MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 6533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015067	ACA	2	6	2241192	2241197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_015067	GCG	2	6	2241198	2241203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_015067	CCCAA	2	10	2241217	2241226	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6004	NC_015067	GCA	2	6	2241305	2241310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_015067	ACAG	2	8	2241363	2241370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_015067	CACAT	2	10	2241404	2241413	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6007	NC_015067	TTC	2	6	2241466	2241471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_015067	TCT	2	6	2241504	2241509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015067	CA	3	6	2241573	2241578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_015067	AGC	2	6	2241581	2241586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_015067	ACCGAC	2	12	2241592	2241603	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_015067	CGC	2	6	2241662	2241667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_015067	A	6	6	2242862	2242867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015067	GAG	2	6	2242876	2242881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015067	T	6	6	2242895	2242900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015067	GTTTTG	2	12	2247927	2247938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015067	TCCG	2	8	2247991	2247998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_015067	CTC	2	6	2254047	2254052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_015067	TCCT	2	8	2254061	2254068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_015067	CTT	2	6	2254079	2254084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_015067	ATC	2	6	2254101	2254106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_015067	TTCG	2	8	2254209	2254216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_015067	ACG	2	6	2254241	2254246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_015067	ACGA	2	8	2254263	2254270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_015067	CGA	2	6	2254372	2254377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_015067	CAA	2	6	2254491	2254496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_015067	CAT	2	6	2254508	2254513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_015067	TG	3	6	2254515	2254520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015067	TTG	2	6	2254531	2254536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015067	GGCC	2	8	2254654	2254661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_015067	ACC	2	6	2254796	2254801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_015067	CGC	2	6	2254919	2254924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_015067	CG	3	6	2258680	2258685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_015067	GTG	2	6	2258723	2258728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015067	CGT	2	6	2258784	2258789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_015067	GCT	2	6	2258851	2258856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_015067	GCC	2	6	2262265	2262270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_015067	TGA	2	6	2262274	2262279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015067	GAA	2	6	2262290	2262295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015067	AGGCGA	2	12	2262314	2262325	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6041	NC_015067	GCC	2	6	2262384	2262389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_015067	GA	3	6	2262405	2262410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015067	GCG	2	6	2262414	2262419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015067	CGC	2	6	2262473	2262478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_015067	TC	3	6	2262481	2262486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_015067	C	6	6	2262511	2262516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6047	NC_015067	G	6	6	2262525	2262530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_015067	AGC	2	6	2262543	2262548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_015067	TC	3	6	2265751	2265756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_015067	ATT	2	6	2265817	2265822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_015067	GAT	2	6	2265826	2265831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_015067	TA	3	6	2265873	2265878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015067	G	6	6	2265889	2265894	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015067	GCC	2	6	2265984	2265989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_015067	GA	3	6	2266072	2266077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015067	ACT	2	6	2266692	2266697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_015067	AGGG	2	8	2266723	2266730	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_015067	ACG	2	6	2266796	2266801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_015067	TCA	2	6	2266806	2266811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_015067	CGC	2	6	2266819	2266824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_015067	CTG	2	6	2266846	2266851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_015067	GAC	2	6	2266881	2266886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_015067	TCC	3	9	2268598	2268606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_015067	TCT	2	6	2268800	2268805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015067	TA	3	6	2268824	2268829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015067	CGC	2	6	2268889	2268894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_015067	ATCA	3	12	2268897	2268908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_015067	CA	3	6	2269994	2269999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_015067	CCA	2	6	2270007	2270012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_015067	AC	3	6	2270091	2270096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_015067	GT	3	6	2270098	2270103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015067	GTGC	2	8	2270114	2270121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_015067	T	6	6	2270129	2270134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015067	GCG	2	6	2270135	2270140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015067	GCG	2	6	2270172	2270177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_015067	CTT	2	6	2271677	2271682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_015067	ATC	2	6	2271716	2271721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_015067	CAA	2	6	2271738	2271743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_015067	A	7	7	2271853	2271859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015067	CAC	2	6	2271912	2271917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_015067	GCCC	2	8	2271929	2271936	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6082	NC_015067	GCA	3	9	2271937	2271945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_015067	CCA	2	6	2272724	2272729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_015067	GAT	2	6	2272753	2272758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_015067	GAT	2	6	2273172	2273177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_015067	CTGA	2	8	2273190	2273197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_015067	CA	3	6	2273271	2273276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_015067	GTC	2	6	2274153	2274158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_015067	CGA	2	6	2274174	2274179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_015067	TCA	2	6	2274203	2274208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_015067	CCG	2	6	2274238	2274243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_015067	CAA	2	6	2274256	2274261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_015067	CAAC	2	8	2274291	2274298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_015067	CAG	2	6	2274328	2274333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_015067	GTG	2	6	2274345	2274350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015067	CCGTTG	2	12	2274458	2274469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_015067	GT	3	6	2279490	2279495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_015067	AGC	2	6	2279515	2279520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_015067	TG	3	6	2279628	2279633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015067	GTG	2	6	2279897	2279902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015067	GTT	2	6	2279949	2279954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015067	