MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 6533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015067	ACC	2	6	2080046	2080051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_015067	GT	3	6	2080231	2080236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_015067	ACC	2	6	2080333	2080338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_015067	GGC	2	6	2080358	2080363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_015067	CAT	2	6	2080429	2080434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_015067	ACC	2	6	2080499	2080504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_015067	CGGC	2	8	2080509	2080516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_015067	CTA	2	6	2080545	2080550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015067	CCCGGA	2	12	2080603	2080614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_015067	GGC	2	6	2080640	2080645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_015067	TC	3	6	2080784	2080789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_015067	GGT	2	6	2080900	2080905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015067	GCT	2	6	2080979	2080984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_015067	CCT	2	6	2080995	2081000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_015067	GAC	2	6	2081056	2081061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_015067	CGA	3	9	2081082	2081090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_015067	CCG	2	6	2081101	2081106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_015067	GA	3	6	2081238	2081243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015067	C	6	6	2081294	2081299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5520	NC_015067	TCC	2	6	2081324	2081329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_015067	ATC	2	6	2081368	2081373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_015067	CTCCC	2	10	2081557	2081566	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5523	NC_015067	GCCG	2	8	2081787	2081794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_015067	CG	3	6	2081832	2081837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_015067	CAT	2	6	2081874	2081879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_015067	TCGC	2	8	2081886	2081893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_015067	ACT	2	6	2081895	2081900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_015067	C	6	6	2081951	2081956	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5529	NC_015067	CGGT	2	8	2081982	2081989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_015067	GGC	2	6	2082030	2082035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_015067	CCA	2	6	2082093	2082098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_015067	GCAA	2	8	2082108	2082115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_015067	CA	3	6	2082116	2082121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_015067	GAC	2	6	2082165	2082170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_015067	ATC	2	6	2082173	2082178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_015067	TTCGA	2	10	2082221	2082230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5537	NC_015067	CCA	2	6	2082296	2082301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_015067	CGGC	2	8	2082331	2082338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_015067	ACG	2	6	2082347	2082352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_015067	ACC	2	6	2082417	2082422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_015067	CACC	2	8	2082427	2082434	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5542	NC_015067	ACG	2	6	2082458	2082463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_015067	CGC	2	6	2082483	2082488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_015067	CG	3	6	2082504	2082509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_015067	AGG	2	6	2082555	2082560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_015067	TGC	2	6	2082670	2082675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_015067	GT	3	6	2082699	2082704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015067	TCCGC	2	10	2082819	2082828	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5549	NC_015067	CGC	2	6	2082831	2082836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_015067	ATG	2	6	2082894	2082899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_015067	TCC	2	6	2082920	2082925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_015067	CGG	2	6	2082936	2082941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_015067	CACGA	2	10	2083021	2083030	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5554	NC_015067	GAC	3	9	2083034	2083042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_015067	CAC	2	6	2083047	2083052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_015067	TTC	2	6	2083121	2083126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015067	CCG	2	6	2083154	2083159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_015067	CTC	2	6	2083338	2083343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_015067	TTC	2	6	2083385	2083390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_015067	GCCC	2	8	2083450	2083457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5561	NC_015067	CGA	2	6	2083506	2083511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_015067	AAT	2	6	2083536	2083541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_015067	GCT	2	6	2083576	2083581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_015067	ACTC	2	8	2083617	2083624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_015067	CTG	2	6	2083724	2083729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_015067	CCG	2	6	2083823	2083828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_015067	CCCAT	2	10	2083849	2083858	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5568	NC_015067	AGA	2	6	2083876	2083881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015067	ACC	2	6	2083911	2083916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_015067	GGTC	2	8	2083949	2083956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_015067	CAC	2	6	2083984	2083989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_015067	CAAG	2	8	2083990	2083997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_015067	CGC	2	6	2084034	2084039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_015067	