MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015052	CGGAAA	2	12	97231	97242	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015052	TATTGT	2	12	98672	98683	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015052	AGGCGA	2	12	126756	126767	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015052	GGTGTT	2	12	137295	137306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015052	AAAAGG	2	12	169116	169127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015052	GCCGGT	2	12	207520	207531	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015052	ATGGCT	2	12	279406	279417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015052	CGGAGT	2	12	308878	308889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015052	GCTGGT	2	12	323656	323667	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015052	TTCGAG	2	12	354767	354778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015052	CTTTGT	2	12	372237	372248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015052	CAAGGA	2	12	374528	374539	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015052	CTAAGC	2	12	380471	380482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015052	ATATGT	2	12	410484	410495	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015052	GTTTCG	2	12	422866	422877	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015052	CGCCTT	2	12	428644	428655	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015052	CGCCTT	2	12	430365	430376	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015052	TGACGT	2	12	439016	439027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015052	ACGTTA	2	12	491855	491866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015052	CCCCGC	2	12	620187	620198	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
21	NC_015052	AGGGGC	2	12	641735	641746	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015052	GGATAT	2	12	693626	693637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015052	CAAATA	2	12	696674	696685	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015052	GGCGAA	2	12	696686	696697	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015052	CATATT	2	12	778274	778285	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015052	ATTGGC	2	12	809467	809478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015052	AACACA	2	12	820870	820881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015052	AGGCGA	2	12	823818	823829	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015052	TTGGCC	2	12	855869	855880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015052	ATCACG	2	12	860661	860672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015052	CCGGGC	2	12	860822	860833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015052	CCAAAA	2	12	917104	917115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015052	AGCGAG	2	12	933312	933323	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015052	TGACCG	2	12	954257	954268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015052	AAAATC	2	12	1005945	1005956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015052	AAACCG	2	12	1015475	1015486	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015052	CAAAAA	2	12	1022114	1022125	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015052	TCGAAC	2	12	1034050	1034061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015052	TTTCTC	2	12	1039288	1039299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015052	TCGGAC	2	12	1048689	1048700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015052	ACCTTG	2	12	1057084	1057095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015052	GTGACG	2	12	1065935	1065946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015052	TCGACG	2	12	1082189	1082200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015052	ATGGGC	2	12	1084774	1084785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015052	ACGGGG	2	12	1111298	1111309	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015052	TGTCGT	2	12	1140242	1140253	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015052	ACCCGT	2	12	1224903	1224914	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015052	AGTGTG	2	12	1303964	1303975	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015052	AAAACC	2	12	1325264	1325275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015052	GCCGAT	2	12	1330662	1330673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015052	CCCGCG	2	12	1333615	1333626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015052	GGGAAA	2	12	1369621	1369632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015052	GGTACG	2	12	1439980	1439991	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015052	AGCCCA	2	12	1494894	1494905	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015052	GTTCCG	2	12	1526753	1526764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015052	TGCACT	2	12	1578555	1578566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015052	CCCGGA	2	12	1579534	1579545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015052	TCTTCC	2	12	1588159	1588170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015052	TCAGCA	2	12	1594657	1594668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015052	GCCTGA	2	12	1603324	1603335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015052	GTTGCG	2	12	1611246	1611257	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015052	TTCGCC	2	12	1617533	1617544	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015052	TCGCCT	2	12	1621185	1621196	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015052	TCGGCC	2	12	1621324	1621335	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015052	CTCCTG	2	12	1630791	1630802	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015052	TTCAAA	2	12	1660366	1660377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015052	TCGACA	2	12	1671426	1671437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015052	ACATTC	2	12	1713868	1713879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015052	TCGTAT	2	12	1720225	1720236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015052	CCGAAG	2	12	1721804	1721815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015052	AGAAGC	2	12	1755413	1755424	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015052	CTTGAG	2	12	1765728	1765739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015052	ATTGTC	2	12	1786562	1786573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015052	ATTCCT	2	12	1847165	1847176	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015052	CAATAT	2	12	1851339	1851350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015052	ATTTCA	2	12	1858200	1858211	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015052	GAGGCA	2	12	1890205	1890216	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015052	CGGCAC	2	12	1908711	1908722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015052	CGGCAT	2	12	1916326	1916337	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015052	GGCACC	2	12	1949595	1949606	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015052	GCGCGA	2	12	2008825	2008836	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015052	CAAAAA	2	12	2013100	2013111	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015052	TTCGCC	2	12	2013552	2013563	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015052	ACACAA	2	12	2041628	2041639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015052	CCTCGT	2	12	2069290	2069301	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015052	ATCACG	2	12	2088779	2088790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015052	TCATCC	2	12	2091924	2091935	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015052	AACGCC	2	12	2098009	2098020	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015052	AAATCG	2	12	2111649	2111660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015052	GGGCCG	2	12	2121186	2121197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015052	TGCACT	2	12	2122115	2122126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015052	CCCGGA	2	12	2123094	2123105	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015052	GCCGCT	2	12	2172218	2172229	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015052	GTGTCC	2	12	2234616	2234627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015052	CCGTTG	2	12	2283494	2283505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015052	TGCACT	2	12	2291546	2291557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015052	CCCGGA	2	12	2292525	2292536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015052	AACACA	2	12	2299124	2299135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015052	TGCACT	2	12	2300184	2300195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015052	CCCGGA	2	12	2301163	2301174	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015052	CGACGG	2	12	2309829	2309840	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015052	CCAGCG	2	12	2314135	2314146	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015052	CCGGTC	2	12	2337615	2337626	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015052	ACATTG	2	12	2345696	2345707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.