GAT	2	6	2280283	2280288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015067	TGTT	2	8	2280303	2280310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_015067	GTC	2	6	2280363	2280368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_015067	GTGAT	2	10	2280380	2280389	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_015067	GCC	3	9	2280400	2280408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_015067	GCC	2	6	2280451	2280456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_015067	AAGGA	2	10	2280471	2280480	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015067	CG	4	8	2280541	2280548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_015067	GCG	2	6	2280557	2280562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_015067	CGC	2	6	2282018	2282023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_015067	CG	3	6	2282027	2282032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_015067	CCT	2	6	2283836	2283841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_015067	G	9	9	2283899	2283907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015067	CAG	2	6	2283919	2283924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_015067	G	6	6	2283928	2283933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015067	AGG	2	6	2283934	2283939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015067	CGCGC	2	10	2284004	2284013	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6119	NC_015067	TC	3	6	2284016	2284021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_015067	CGG	2	6	2284033	2284038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_015067	GGCC	2	8	2284039	2284046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_015067	GT	3	6	2284106	2284111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015067	GTG	2	6	2284185	2284190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015067	CGG	2	6	2284191	2284196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015067	GCC	2	6	2284296	2284301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_015067	TCT	2	6	2284307	2284312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_015067	GGC	2	6	2284348	2284353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_015067	AGG	2	6	2284437	2284442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_015067	CCT	2	6	2284734	2284739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_015067	ACG	2	6	2284782	2284787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_015067	CGA	2	6	2284862	2284867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_015067	CGT	2	6	2285018	2285023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015067	TGCACT	2	12	2285045	2285056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_015067	CG	3	6	2285223	2285228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6135	NC_015067	ACC	2	6	2285467	2285472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6136	NC_015067	GT	3	6	2285652	2285657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_015067	ACC	2	6	2285754	2285759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6138	NC_015067	GGC	2	6	2285779	2285784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_015067	CAT	2	6	2285850	2285855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_015067	ACC	2	6	2285920	2285925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6141	NC_015067	CGGC	2	8	2285930	2285937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6142	NC_015067	CTA	2	6	2285966	2285971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6143	NC_015067	CCCGGA	2	12	2286024	2286035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6144	NC_015067	GGC	2	6	2286061	2286066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6145	NC_015067	TC	3	6	2286205	2286210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6146	NC_015067	GGT	2	6	2286321	2286326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_015067	GCT	2	6	2286400	2286405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6148	NC_015067	CCT	2	6	2286416	2286421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6149	NC_015067	GAC	2	6	2286477	2286482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6150	NC_015067	CGA	3	9	2286503	2286511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6151	NC_015067	CCG	2	6	2286522	2286527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6152	NC_015067	GA	3	6	2286659	2286664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_015067	C	6	6	2286715	2286720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6154	NC_015067	TCC	2	6	2286745	2286750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6157	NC_015067	GCCG	2	8	2287208	2287215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6158	NC_015067	CG	3	6	2287253	2287258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6159	NC_015067	CAT	2	6	2287295	2287300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6160	NC_015067	TCGC	2	8	2287307	2287314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6161	NC_015067	ACT	2	6	2287316	2287321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6163	NC_015067	CGGT	2	8	2287403	2287410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6164	NC_015067	GGC	2	6	2287451	2287456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6168	NC_015067	GAC	2	6	2287586	2287591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6172	NC_015067	CGCCA	2	10	2287728	2287737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6173	NC_015067	CGGC	2	8	2287751	2287758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6174	NC_015067	ACG	2	6	2287767	2287772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6184	NC_015067	CGC	2	6	2288251	2288256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6210	NC_015067	CAAAA	2	10	2289533	2289542	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6212	NC_015067	AAGG	2	8	2289562	2289569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6218	NC_015067	CACC	2	8	2289715	2289722	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6226	NC_015067	GTG	2	6	2290362	2290367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6227	NC_015067	CGG	2	6	2290368	2290373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6238	NC_015067	ACC	2	6	2291644	2291649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6240	NC_015067	ACC	2	6	2291931	2291936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6242	NC_015067	CAT	2	6	2292027	2292032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6244	NC_015067	CGGC	2	8	2292107	2292114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6245	NC_015067	CTA	2	6	2292143	2292148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_015067	CCCGGA	2	12	2292201	2292212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6247	NC_015067	GGC	2	6	2292238	2292243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6248	NC_015067	TC	3	6	2292382	2292387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6249	NC_015067	GGT	2	6	2292498	2292503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_015067	GCT	2	6	2292577	2292582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_015067	CCT	2	6	2292593	2292598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6252	NC_015067	GAC	2	6	2292654	2292659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_015067	CGA	3	9	2292680	2292688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6254	NC_015067	CCG	2	6	2292699	2292704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6255	NC_015067	GA	3	6	2292836	2292841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_015067	C	6	6	2292892	2292897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6257	NC_015067	TCC	2	6	2292922	2292927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6258	NC_015067	ATC	2	6	2292966	2292971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_015067	CTCCC	2	10	2293155	2293164	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6260	NC_015067	GCCG	2	8	2293385	2293392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6261	NC_015067	CG	3	6	2293430	2293435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6262	NC_015067	CAT	2	6	2293472	2293477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6275	NC_015067	CGCCA	2	10	2293905	2293914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6276	NC_015067	CGGC	2	8	2293928	2293935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6286	NC_015067	TCCGC	2	10	2294416	2294425	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6375	NC_015067	TCGCT	2	10	2317290	2317299	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6391	NC_015067	GA	4	8	2325224	2325231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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