MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 6575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015052	CAC	2	6	1304862	1304867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_015052	TCC	2	6	1307451	1307456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_015052	AG	3	6	1307473	1307478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015052	GAG	2	6	1307487	1307492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_015052	CA	3	6	1309081	1309086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_015052	GCA	2	6	1309120	1309125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_015052	CG	3	6	1310555	1310560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_015052	GGCT	2	8	1310578	1310585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_015052	TGC	2	6	1310597	1310602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_015052	TCC	2	6	1312260	1312265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_015052	AAT	2	6	1312271	1312276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015052	CGC	2	6	1312294	1312299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_015052	GCA	2	6	1312320	1312325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_015052	TCC	2	6	1312326	1312331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_015052	CGG	2	6	1312913	1312918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_015052	CGGA	2	8	1313007	1313014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_015052	AGG	2	6	1313028	1313033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015052	CGG	2	6	1313034	1313039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_015052	CGT	2	6	1313043	1313048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_015052	CTGC	2	8	1313085	1313092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_015052	GC	3	6	1313098	1313103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_015052	GGC	2	6	1313112	1313117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_015052	CAA	2	6	1313304	1313309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_015052	CGT	2	6	1316305	1316310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_015052	CGC	2	6	1317182	1317187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_015052	GTG	2	6	1317235	1317240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_015052	GTC	2	6	1318209	1318214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_015052	GGC	2	6	1319231	1319236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_015052	CCA	2	6	1320541	1320546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_015052	TGAT	2	8	1320979	1320986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_015052	ATGCC	2	10	1321105	1321114	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3532	NC_015052	CA	3	6	1321131	1321136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_015052	CA	3	6	1321142	1321147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_015052	GA	3	6	1321203	1321208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_015052	ATGG	2	8	1322195	1322202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_015052	CTG	2	6	1322347	1322352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_015052	CGT	2	6	1322355	1322360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_015052	GTT	2	6	1322386	1322391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_015052	AGC	2	6	1323547	1323552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_015052	GGC	2	6	1323556	1323561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_015052	ACC	3	9	1323763	1323771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_015052	ATG	2	6	1323781	1323786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015052	CGA	2	6	1323806	1323811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_015052	GCA	2	6	1325193	1325198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_015052	TA	3	6	1325214	1325219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_015052	AAAACC	2	12	1325264	1325275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_015052	A	6	6	1325431	1325436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_015052	TCG	2	6	1325894	1325899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_015052	ACA	2	6	1325903	1325908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_015052	AAT	2	6	1325976	1325981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015052	GAA	2	6	1326001	1326006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_015052	A	6	6	1326950	1326955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_015052	AGT	2	6	1327046	1327051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015052	CCG	3	9	1328458	1328466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_015052	TCA	2	6	1329184	1329189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_015052	CTG	2	6	1329293	1329298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_015052	T	6	6	1329344	1329349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_015052	ACA	2	6	1329357	1329362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_015052	GTG	2	6	1329365	1329370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_015052	TCC	3	9	1329385	1329393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_015052	CTC	2	6	1329406	1329411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_015052	CGGCC	2	10	1329444	1329453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3563	NC_015052	CGGG	2	8	1329508	1329515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_015052	TGG	2	6	1329532	1329537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015052	CG	3	6	1329562	1329567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_015052	TCG	2	6	1329697	1329702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_015052	AAAT	2	8	1329710	1329717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_015052	CCTT	2	8	1330094	1330101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_015052	CT	3	6	1330102	1330107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_015052	CCT	2	6	1330529	1330534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_015052	GCCGAT	2	12	1330662	1330673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_015052	TCG	2	6	1330680	1330685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_015052	CTG	2	6	1330694	1330699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_015052	CG	3	6	1333530	1333535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_015052	TCA	3	9	1333602	1333610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_015052	CCCGCG	2	12	1333615	1333626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_015052	GCTCC	2	10	1333649	1333658	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3578	NC_015052	TCC	2	6	1333704	1333709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_015052	CG	3	6	1333712	1333717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_015052	CGG	2	6	1333767	1333772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_015052	GCC	2	6	1334494	1334499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_015052	GCG	2	6	1334512	1334517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_015052	CGG	2	6	1334522	1334527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015052	GAC	2	6	1334534	1334539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_015052	CG	3	6	1334650	1334655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_015052	CCGG	2	8	1334678	1334685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_015052	ACC	2	6	1334777	1334782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_015052	AGG	2	6	1335120	1335125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_015052	TCA	2	6	1335409	1335414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015052	CCA	2	6	1335463	1335468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_015052	T	6	6	1335489	1335494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_015052	ACG	2	6	1335548	1335553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015052	ATC	2	6	1335621	1335626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015052	CAAT	2	8	1335667	1335674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_015052	AG	3	6	1335829	1335834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_015052	GCA	2	6	1335851	1335856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_015052	GAG	2	6	1335929	1335934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015052	CG	3	6	1335976	1335981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_015052	ACA	2	6	1337881	1337886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_015052	GAAA	2	8	1340931	1340938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_015052	GAG	3	9	1341024	1341032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015052	CGG	2	6	1341052	1341057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_015052	GAC	2	6	1341126	1341131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_015052	GCC	2	6	1341141	1341146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_015052	CGC	2	6	1341206	1341211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_015052	GCC	2	6	1341234	1341239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_015052	CGC	2	6	1341256	1341261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_015052	CA	3	6	1341281	1341286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_015052	TCC	2	6	1341288	1341293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_015052	ACA	2	6	1341304	1341309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_015052	AAGGA	2	10	1341312	1341321	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_015052	ACG	2	6	1341322	1341327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_015052	GC	4	8	1341782	1341789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_015052	CG	3	6	1341822	1341827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_015052	CGA	2	6	1341860	1341865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_015052	AGC	2	6	1341880	1341885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_015052	CGA	4	12	1341986	1341997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_015052	GC	4	8	1342008	1342015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_015052	CTA	2	6	1342031	1342036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_015052	CACC	2	8	1348586	1348593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3621	NC_015052	GCG	2	6	1348601	1348606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_015052	CG	3	6	1348605	1348610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_015052	CGC	2	6	1348619	1348624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_015052	AGG	2	6	1348646	1348651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_015052	GGA	2	6	1348665	1348670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015052	AAC	2	6	1349243	1349248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_015052	TC	3	6	1351698	1351703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_015052	A	6	6	1351704	1351709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_015052	GCT	3	9	1351799	1351807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_015052	TGAT	2	8	1351842	1351849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_015052	C	6	6	1351878	1351883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3764	NC_015052	GT	3	6	1403981	1403986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3890	NC_015052	CCTG	2	8	1476983	1476990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3893	NC_015052	ATG	2	6	1477821	1477826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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