MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteroides helcogenes P 36-108 chromosome

Total Repeats: 442

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014933	TTAAT	2	10	2400	2409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014933	ATTTT	2	10	25274	25283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014933	CAAGA	2	10	25908	25917	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014933	TTATG	2	10	28639	28648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014933	ATTTT	2	10	31141	31150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014933	AATGC	2	10	31365	31374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014933	AAAAG	2	10	41562	41571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014933	TTCTT	2	10	52434	52443	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014933	CTTTC	2	10	54402	54411	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014933	TTTTC	2	10	62979	62988	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014933	ATGCC	2	10	95393	95402	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014933	AAAAG	2	10	106132	106141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014933	AAAAC	2	10	161863	161872	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014933	TTTAT	2	10	172538	172547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014933	ATTAA	2	10	175896	175905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014933	AAAGT	2	10	200359	200368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014933	TTCAA	2	10	201407	201416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014933	TACGG	2	10	201662	201671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014933	TTACT	2	10	203344	203353	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014933	CGGCT	2	10	203707	203716	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014933	CAATA	2	10	205868	205877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014933	AGAAA	2	10	218280	218289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014933	AAGGA	2	10	231542	231551	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014933	TTGTT	2	10	237263	237272	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014933	TTCGC	2	10	251736	251745	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014933	GCGAA	2	10	251913	251922	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014933	GAATA	2	10	262061	262070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014933	CTTTA	2	10	262153	262162	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014933	ATTCC	2	10	263691	263700	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014933	AAAGT	2	10	278327	278336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014933	TTCAA	2	10	279375	279384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014933	TACGG	2	10	279630	279639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014933	TTACT	2	10	281312	281321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014933	CGGCT	2	10	281675	281684	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014933	CAATA	2	10	291821	291830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014933	TAAAA	2	10	296957	296966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014933	ATGAT	2	10	312024	312033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014933	AAGAA	2	10	334102	334111	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014933	GAGGG	2	10	339602	339611	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014933	TTTTC	2	10	347412	347421	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014933	AGATG	2	10	351637	351646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014933	GTCAG	2	10	379681	379690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014933	TAAAA	2	10	379708	379717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014933	TATAT	2	10	389035	389044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014933	ATCTT	2	10	414079	414088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014933	TAAAG	2	10	414319	414328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014933	TTAAA	2	10	449992	450001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014933	GTTTT	2	10	456022	456031	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014933	ATTTC	2	10	456270	456279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014933	CAAAA	2	10	456351	456360	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014933	CTCCC	2	10	456754	456763	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_014933	GCTTG	2	10	464522	464531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014933	AGTTC	2	10	474129	474138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014933	CCATA	2	10	486135	486144	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014933	TAAAT	2	10	499636	499645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014933	TTCGC	2	10	525381	525390	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014933	TTCGC	2	10	525493	525502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014933	TTCGC	2	10	525605	525614	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014933	GCGAA	2	10	525839	525848	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014933	GCGAA	2	10	525867	525876	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014933	TAAAT	2	10	538102	538111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014933	TTATC	2	10	538187	538196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014933	ATAGA	2	10	545903	545912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014933	TTGTT	2	10	549560	549569	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014933	TTCTT	2	10	553553	553562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014933	AAGAA	2	10	558230	558239	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014933	AAAAC	2	10	559736	559745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014933	ACACA	2	10	560284	560293	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014933	ACCAC	2	10	564871	564880	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_014933	CAATC	2	10	568880	568889	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014933	TGTAT	2	10	569950	569959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014933	GAAAG	2	10	570008	570017	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014933	TCCCG	2	10	574232	574241	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014933	ATTTA	2	10	574322	574331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014933	ACAGG	2	10	586107	586116	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014933	AACAA	2	10	591797	591806	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014933	GGGAG	2	10	595233	595242	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014933	TTTTG	2	10	629224	629233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014933	AAAAT	2	10	641812	641821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014933	AAAAT	2	10	642065	642074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014933	AAAAT	2	10	642226	642235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014933	AAATA	2	10	650191	650200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014933	CGAAG	2	10	650673	650682	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014933	TTCTA	2	10	656097	656106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014933	CTTTT	2	10	677827	677836	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014933	ATTAC	2	10	683374	683383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014933	TTTAT	2	10	684663	684672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014933	TTTTA	2	10	688079	688088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014933	TTTTG	2	10	