174511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015067	CCG	2	6	174535	174540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_015067	ATCGCC	2	12	174567	174578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
610	NC_015067	ATC	2	6	174677	174682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015067	CG	3	6	174683	174688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_015067	ACG	2	6	174739	174744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015067	CGA	2	6	174751	174756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015067	GGCT	2	8	174851	174858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
615	NC_015067	GGC	2	6	174860	174865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015067	CGA	2	6	176528	176533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015067	AGA	2	6	176544	176549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015067	GAG	2	6	176605	176610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015067	CCT	2	6	177254	177259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_015067	AAAG	2	8	177292	177299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015067	TAA	2	6	177304	177309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015067	AGGT	2	8	177427	177434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015067	TAG	2	6	177435	177440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015067	AAG	2	6	182306	182311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015067	AAC	2	6	182329	182334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015067	G	7	7	182465	182471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015067	TCG	3	9	182543	182551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015067	TGA	2	6	182803	182808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015067	TGG	2	6	182821	182826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015067	TGC	2	6	182833	182838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015067	AAAAGG	2	12	184321	184332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015067	GA	3	6	184362	184367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015067	GAA	3	9	184369	184377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015067	GGAT	2	8	184462	184469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015067	ACC	2	6	184486	184491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_015067	AAC	2	6	184515	184520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015067	TTGCGT	2	12	184588	184599	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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