MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella clarridgeiae 73

Total Repeats: 411

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014932	GGGGA	2	10	3442	3451	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014932	AACAA	2	10	3501	3510	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014932	TTTAT	2	10	9081	9090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014932	GAAAA	2	10	9111	9120	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014932	TAAAA	2	10	12281	12290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014932	TATAA	2	10	14751	14760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014932	ATTTT	2	10	14857	14866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014932	CATAC	2	10	14938	14947	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014932	TTAAT	2	10	22478	22487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014932	TTTTA	2	10	22954	22963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014932	TTCTT	2	10	23726	23735	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014932	TATTT	2	10	31225	31234	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014932	GAATT	2	10	31253	31262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014932	ATTTT	2	10	40888	40897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014932	ATATT	2	10	48704	48713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014932	GCTTT	2	10	62679	62688	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014932	ATTTG	2	10	68469	68478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014932	AAGAA	2	10	71999	72008	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014932	TTACG	2	10	72189	72198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014932	TTTAT	2	10	72894	72903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014932	TTGAT	2	10	72960	72969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014932	TTTTA	2	10	73563	73572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014932	TTTAA	2	10	73666	73675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014932	TAACA	2	10	76976	76985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014932	TTTGC	2	10	79043	79052	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014932	TAAGT	2	10	89401	89410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014932	TTTAA	2	10	92617	92626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014932	ATCAT	2	10	92792	92801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014932	TCTAT	2	10	107294	107303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014932	GCATG	2	10	122633	122642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014932	TCATT	2	10	122754	122763	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014932	AATTT	2	10	123169	123178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014932	GATTG	2	10	128402	128411	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014932	ATTAT	2	10	129700	129709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014932	TTGCA	2	10	132414	132423	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014932	TAAAA	2	10	136142	136151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014932	TTTAG	2	10	146103	146112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014932	TCAAT	2	10	157763	157772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014932	ATTAA	2	10	158106	158115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014932	AAAAT	2	10	162516	162525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014932	TGATT	2	10	166253	166262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014932	TTATA	2	10	195277	195286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014932	TAAAA	2	10	195291	195300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014932	TCAAA	2	10	214521	214530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014932	ATTGG	2	10	214550	214559	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014932	AAATT	2	10	216427	216436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014932	TAAAA	2	10	217512	217521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014932	TTTTA	2	10	225401	225410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014932	GATAT	2	10	225448	225457	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014932	TATTT	2	10	237202	237211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014932	ACTAT	2	10	242527	242536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014932	AATAT	2	10	242593	242602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014932	TTTAA	2	10	243662	243671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014932	TTGGT	2	10	244202	244211	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014932	AACAC	2	10	251861	251870	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014932	AAAAG	2	10	255545	255554	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014932	TTATA	2	10	255794	255803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014932	CTGCG	2	10	261920	261929	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014932	TTTTA	2	10	263180	263189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014932	TAAAA	2	10	267778	267787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014932	TTAAT	2	10	267986	267995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014932	ATCTT	2	10	276117	276126	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014932	GAAAA	2	10	279463	279472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014932	TCCTC	2	10	280988	280997	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014932	ATTTT	2	10	284319	284328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014932	TATTT	2	10	284936	284945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014932	ATTTT	2	10	284965	284974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014932	AATGA	2	10	298134	298143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014932	ATCTA	2	10	301746	301755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014932	ATTTT	2	10	306933	306942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014932	TATAA	2	10	309593	309602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014932	AAAGT	2	10	309628	309637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014932	ATTTG	2	10	309710	309719	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014932	AGGTA	2	10	316909	316918	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014932	ATATT	3	15	322660	322674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014932	ATTTT	2	10	326447	326456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014932	TAAAC	2	10	326653	326662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014932	AGAAC	2	10	328131	328140	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014932	AAAAG	2	10	335777	335786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014932	AATTT	2	10	337913	337922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014932	GTAAA	2	10	343512	343521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014932	TGCAT	2	10	344520	344529	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014932	GTCAT	2	10	345337	345346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014932	TTTCA	2	10	345347	345356	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014932	TTTTA	2	10	345916	345925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014932	ATTAG	2	10	348205	348214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014932	TTCGT	2	10	355989	355998	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014932	ATAAA	2	10	359998	360007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014932	ATTTT	2	10	367848	367857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014932	AGAAA	2	10	368631	368640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014932	ATTTA	2	10	372629	372638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014932	GTTTT	2	10	375674	375683	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014932	TTAAA	2	10	376018	376027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014932	ATCCA	2	10	376146	376155	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014932	TTTAG	2	10	383489	383498	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014932	GTAAT	2	10	386316	386325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014932	GGTAA	2	10	393321	393330	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014932	ATTTT	2	10	393363	393372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014932	ATTAA	2	10	394757	394766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014932	TAAGA	2	10	394767	394776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014932	TAAAA	2	10	394805	394814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014932	AATAA	2	10	394848	394857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014932	GAAAA	2	10	397383	397392	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014932	TATTT	2	10	398791	398800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014932	TAAAA	2	10	402709	402718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014932	TAAAA	2	10	411240	411249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014932	AATTG	2	10	411377	411386	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014932	TTCTA	2	10	413178	413187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014932	TGAAA	2	10	413694	413703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014932	ATTAA	2	10	414651	414660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014932	TTTGA	2	10	418238	418247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014932	ATGGG	2	10	420979	420988	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014932	TGAGG	2	10	432800	432809	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014932	TTAGA	2	10	451528	451537	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014932	TTTCG	2	10	452058	452067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014932	TTGTA	2	10	452212	452221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014932	ATATC	2	10	452227	452236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014932	CCAAA	2	10	452561	452570	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014932	GCAAT	2	10	453343	453352	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014932	TACAT	2	10	463176	463185	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014932	ATTTT	2	10	465196	465205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014932	GTTAA	2	10	468203	468212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014932	AAAGT	2	10	470369	470378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014932	GTAAT	2	10	470557	470566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014932	TATTG	2	10	470634	470643	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014932	CAGAA	2	10	474424	474433	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014932	GCAAG	2	10	476061	476070	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014932	CCTAT	2	10	489269	489278	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014932	TTTTC	2	10	489427	489436	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014932	AGAAT	2	10	489467	489476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014932	ATTTT	2	10	492936	492945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014932	TTTGC	3	15	506337	506351	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014932	ATTGT	2	10	509075	509084	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014932	TTGGA	2	10	509473	509482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014932	ATTTT	2	10	516606	516615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014932	GTTTT	2	10	520183	520192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014932	TTTTA	2	10	534370	534379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014932	ATTTT	2	10	534491	534500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014932	TTATT	2	10	538626	538635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014932	ATTAT	2	10	547137	547146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014932	GACCA	2	10	547156	547165	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014932	TATAA	2	10	547166	547175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014932	AGTGA	2	10	553337	553346	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014932	TGTAG	2	10	554635	554644	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014932	TTAAA	2	10	554670	554679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014932	AAATA	2	10	557803	557812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014932	TTATT	2	10	559966	559975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014932	ATTGT	2	10	560066	560075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014932	TTTTA	2	10	727293	727302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014932	TGTTA	2	10	730520	730529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.