MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 6575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015052	G	7	7	167258	167264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015052	TCG	3	9	167337	167345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015052	GAA	2	6	167415	167420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015052	CGC	2	6	167497	167502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_015052	CATCT	2	10	167553	167562	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
506	NC_015052	TGA	2	6	167598	167603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015052	TGG	2	6	167616	167621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015052	TGC	2	6	167628	167633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015052	AAAAGG	2	12	169116	169127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015052	GA	3	6	169157	169162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015052	GAA	3	9	169164	169172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015052	GGAT	2	8	169258	169265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015052	GCC	2	6	169269	169274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_015052	AAC	2	6	169311	169316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015052	TTG	2	6	169381	169386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015052	AGA	2	6	169421	169426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015052	GTAA	2	8	170229	170236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015052	CAAG	2	8	170240	170247	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015052	TA	3	6	170850	170855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015052	CGA	2	6	170856	170861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015052	CCT	2	6	170866	170871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_015052	TTAC	2	8	172035	172042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_015052	AAC	2	6	172100	172105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015052	TGG	2	6	172124	172129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015052	GCG	2	6	174397	174402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015052	CG	3	6	174410	174415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_015052	GTT	2	6	174468	174473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015052	CGT	2	6	174556	174561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015052	CGG	2	6	174610	174615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015052	CGA	2	6	174692	174697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015052	GAC	2	6	174741	174746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015052	CGC	2	6	174788	174793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_015052	TGG	2	6	174813	174818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015052	GCC	2	6	174993	174998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_015052	CGC	2	6	175008	175013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_015052	AGG	2	6	175052	175057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015052	TTG	2	6	177029	177034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015052	TTC	2	6	179274	179279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015052	CCT	2	6	179356	179361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015052	ACG	2	6	179435	179440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015052	AAG	2	6	179446	179451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015052	CTT	2	6	179556	179561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015052	TGC	2	6	179564	179569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015052	GC	3	6	179614	179619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015052	CGCTG	2	10	179631	179640	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
546	NC_015052	GCA	2	6	179715	179720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015052	CGG	2	6	181021	181026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015052	TAT	2	6	181055	181060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015052	CGT	2	6	181072	181077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015052	GT	3	6	181076	181081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015052	ATT	2	6	184199	184204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015052	CTG	2	6	184277	184282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015052	CCG	2	6	184319	184324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_015052	C	6	6	186254	186259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
555	NC_015052	TGA	2	6	186262	186267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015052	GA	3	6	186299	186304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015052	CA	3	6	186332	186337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_015052	ACTG	2	8	186950	186957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_015052	GGGT	2	8	186959	186966	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015052	ACC	2	6	186976	186981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015052	TCG	2	6	186994	186999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015052	CAA	2	6	187029	187034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015052	C	8	8	188670	188677	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
564	NC_015052	GGC	3	9	188758	188766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015052	GCC	2	6	188768	188773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015052	CCA	2	6	188774	188779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_015052	CAT	2	6	188791	188796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_015052	TGAGG	2	10	190343	190352	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015052	TAG	2	6	190500	190505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015052	CGG	2	6	190556	190561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015052	CTGA	2	8	190609	190616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_015052	AGC	2	6	190699	190704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015052	TGC	2	6	190707	190712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_015052	TGG	2	6	190721	190726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015052	TCC	2	6	191081	191086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015052	GCT	2	6	191120	191125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015052	GCT	2	6	191153	191158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015052	ATT	2	6	191193	191198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015052	AT	3	6	191213	191218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015052	AAC	2	6	191270	191275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015052	ATG	2	6	193390	193395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015052	TGT	2	6	193396	193401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015052	CT	3	6	194245	194250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_015052	TGC	2	6	194349	194354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015052	GTG	2	6	194407	194412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015052	TCC	2	6	195436	195441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_015052	ATA	2	6	196399	196404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015052	ATG	2	6	196416	196421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015052	TCA	2	6	196448	196453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015052	CTT	2	6	196468	196473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015052	CAT	2	6	197709	197714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015052	TTC	2	6	197716	197721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015052	CAA	2	6	197742	197747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015052	AAT	2	6	197756	197761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015052	ATCG	2	8	197834	197841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_015052	TTTTC	2	10	198066	198075	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
597	NC_015052	AAAAG	2	10	198092	198101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015052	GGCA	2	8	198107	198114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_015052	GAT	2	6	198147	198152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015052	CGC	2	6	198200	198205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_015052	GC	4	8	198211	198218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_015052	TTCC	2	8	199763	199770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_015052	TGA	2	6	199845	199850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015052	GGT	2	6	199957	199962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015052	GCG	2	6	200004	200009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015052	CGCT	2	8	200047	200054	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
607	NC_015052	TCA	2	6	200149	200154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015052	TCA	2	6	200172	200177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015052	TCA	2	6	200219	200224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015052	CG	3	6	200261	200266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_015052	AGC	2	6	200332	200337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015052	ACG	2	6	200429	200434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015052	AAC	2	6	200435	200440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015052	GCCAA	2	10	200457	200466	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
615	NC_015052	T	6	6	200567	200572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015052	GT	3	6	200648	200653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015052	GTC	2	6	201194	201199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015052	GGC	2	6	201223	201228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015052	TGC	2	6	201253	201258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015052	TGC	3	9	201264	201272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015052	ATTG	2	8	201273	201280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015052	T	7	7	201308	201314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015052	GAT	2	6	201341	201346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015052	AAC	2	6	201368	201373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015052	TCAC	2	8	201400	201407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_015052	CTT	2	6	201472	201477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015052	TTC	2	6	201510	201515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015052	GAA	2	6	201519	201524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015052	GAA	2	6	201542	201547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015052	TTA	2	6	207509	207514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015052	GCCGGT	2	12	207520	207531	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015052	GCCG	2	8	207546	207553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_015052	GT	3	6	208457	208462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015052	GTGC	2	8	208504	208511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_015052	CAA	2	6	208845	208850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015052	TGT	2	6	209000	209005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015052	GTC	2	6	209029	209034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_015052	TCC	2	6	211644	211649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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770	NC_015052	CA	3	6	269567	269572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
771	NC_015052	CAT	2	6	269594	269599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_015052	AGC	2	6	269765	269770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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774	NC_015052	T	6	6	269850	269855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_015052	GCATT	2	10	271908	271917	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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914	NC_015052	GC	3	6	328051	328056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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916	NC_015052	CG	3	6	328107	328112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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947	NC_015052	TGG	2	6	340031	340036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
948	NC_015052	ATG	2	6	340086	340091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
949	NC_015052	GC	3	6	340147	340152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
950	NC_015052	GCT	2	6	340255	340260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
951	NC_015052	TGA	2	6	340291	340296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
952	NC_015052	CG	4	8	340342	340349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
953	NC_015052	GGGA	2	8	340395	340402	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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959	NC_015052	TGC	2	6	340834	340839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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962	NC_015052	CGG	2	6	342234	342239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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978	NC_015052	TTG	2	6	347081	347086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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981	NC_015052	CCA	2	6	348619	348624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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991	NC_015052	CGCA	2	8	353037	353044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
992	NC_015052	ACT	2	6	354734	354739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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996	NC_015052	GC	3	6	356291	356296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
997	NC_015052	TTG	2	6	356417	356422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
998	NC_015052	ATA	2	6	356527	356532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
999	NC_015052	CGTTC	2	10	356562	356571	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1000	NC_015052	CTT	2	6	358017	358022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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