MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	GCCTTT	2	12	141197	141208	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014722	ACTTTA	2	12	143013	143024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014722	TTCATC	2	12	145484	145495	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014722	CGACGC	2	12	148374	148385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014722	TGGCGG	2	12	160380	160391	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014722	CATCAC	2	12	175837	175848	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014722	GGCGAC	2	12	175875	175886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014722	TCAAAA	2	12	203621	203632	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014722	TTGCGC	2	12	265599	265610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014722	TGGCGG	2	12	271225	271236	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014722	TGTTCA	2	12	278864	278875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014722	GCCGAC	2	12	368379	368390	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014722	AAATAA	2	12	412073	412084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014722	CGTCCC	2	12	462422	462433	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014722	GTCCGG	2	12	465045	465056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014722	TTGCTA	2	12	484330	484341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014722	TGAAAA	2	12	489503	489514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014722	ACAGGT	2	12	494245	494256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014722	GCCCAA	2	12	496315	496326	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014722	GCAGCG	2	12	507678	507689	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014722	AGGGAC	2	12	507725	507736	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014722	GTTAGC	2	12	555895	555906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014722	GGGGCG	2	12	564740	564751	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014722	CGGCTT	2	12	602278	602289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014722	ACTCGA	2	12	636541	636552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014722	TGCAGC	2	12	654491	654502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014722	GGGCTA	2	12	855490	855501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014722	ACTAGC	2	12	862169	862180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014722	GCAGCG	2	12	862321	862332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014722	TTGCCC	2	12	863990	864001	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014722	CCCGGC	2	12	872185	872196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014722	CCTCGC	2	12	880196	880207	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014722	GGCGCC	2	12	910549	910560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014722	GATTGC	2	12	934314	934325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014722	ATGTTG	2	12	954963	954974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014722	GCAGAA	2	12	958977	958988	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014722	CGTCAC	2	12	973273	973284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014722	GTTTCT	2	12	1064823	1064834	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014722	GCAGGA	2	12	1100151	1100162	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014722	TGCCGC	2	12	1119441	1119452	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014722	ACTAAA	2	12	1194148	1194159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014722	GGGTCG	2	12	1219560	1219571	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014722	CAATCG	2	12	1243615	1243626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014722	CGCGGG	2	12	1243671	1243682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014722	AGCTTG	2	12	1245792	1245803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014722	GGCCGC	2	12	1276178	1276189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014722	CATTGA	2	12	1325531	1325542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014722	GCGGTT	2	12	1325685	1325696	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014722	GTCAGG	2	12	1325725	1325736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014722	CGCTGC	2	12	1329425	1329436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014722	GTTCGC	2	12	1351490	1351501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014722	GGTCAA	2	12	1472249	1472260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014722	GTCGCC	2	12	1531566	1531577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014722	TAGCCC	2	12	1570748	1570759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014722	AGCCAT	2	12	1761662	1761673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014722	TTGCGG	2	12	1774318	1774329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014722	TGCCGA	2	12	1786077	1786088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014722	ACCGCT	2	12	1799460	1799471	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014722	GCTCGG	2	12	1874199	1874210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014722	GCAGGC	2	12	1894709	1894720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014722	CCGCAC	2	12	1933994	1934005	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014722	ACCATT	2	12	1944246	1944257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014722	TTTGCT	2	12	1955570	1955581	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014722	GTTTTC	2	12	1969837	1969848	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014722	GGAACG	2	12	1970248	1970259	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014722	AACATA	2	12	1976324	1976335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014722	TTGATG	2	12	1980102	1980113	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014722	AGTTTG	2	12	2017504	2017515	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014722	GCTCCG	2	12	2046858	2046869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014722	CTGCCA	2	12	2162375	2162386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014722	TGACGA	2	12	2176935	2176946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014722	GCTTCG	2	12	2203967	2203978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014722	CAACCA	2	12	2205333	2205344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014722	ACCGAT	2	12	2258363	2258374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014722	CGGCTG	2	12	2273026	2273037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014722	CCATGC	2	12	2288734	2288745	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014722	CGCCCG	2	12	2308311	2308322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014722	ATCCGC	2	12	2321060	2321071	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014722	CGTGTC	2	12	2371367	2371378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014722	CACCTT	2	12	2400274	2400285	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014722	AGCCGC	2	12	2437927	2437938	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014722	AAGTTC	2	12	2445950	2445961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014722	AGCGCG	2	12	2499609	2499620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014722	CCAGCG	2	12	2581775	2581786	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014722	CGCCGG	2	12	2620004	2620015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014722	GCCTCA	2	12	2631016	2631027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014722	ATCGAG	2	12	2638844	2638855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014722	CGCCAG	2	12	2657056	2657067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014722	GATGAC	2	12	2687515	2687526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014722	GTCGCG	2	12	2688924	2688935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014722	ACCAGC	2	12	2723561	2723572	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014722	GCACAG	2	12	2723851	2723862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.