MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 6575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015052	ATT	2	6	2387397	2387402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_015052	GCC	2	6	2387415	2387420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_015052	ATC	2	6	2387487	2387492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_015052	TCG	2	6	2387494	2387499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_015052	ATTT	2	8	2387705	2387712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_015052	AATTC	2	10	2387763	2387772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6507	NC_015052	TCAT	2	8	2387778	2387785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_015052	CCA	2	6	2387812	2387817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_015052	GAT	2	6	2387828	2387833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_015052	GCT	2	6	2387842	2387847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_015052	AAT	2	6	2387929	2387934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_015052	TGG	2	6	2387944	2387949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_015052	CGA	2	6	2387974	2387979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_015052	CAC	2	6	2387989	2387994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_015052	ACC	2	6	2388008	2388013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_015052	TCA	2	6	2388094	2388099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_015052	GCC	2	6	2388135	2388140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_015052	CTTT	2	8	2389517	2389524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6519	NC_015052	AGC	2	6	2389531	2389536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_015052	CTTG	2	8	2389564	2389571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6521	NC_015052	TGAC	2	8	2389600	2389607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_015052	AAT	2	6	2389609	2389614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_015052	GAT	2	6	2389618	2389623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_015052	CGA	2	6	2389626	2389631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_015052	AAT	2	6	2389636	2389641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_015052	CG	3	6	2389665	2389670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_015052	TGA	2	6	2389698	2389703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_015052	AGC	2	6	2389762	2389767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_015052	AGC	2	6	2389795	2389800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_015052	TA	3	6	2389908	2389913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_015052	CAA	2	6	2389921	2389926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_015052	CGG	2	6	2389958	2389963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_015052	ATT	2	6	2390046	2390051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_015052	TCG	2	6	2390056	2390061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_015052	ATC	2	6	2390064	2390069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_015052	ATT	2	6	2390073	2390078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_015052	GTCA	2	8	2390080	2390087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_015052	CAAG	2	8	2390116	2390123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6539	NC_015052	AGAA	2	8	2390161	2390168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_015052	ATC	2	6	2390220	2390225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_015052	TTC	2	6	2390237	2390242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_015052	TCA	2	6	2390265	2390270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_015052	GA	3	6	2390386	2390391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_015052	CTG	2	6	2391334	2391339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_015052	GAT	3	9	2391356	2391364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_015052	GTT	2	6	2392496	2392501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_015052	TTTG	2	8	2393825	2393832	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_015052	GAC	2	6	2393852	2393857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_015052	TTCA	2	8	2393870	2393877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_015052	CAA	2	6	2393896	2393901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_015052	TG	3	6	2393930	2393935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_015052	TCC	2	6	2393944	2393949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_015052	AAT	2	6	2394057	2394062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_015052	ACA	2	6	2394070	2394075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_015052	CTC	2	6	2396428	2396433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6556	NC_015052	ATG	2	6	2396475	2396480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_015052	TCA	2	6	2396592	2396597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_015052	ACG	2	6	2397403	2397408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_015052	GAC	2	6	2397443	2397448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_015052	A	7	7	2397474	2397480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_015052	TA	3	6	2399106	2399111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_015052	CT	3	6	2399166	2399171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_015052	A	6	6	2399234	2399239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_015052	TCG	2	6	2399260	2399265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_015052	CGGC	2	8	2399283	2399290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_015052	ATA	2	6	2399379	2399384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_015052	CAA	2	6	2399389	2399394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_015052	GT	3	6	2399399	2399404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_015052	ATC	2	6	2399443	2399448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_015052	AAG	2	6	2399459	2399464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_015052	ACGG	2	8	2400091	2400098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_015052	CGG	2	6	2400151	2400156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_015052	ACCA	2	8	2400160	2400167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_015052	TGTT	2	8	2400198	2400205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_015052	TGT	2	6	2400274	2400279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.