MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014723	ATTT	2	8	83	90	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014723	ATAG	2	8	320	327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014723	CCAG	2	8	1156	1163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014723	TGGC	2	8	1205	1212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014723	GCAA	2	8	17332	17339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014723	TTAA	2	8	17526	17533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014723	GGCT	2	8	18902	18909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014723	ATGG	2	8	23724	23731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014723	GGCA	2	8	23756	23763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014723	CGTC	2	8	27372	27379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014723	AGCA	2	8	29943	29950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014723	CAAA	2	8	30036	30043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014723	CTGG	2	8	30050	30057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014723	CAAA	2	8	30188	30195	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014723	CGAC	2	8	30261	30268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014723	CGAG	2	8	31619	31626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014723	GCTC	2	8	33645	33652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014723	GGTG	2	8	35943	35950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014723	GTTG	2	8	37875	37882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014723	TAGC	2	8	38464	38471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014723	ATGT	2	8	40048	40055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014723	GTTT	2	8	41404	41411	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014723	TTGA	2	8	41415	41422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014723	GCCG	2	8	42405	42412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014723	GGCG	2	8	44326	44333	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014723	GCAG	2	8	45486	45493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014723	GCAC	2	8	47460	47467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014723	TGCT	2	8	47684	47691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014723	GCGG	2	8	53819	53826	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014723	ATTG	2	8	54082	54089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014723	CATT	2	8	54129	54136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014723	TCTT	2	8	56140	56147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014723	AGGC	2	8	76637	76644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014723	TGAA	2	8	76738	76745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014723	CTTA	2	8	77730	77737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014723	TGTT	2	8	77780	77787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014723	TCGC	2	8	77905	77912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014723	CTTA	2	8	78222	78229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014723	TGCT	2	8	78250	78257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014723	GAGC	2	8	82274	82281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014723	GGGT	2	8	83227	83234	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014723	CGAA	2	8	83274	83281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014723	CGAC	2	8	83329	83336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014723	CCTG	2	8	83626	83633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014723	CGAT	2	8	83822	83829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014723	GGCC	2	8	87515	87522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014723	CGAC	2	8	90793	90800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014723	TCAG	2	8	96624	96631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014723	ACCA	2	8	96670	96677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014723	CGGC	2	8	97313	97320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014723	GGCG	2	8	97465	97472	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014723	GCTG	2	8	100235	100242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014723	ACCA	2	8	104510	104517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014723	GGCG	2	8	105814	105821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014723	GGTC	2	8	105931	105938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014723	AGCC	2	8	106002	106009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014723	TTGG	2	8	106011	106018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014723	TCGC	2	8	109675	109682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014723	TGTC	2	8	109889	109896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014723	TCGC	2	8	111773	111780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014723	ATGT	2	8	115408	115415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014723	TTGT	2	8	115894	115901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014723	TTAC	2	8	120210	120217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014723	ATTT	2	8	120293	120300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014723	AGGC	2	8	124132	124139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014723	CGTG	2	8	125875	125882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014723	GTCC	2	8	128178	128185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014723	AGGC	2	8	144155	144162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014723	ATCC	2	8	147525	147532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014723	GACT	2	8	149343	149350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014723	CTTC	2	8	150912	150919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014723	AGGC	2	8	151069	151076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014723	CAGG	2	8	152310	152317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014723	AGGC	2	8	152377	152384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014723	AAGG	2	8	152392	152399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014723	CATG	2	8	153812	153819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014723	GCAA	2	8	156699	156706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014723	ATTT	2	8	156755	156762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014723	TGGC	2	8	157225	157232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014723	TCAC	2	8	158302	158309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014723	ATGG	2	8	160904	160911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014723	CAGA	2	8	162085	162092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014723	CGAC	2	8	162127	162134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014723	GGCG	2	8	162155	162162	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014723	GAAG	2	8	165249	165256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014723	TAAT	2	8	165669	165676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014723	ATGA	2	8	165825	165832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014723	TTAG	2	8	167041	167048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014723	TATT	2	8	167129	167136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014723	TCAG	2	8	168508	168515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014723	TTCT	2	8	169471	169478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.