MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis BSn5 chromosome

Total Repeats: 482

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014976	ACTTT	2	10	1459	1468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014976	AGTTC	2	10	10301	10310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014976	TGAAA	2	10	11546	11555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014976	TCCAT	2	10	16490	16499	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014976	TTCCT	2	10	19303	19312	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014976	TTATT	2	10	25213	25222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014976	TGCTT	2	10	26730	26739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014976	AATTT	2	10	27446	27455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014976	ATGGT	2	10	27472	27481	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014976	AAAAC	2	10	27530	27539	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014976	TTTTG	2	10	41006	41015	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014976	AAATG	2	10	47958	47967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014976	TAAAA	2	10	48776	48785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014976	TATAT	2	10	49032	49041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014976	AAATT	2	10	49092	49101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014976	AGTAT	2	10	50406	50415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014976	AATGT	2	10	52605	52614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014976	TGATC	2	10	52626	52635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014976	TGATT	2	10	56703	56712	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014976	CGAGG	2	10	59357	59366	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014976	CAGTC	2	10	116955	116964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014976	ATGTG	2	10	119699	119708	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014976	ATGTC	2	10	122198	122207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014976	GATAT	2	10	123193	123202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014976	TATGA	2	10	123525	123534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014976	TGTAC	2	10	126852	126861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014976	TAACA	2	10	153530	153539	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014976	AAATA	2	10	157206	157215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014976	TTAAA	2	10	165507	165516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014976	AGCTT	2	10	167711	167720	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014976	TTTTC	2	10	174450	174459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014976	ACCCA	2	10	175146	175155	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014976	TAATT	2	10	179880	179889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014976	TTATT	2	10	180321	180330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014976	AAAAT	2	10	183169	183178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014976	TTATA	2	10	190247	190256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014976	AAAAT	2	10	205457	205466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014976	ATAAA	2	10	207389	207398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014976	CTTAT	2	10	230653	230662	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014976	TTATA	2	10	235444	235453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014976	TATGT	2	10	237928	237937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014976	ATTAC	2	10	246842	246851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014976	TTTTC	2	10	247981	247990	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014976	GTTTT	2	10	262913	262922	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014976	TAAAA	2	10	277789	277798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014976	ATTTT	2	10	279530	279539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014976	TTGTT	2	10	279603	279612	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014976	AGAGG	2	10	285190	285199	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014976	TATAA	2	10	337644	337653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014976	AACTC	2	10	354630	354639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014976	ATTGT	2	10	358236	358245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014976	TTATA	2	10	365912	365921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014976	TCATT	2	10	368643	368652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014976	TAAAA	2	10	382658	382667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014976	TTTTA	2	10	386571	386580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014976	TTACA	2	10	392318	392327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014976	ATTTC	2	10	403734	403743	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014976	AAAAC	2	10	408749	408758	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014976	TTTCT	2	10	409271	409280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014976	ATTTA	2	10	414002	414011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014976	CTAAC	2	10	415105	415114	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014976	CTGCA	2	10	422570	422579	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014976	TGATT	2	10	430225	430234	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014976	TATAC	2	10	433415	433424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014976	AAAAT	2	10	436047	436056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014976	TGTTT	2	10	439670	439679	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014976	GCTTT	2	10	445658	445667	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014976	TGAGC	2	10	452199	452208	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014976	TAAAA	2	10	461353	461362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014976	CAAAA	2	10	497080	497089	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014976	ATATG	2	10	517137	517146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014976	TCTTT	2	10	555120	555129	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014976	TCTTT	2	10	566732	566741	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014976	TATAA	2	10	598716	598725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014976	CAGAA	2	10	615389	615398	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014976	ATTTT	2	10	619248	619257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014976	CCCTT	2	10	625213	625222	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014976	ATTGT	2	10	629526	629535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014976	ATTTT	2	10	629580	629589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014976	TTAAA	2	10	633120	633129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014976	ATTTT	2	10	633224	633233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014976	CAAAA	2	10	639375	639384	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014976	AAGGG	2	10	644010	644019	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014976	TTATT	2	10	648158	648167	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014976	CTTTT	2	10	679487	679496	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014976	GTTAC	2	10	685843	685852	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014976	TCTCT	2	10	686890	686899	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014976	AATCA	2	10	696258	696267	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014976	TATAA	2	10	697765	697774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014976	TGATT	2	10	700759	700768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014976	AGTCA	2	10	702055	702064	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014976	CTGCT	2	10	706610	706619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014976	TATCA	2	10	714836	714845	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014976	AAATG	2	10	718474	718483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014976	TCGTT	2	10	719333	719342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014976	TCATT	2	10	724045	724054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014976	ATTGG	2	10	724287	724296	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014976	TTAAA	2	10	729896	729905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014976	CTAGA	2	10	729924	729933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014976	CTCTA	2	10	730158	730167	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014976	TGTTT	2	10	733690	733699	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014976	TATTT	2	10	739088	739097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014976	CTCCC	2	10	744276	744285	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
104	NC_014976	AAAGG	2	10	762701	762710	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014976	TCTCT	2	10	764219	764228	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014976	CTGTT	2	10	766443	766452	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014976	CTTTT	2	10	766862	766871	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014976	TCATT	2	10	766998	767007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014976	ATTTT	2	10	782259	782268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014976	CTATG	2	10	800587	800596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014976	TTTGG	2	10	805463	805472	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014976	CTACA	2	10	806538	806547	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014976	TCACC	2	10	810591	810600	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_014976	TTTGC	2	10	814592	814601	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014976	ATTTT	2	10	826789	826798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014976	ATAAA	2	10	858057	858066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014976	GTTTT	2	10	908416	908425	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014976	ATTTA	2	10	913137	913146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014976	ATTTT	2	10	917435	917444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014976	GCTTT	2	10	941644	941653	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014976	ATAAA	2	10	957411	957420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014976	TCTTT	2	10	957525	957534	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014976	CGTAT	2	10	958618	958627	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014976	ATTCA	2	10	962059	962068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014976	TAAAA	2	10	966889	966898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014976	ATTTT	2	10	987103	987112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014976	ATTTT	2	10	989536	989545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014976	AAAAT	2	10	989556	989565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014976	AACAT	2	10	996090	996099	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014976	AGGTG	2	10	1003251	1003260	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014976	GAAAA	2	10	1005411	1005420	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014976	CTTCA	2	10	1017405	1017414	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014976	CGTTT	2	10	1022950	1022959	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014976	TTCGT	2	10	1036737	1036746	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014976	TAAAA	2	10	1046415	1046424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014976	TCGTT	2	10	1063196	1063205	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014976	TTTTA	2	10	1064867	1064876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014976	TTATG	2	10	1073296	1073305	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014976	TTGTT	2	10	1085224	1085233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014976	ATCCC	2	10	1090769	1090778	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_014976	CGGGG	2	10	1096846	1096855	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014976	TTATC	2	10	1132455	1132464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014976	GGATT	2	10	1144447	1144456	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014976	AAAAG	2	10	1144499	1144508	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014976	TTTTA	2	10	1147575	1147584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014976	GAAAA	2	10	1157154	1157163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014976	AAAAC	2	10	1170294	1170303	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_014976	GGACG	2	10	2388259	2388268	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.