698873	698882	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014933	TAAAA	2	10	702667	702676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014933	AACTT	2	10	713362	713371	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014933	ACCAG	2	10	716337	716346	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014933	ATTAT	2	10	720594	720603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014933	AAAAT	2	10	742942	742951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014933	AAAGA	2	10	750366	750375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014933	ATTAA	2	10	767474	767483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014933	TATAA	2	10	816647	816656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014933	TTTTG	2	10	845878	845887	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014933	TATCC	2	10	847749	847758	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014933	ATAGT	2	10	860987	860996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014933	TACCT	2	10	869289	869298	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014933	AAACA	2	10	872216	872225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014933	GCCTT	2	10	888131	888140	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014933	ATACA	2	10	901783	901792	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014933	ACAAT	2	10	909475	909484	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014933	CGCTC	2	10	914773	914782	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014933	AATAA	2	10	921157	921166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014933	AAAAC	2	10	922951	922960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014933	TTATT	2	10	926098	926107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014933	TTATT	2	10	928317	928326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014933	GAAAA	2	10	933147	933156	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014933	CAGAA	2	10	933218	933227	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014933	TTTGT	2	10	944906	944915	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014933	TAAAA	2	10	957833	957842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014933	TGTAT	2	10	959306	959315	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014933	TCTTT	2	10	975008	975017	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014933	AGAAT	2	10	980519	980528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014933	TATTC	2	10	985049	985058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014933	TTTCA	2	10	993722	993731	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014933	ATTCT	2	10	998144	998153	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014933	TAAGA	2	10	1004577	1004586	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014933	CTTTC	2	10	1006725	1006734	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014933	GGAAA	2	10	1006744	1006753	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014933	TCTTT	2	10	1011289	1011298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014933	CTTTA	2	10	1050119	1050128	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014933	CTTTT	2	10	1052600	1052609	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014933	TTTTG	2	10	1063978	1063987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014933	GGCTT	2	10	1076698	1076707	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014933	TAATA	2	10	1105294	1105303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014933	AAAAG	2	10	1122731	1122740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014933	GAAAG	2	10	1135114	1135123	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014933	TGCTT	2	10	1135197	1135206	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014933	TCTTT	2	10	1138401	1138410	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014933	ATCTT	2	10	1157290	1157299	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014933	TATGT	2	10	1161984	1161993	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014933	TCCGG	2	10	1181500	1181509	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014933	ATAGA	2	10	1196236	1196245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014933	TATAA	2	10	1209469	1209478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014933	TGTTT	2	10	1250460	1250469	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014933	ATTAT	2	10	1264080	1264089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014933	GTTAA	2	10	1268429	1268438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014933	TCGGA	2	10	1268469	1268478	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014933	AAAAC	2	10	1271182	1271191	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014933	TGTTT	2	10	1274955	1274964	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014933	TGCTT	2	10	1282914	1282923	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014933	GCGGT	2	10	1283057	1283066	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014933	CAGTT	2	10	1294607	1294616	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014933	AGTAC	2	10	1322673	1322682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014933	AAAGA	2	10	1324123	1324132	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014933	CATAG	3	15	1325583	1325597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_014933	ATAGC	2	10	1325604	1325613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014933	TAAAA	2	10	1353179	1353188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014933	TTAAT	2	10	1362763	1362772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014933	GTATT	2	10	1392495	1392504	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_014933	CATTC	2	10	1394896	1394905	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_014933	CCGTA	2	10	1396625	1396634	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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160	NC_014933	ACTTT	2	10	1397928	1397937	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_014933	TATGT	2	10	1492780	1492789	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_014933	TAATT	2	10	1523578	1523587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014933	AATTG	2	10	1528275	1528284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014933	TTGTT	2	10	1539386	1539395	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014933	TTGTT	2	10	1602327	1602336	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_014933	TTTGC	2	10	1612823	1612832	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_014933	AATTA	2	10	1746087	1746096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_014933	ATGTA	2	10	1895672	1895681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_014933	TCTTT	2	10	2462066	2462075	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_014933	AGCCG	2	10	2464320	2464329	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_014933	CCGTA	2	10	2466311	2466320	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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280	NC_014933	TTTGC	2	10	2475624	2475633	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
281	NC_014933	TGTTT	2	10	2488985	2488994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014933	TAAAT	2	10	2492410	2492419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014933	GATGT	2	10	2497538	2497547	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014933	GAAAA	2	10	2500948	2500957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_014933	CTTTT	2	10	3991818	3991827	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
442	NC_014933	TTAGT	2	10	3994153	3994162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.