MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella clarridgeiae 73

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014932	TAGTTA	2	12	9002	9013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014932	AAAATA	2	12	22886	22897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014932	AATATA	2	12	23937	23948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014932	AATATA	2	12	23961	23972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014932	ATTGCA	2	12	24054	24065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014932	CTAATA	2	12	48617	48628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014932	TAAATT	2	12	89526	89537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014932	TTTTTA	2	12	118029	118040	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014932	AAAGAA	2	12	126356	126367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014932	TTTGGG	2	12	126452	126463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014932	ACGTCG	2	12	127936	127947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014932	GTTTTG	2	12	131198	131209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014932	GAAAAA	2	12	137797	137808	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014932	TGACCT	2	12	140422	140433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014932	AAAGAT	2	12	161263	161274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014932	AGTTTT	2	12	190752	190763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014932	TTTAAA	2	12	195069	195080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014932	TTTTTA	2	12	208672	208683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014932	TAAAAG	2	12	223139	223150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014932	ATTTTA	2	12	240714	240725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014932	ATATTT	2	12	242578	242589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014932	AAAATA	2	12	244497	244508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014932	TAATTT	2	12	255557	255568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014932	ATTAAC	2	12	278213	278224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014932	ATCAAT	2	12	280309	280320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014932	TATAAA	2	12	285086	285097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014932	ATATTA	2	12	320283	320294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014932	ATTTTT	2	12	321308	321319	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014932	TATTGA	2	12	326634	326645	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014932	AAAATG	2	12	328213	328224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014932	AAATAT	2	12	337605	337616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014932	GAAGAT	2	12	345713	345724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014932	AATCTT	2	12	347410	347421	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014932	TATAAA	2	12	362013	362024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014932	AATATA	2	12	366090	366101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014932	AAAGAT	2	12	367793	367804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014932	ATATTT	2	12	368113	368124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014932	TAAACT	2	12	375999	376010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014932	CTATTA	2	12	445368	445379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014932	AGGAGA	2	12	451707	451718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014932	AATAGA	2	12	459336	459347	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014932	TTGATG	2	12	466288	466299	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014932	TTTGAA	2	12	472196	472207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014932	ATTAAA	2	12	480692	480703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014932	ATGAGT	2	12	483344	483355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014932	AAATAA	2	12	487927	487938	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014932	TAAAAA	2	12	495395	495406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014932	ACTATG	2	12	505995	506006	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014932	TGATTG	2	12	511844	511855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014932	AAAAGC	2	12	512320	512331	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014932	TAAAAA	2	12	520078	520089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014932	TCAGTA	2	12	536219	536230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014932	ATAACA	2	12	555345	555356	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014932	ACTAAT	2	12	557715	557726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014932	TAATTT	2	12	560346	560357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014932	ATTTTA	2	12	568497	568508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014932	AAAGAA	2	12	589574	589585	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014932	ATAGCC	2	12	603833	603844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014932	TTATAA	2	12	605967	605978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014932	AATGAT	2	12	606959	606970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014932	GTTATT	2	12	620104	620115	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014932	ATATTA	2	12	621253	621264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014932	TAAAAA	2	12	624152	624163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014932	AGATAA	2	12	625553	625564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014932	GTTTTT	2	12	628773	628784	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014932	CTTATT	2	12	633654	633665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014932	TTAATT	2	12	641202	641213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014932	AAAGAT	2	12	648836	648847	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014932	AAAGAT	2	12	648855	648866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014932	TCTAGC	2	12	672656	672667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014932	TTTCAT	2	12	691379	691390	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014932	ATTTTT	2	12	700606	700617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014932	AATGAA	2	12	702804	702815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014932	TTTCTG	2	12	727150	727161	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014932	ATTATA	2	12	743026	743037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014932	ATTAAT	2	12	775121	775132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014932	TTTATA	2	12	780224	780235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014932	ATTTTA	2	12	784127	784138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014932	AATTAT	2	12	821075	821086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014932	TCAGTT	2	12	822222	822233	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014932	ATATTA	2	12	835810	835821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014932	TATAAA	2	12	842026	842037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014932	GTTTTT	2	12	854480	854491	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014932	TCATTT	2	12	870558	870569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014932	TTTTCT	2	12	884912	884923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014932	AAAATA	2	12	893150	893161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014932	TACAAG	2	12	901330	901341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014932	CATATC	2	12	923239	923250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014932	AAAAAT	2	12	941285	941296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014932	TTTAAT	2	12	941298	941309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014932	ATCATA	2	12	975464	975475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014932	CTATAA	2	12	977062	977073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014932	ATTAAA	2	12	985594	985605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014932	TAAACT	2	12	1006938	1006949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014932	AACAAA	2	12	1018200	1018211	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014932	AAGTTA	2	12	1031787	1031798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014932	ATTTTA	2	12	1046568	1046579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014932	AAAATT	2	12	1049376	1049387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014932	GAAATC	2	12	1052769	1052780	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014932	TAAGCG	2	12	1054413	1054424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014932	ACTTAT	2	12	1078868	1078879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014932	ATAGTA	2	12	1082818	1082829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014932	TTTATT	2	12	1114773	1114784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014932	CAAAAA	2	12	1114802	1114813	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014932	TTGTTT	2	12	1116030	1116041	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014932	ACCATA	2	12	1118132	1118143	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014932	AAAATG	2	12	1118210	1118221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014932	AAAAAT	2	12	1126605	1126616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014932	AAATAT	2	12	1131304	1131315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014932	ACAATA	2	12	1140936	1140947	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014932	TTCGTG	2	12	1141508	1141519	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014932	CTTTTA	2	12	1165721	1165732	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014932	AACATA	2	12	1168926	1168937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014932	CAAAAA	2	12	1187988	1187999	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014932	TAAGAA	2	12	1220869	1220880	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014932	TAGTTC	2	12	1221026	1221037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014932	ATAAAA	2	12	1223247	1223258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014932	GCCTAA	2	12	1239855	1239866	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014932	GAGAGG	2	12	1251781	1251792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014932	TTTGCG	2	12	1251894	1251905	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014932	AATACA	2	12	1277879	1277890	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014932	AGTTTA	2	12	1279313	1279324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014932	ATGCAC	2	12	1288979	1288990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014932	TTCTCT	2	12	1309081	1309092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014932	ATTAAT	2	12	1361406	1361417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014932	TCAAAA	2	12	1362093	1362104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014932	ATTTTC	2	12	1383395	1383406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014932	TTATTT	2	12	1390313	1390324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014932	AAAGAT	2	12	1390623	1390634	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014932	CCAAGC	2	12	1399925	1399936	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014932	ATATCA	2	12	1427666	1427677	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014932	ATTTTA	2	12	1433131	1433142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014932	AAAGAT	2	12	1441502	1441513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014932	TCATTG	2	12	1453178	1453189	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_014932	ACTTAT	2	12	1481546	1481557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014932	ATTTAA	2	12	1483851	1483862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014932	AAAATC	2	12	1490051	1490062	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_014932	CATTGC	2	12	1490347	1490358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014932	ACCTAG	2	12	1506719	1506730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014932	TTTACT	2	12	1507720	1507731	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014932	AGAAAA	2	12	1522556	1522567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.