A	7	7	2084075	2084081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_015067	CAAAA	2	10	2084113	2084122	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5576	NC_015067	AAGG	2	8	2084141	2084148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_015067	A	6	6	2084157	2084162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_015067	TCA	2	6	2084172	2084177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_015067	ACC	2	6	2084196	2084201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_015067	AGT	2	6	2084252	2084257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_015067	ACC	3	9	2084282	2084290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_015067	CCAG	2	8	2084294	2084301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_015067	ACCA	2	8	2084309	2084316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_015067	AGGA	2	8	2084318	2084325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_015067	CGC	2	6	2084329	2084334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_015067	TTC	2	6	2085798	2085803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_015067	CAT	2	6	2085854	2085859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_015067	ATT	2	6	2085875	2085880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_015067	GGTC	2	8	2085912	2085919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_015067	TCC	2	6	2085920	2085925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_015067	TGCTG	2	10	2085938	2085947	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5592	NC_015067	TCTCC	2	10	2085958	2085967	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5593	NC_015067	TAT	2	6	2085983	2085988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015067	ACA	2	6	2086003	2086008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_015067	GTT	2	6	2086949	2086954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_015067	GCT	2	6	2087220	2087225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_015067	ATT	2	6	2087228	2087233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_015067	GCGT	2	8	2087335	2087342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_015067	CG	4	8	2087423	2087430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_015067	A	6	6	2091583	2091588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015067	A	6	6	2091614	2091619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015067	ACC	2	6	2092298	2092303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_015067	AC	3	6	2092347	2092352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_015067	ACG	2	6	2095438	2095443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_015067	CAC	2	6	2095473	2095478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_015067	CGC	2	6	2095505	2095510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_015067	ACC	2	6	2095630	2095635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5608	NC_015067	TC	3	6	2095689	2095694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_015067	CTCCC	2	10	2095697	2095706	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5610	NC_015067	AGGG	2	8	2095727	2095734	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_015067	AG	3	6	2095740	2095745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_015067	GCG	2	6	2096975	2096980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_015067	CACT	2	8	2096990	2096997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_015067	GGA	2	6	2097053	2097058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_015067	GC	3	6	2098041	2098046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_015067	GTT	2	6	2098146	2098151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015067	CTC	2	6	2100795	2100800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_015067	GCATT	2	10	2100870	2100879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5619	NC_015067	CGAA	2	8	2102380	2102387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_015067	GGT	2	6	2102399	2102404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_015067	ACC	2	6	2102422	2102427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_015067	GCG	2	6	2102440	2102445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_015067	GTT	2	6	2103594	2103599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_015067	TCA	2	6	2103618	2103623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_015067	TCA	2	6	2103663	2103668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_015067	ATT	2	6	2105052	2105057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_015067	CAG	2	6	2105063	2105068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_015067	TCA	2	6	2105080	2105085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_015067	TAT	2	6	2105105	2105110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_015067	CGGC	2	8	2106729	2106736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5631	NC_015067	TGC	2	6	2108672	2108677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_015067	CTG	2	6	2108680	2108685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_015067	CA	3	6	2108697	2108702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5634	NC_015067	GTCG	2	8	2108782	2108789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5635	NC_015067	GC	3	6	2110781	2110786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5641	NC_015067	C	6	6	2114638	2114643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5645	NC_015067	GA	3	6	2116169	2116174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5654	NC_015067	AGA	2	6	2117634	2117639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5664	NC_015067	CG	3	6	2120118	2120123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5672	NC_015067	GTT	2	6	2122829	2122834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5742	NC_015067	GCATT	2	10	2146010	2146019	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5754	NC_015067	GATAG	2	10	2151899	2151908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5755	NC_015067	ATA	2	6	2154962	2154967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5756	NC_015067	AGC	2	6	2154982	2154987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5758	NC_015067	A	7	7	2155075	2155081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5759	NC_015067	GTA	2	6	2155084	2155089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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