MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 6575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015052	TGA	2	6	358598	358603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015052	GC	3	6	358717	358722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_015052	AATGC	2	10	359794	359803	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_015052	AC	3	6	359836	359841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_015052	T	7	7	359860	359866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015052	AGCA	2	8	359885	359892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_015052	CA	3	6	359904	359909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_015052	TCCA	2	8	359948	359955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_015052	ATG	2	6	363072	363077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015052	CACG	2	8	363082	363089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_015052	AC	3	6	366419	366424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_015052	CGTC	2	8	367161	367168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_015052	GAA	2	6	367187	367192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015052	GCCG	2	8	370931	370938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_015052	TTA	2	6	370984	370989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015052	ATTGC	2	10	371022	371031	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1017	NC_015052	AAAG	2	8	371085	371092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015052	CTTTGT	2	12	372237	372248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1019	NC_015052	T	6	6	372281	372286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015052	GGT	2	6	372296	372301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015052	GA	3	6	372355	372360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015052	CT	3	6	373611	373616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_015052	CGG	2	6	373663	373668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015052	GCTC	2	8	374501	374508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_015052	CAAGGA	2	12	374528	374539	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1026	NC_015052	GTC	2	6	374600	374605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015052	TTGG	2	8	376019	376026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015052	CA	3	6	376053	376058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_015052	CA	3	6	376061	376066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_015052	CG	3	6	376086	376091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_015052	CAG	2	6	376126	376131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015052	GGC	2	6	376924	376929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015052	T	7	7	376942	376948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015052	CGC	2	6	376977	376982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_015052	TCT	2	6	377044	377049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015052	ACC	2	6	377080	377085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_015052	GCC	2	6	377127	377132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_015052	TAA	2	6	377159	377164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015052	TGGAC	2	10	378325	378334	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_015052	GTA	3	9	378356	378364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015052	CGC	2	6	378373	378378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015052	CAC	2	6	378468	378473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_015052	ACC	2	6	378488	378493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_015052	TA	3	6	378495	378500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015052	CTAAGC	2	12	380471	380482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015052	GC	3	6	381304	381309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_015052	CGC	2	6	381347	381352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_015052	TAT	2	6	381392	381397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015052	GAGC	2	8	381411	381418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_015052	GCG	2	6	381440	381445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015052	TCGA	2	8	381460	381467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_015052	CGG	2	6	381476	381481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015052	ACAAG	2	10	381492	381501	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_015052	TGA	2	6	381522	381527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015052	TCT	2	6	381529	381534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015052	GAA	2	6	381553	381558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015052	GCC	2	6	382193	382198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_015052	AG	3	6	382220	382225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015052	AGT	2	6	385497	385502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015052	CGG	2	6	386589	386594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015052	GTCCG	2	10	386597	386606	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1062	NC_015052	TGGA	2	8	386617	386624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015052	G	6	6	386671	386676	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015052	C	6	6	386693	386698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1065	NC_015052	CG	5	10	388173	388182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_015052	TAT	2	6	388194	388199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015052	GTG	2	6	388243	388248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015052	GCC	2	6	391154	391159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_015052	GAC	2	6	391183	391188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015052	GTA	2	6	391210	391215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015052	TGCCG	2	10	391246	391255	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_015052	T	6	6	391318	391323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015052	AAGG	2	8	391427	391434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015052	TGA	2	6	394073	394078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015052	ACA	2	6	394129	394134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015052	CCACA	2	10	394241	394250	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1077	NC_015052	GCC	2	6	394975	394980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_015052	CCT	2	6	398056	398061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_015052	TTGC	2	8	398099	398106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_015052	TGA	2	6	398115	398120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015052	A	6	6	398135	398140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015052	CAT	2	6	398151	398156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015052	TCTCC	2	10	398766	398775	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1084	NC_015052	TCG	2	6	400857	400862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015052	TTG	2	6	401635	401640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015052	TGTGT	6	30	401664	401693	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015052	TGCGA	2	10	401698	401707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_015052	TTCA	2	8	401765	401772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_015052	TTCG	2	8	402000	402007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_015052	GC	3	6	402066	402071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_015052	GTG	2	6	404209	404214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015052	TGC	2	6	404222	404227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_015052	TTG	2	6	404238	404243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015052	GT	3	6	404264	404269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015052	CGT	2	6	404297	404302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_015052	GT	3	6	404358	404363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015052	ACG	2	6	404403	404408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015052	ATG	2	6	404416	404421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015052	AAG	2	6	404451	404456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015052	GGT	2	6	404758	404763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015052	GTC	2	6	405960	405965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015052	CAC	2	6	407340	407345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_015052	GCA	2	6	408717	408722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015052	GCT	2	6	408725	408730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_015052	CTGT	2	8	408850	408857	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_015052	CTGT	2	8	408864	408871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_015052	CGC	2	6	408892	408897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_015052	CGG	2	6	409035	409040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015052	CAA	2	6	410365	410370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015052	ACC	2	6	410416	410421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015052	C	7	7	410433	410439	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_015052	T	9	9	410443	410451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015052	G	15	15	410452	410466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015052	ATATGT	2	12	410484	410495	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015052	TGT	2	6	410519	410524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015052	GAA	2	6	410591	410596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015052	CGA	2	6	410664	410669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015052	AAACC	2	10	410681	410690	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1119	NC_015052	GGA	2	6	410913	410918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015052	GAA	2	6	410978	410983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015052	ATCGT	2	10	411040	411049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_015052	ATG	2	6	411066	411071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015052	TGA	2	6	411081	411086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015052	ATG	2	6	411139	411144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015052	CGG	2	6	411151	411156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015052	GCG	2	6	411176	411181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015052	TGAA	2	8	411271	411278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015052	TGT	2	6	411376	411381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015052	TGT	2	6	411478	411483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015052	CCT	2	6	411501	411506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_015052	TCGT	2	8	411603	411610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_015052	TCC	2	6	411719	411724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015052	TGGA	2	8	411739	411746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015052	TGG	2	6	411747	411752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015052	GGAT	2	8	412011	412018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015052	TGA	2	6	412051	412056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_015052	GTC	2	6	413676	413681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1140	NC_015052	CTT	2	6	413827	413832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_015052	GTGGC	2	10	413911	413920	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1146	NC_015052	TCG	2	6	414063	414068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1159	NC_015052	GACC	2	8	419527	419534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1171	NC_015052	TGG	2	6	421756	421761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_015052	CG	3	6	421825	421830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1173	NC_015052	GCTGT	2	10	421837	421846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1174	NC_015052	TGG	2	6	421848	421853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1268	NC_015052	GAG	2	6	444065	444070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_015052	GTT	2	6	444160	444165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1404	NC_015052	T	6	6	485650	485655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_015052	ATT	2	6	485706	485711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_015052	TAA	2	6	485809	485814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_015052	TTG	2	6	485815	485820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_015052	TA	3	6	485832	485837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_015052	TTCCT	2	10	500833	500842	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

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