MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 3787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	CGG	2	6	1600	1605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014722	CGG	2	6	1613	1618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014722	GCA	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014722	CGC	3	9	1723	1731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014722	GCC	2	6	1736	1741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014722	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014722	CCG	2	6	3086	3091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014722	TTC	2	6	5725	5730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014722	GCC	2	6	5760	5765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014722	GTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014722	GCT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014722	ATC	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014722	AAT	2	6	5957	5962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014722	GCA	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014722	GTT	2	6	7050	7055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014722	ATC	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014722	CAG	2	6	7363	7368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014722	TCA	2	6	8382	8387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014722	AGT	2	6	10680	10685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014722	CGC	2	6	10694	10699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014722	TCT	2	6	10728	10733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014722	CAA	2	6	11022	11027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014722	GCT	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014722	TGT	2	6	11195	11200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014722	TGG	2	6	11326	11331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014722	AAG	2	6	11420	11425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014722	CGT	2	6	11442	11447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014722	TAA	2	6	11453	11458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014722	AGG	2	6	12329	12334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014722	AGC	2	6	13747	13752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014722	AGG	2	6	13773	13778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014722	GCA	2	6	14594	14599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014722	GAT	2	6	14608	14613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014722	ACG	2	6	15438	15443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014722	ATC	2	6	19641	19646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014722	TCA	2	6	21516	21521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014722	CTC	2	6	24170	24175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014722	CAG	2	6	24187	24192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014722	GCT	2	6	32099	32104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014722	GGA	2	6	38579	38584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014722	CAA	2	6	38619	38624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014722	TCT	2	6	38675	38680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014722	GGC	2	6	40027	40032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014722	TTA	2	6	40520	40525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014722	GCA	2	6	41236	41241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014722	GCG	2	6	41251	41256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014722	GGT	2	6	41268	41273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014722	CCA	2	6	41279	41284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014722	TTC	3	9	41558	41566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014722	TAA	2	6	41586	41591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014722	CTT	2	6	41826	41831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014722	CGT	2	6	41846	41851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014722	CAA	2	6	41871	41876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014722	GAT	2	6	42457	42462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014722	ACG	2	6	43023	43028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014722	GCA	2	6	43043	43048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014722	CGG	2	6	43054	43059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014722	CCG	2	6	43397	43402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014722	ATG	2	6	43491	43496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014722	CAG	2	6	48353	48358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014722	CTG	2	6	48413	48418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014722	ATT	2	6	48508	48513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014722	TTG	2	6	49100	49105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014722	GAT	2	6	49106	49111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014722	TAG	2	6	49199	49204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014722	GTG	2	6	49269	49274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014722	ATA	3	9	49315	49323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014722	CAT	2	6	49334	49339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014722	GCA	2	6	49436	49441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014722	GAT	2	6	49463	49468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014722	GCT	2	6	49738	49743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014722	TAT	2	6	53668	53673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014722	AAT	2	6	53683	53688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014722	CGA	2	6	53782	53787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014722	CGC	2	6	54669	54674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014722	ATT	2	6	54698	54703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014722	AGC	2	6	57517	57522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014722	CAA	2	6	57564	57569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014722	CGC	2	6	57629	57634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014722	ATC	2	6	57637	57642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014722	CAG	2	6	57677	57682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014722	ATT	2	6	63721	63726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014722	CGA	2	6	64396	64401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014722	GCC	2	6	64699	64704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014722	ATT	2	6	68843	68848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014722	ACA	2	6	69235	69240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014722	CAA	2	6	69341	69346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014722	CAG	2	6	69385	69390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014722	CGC	2	6	69944	69949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014722	CGC	2	6	69958	69963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014722	GGA	3	9	76952	76960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014722	AAT	2	6	79477	79482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014722	CGA	2	6	83036	83041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014722	GAC	2	6	83052	83057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014722	GCA	2	6	84970	84975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014722	CTG	2	6	85006	85011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014722	ACT	2	6	86724	86729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014722	CCG	2	6	86741	86746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014722	AAT	2	6	86776	86781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014722	AGG	2	6	88437	88442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014722	GCG	2	6	88443	88448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014722	GCA	2	6	88465	88470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014722	CAC	2	6	88471	88476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014722	CGT	2	6	88483	88488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014722	CGA	2	6	88552	88557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014722	CCA	2	6	88594	88599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014722	CGG	2	6	88616	88621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014722	GTG	2	6	88638	88643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014722	ATT	2	6	89989	89994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014722	TCC	2	6	90094	90099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014722	TCC	2	6	90105	90110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014722	TCA	3	9	90201	90209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014722	CGC	2	6	92105	92110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014722	CTG	2	6	92964	92969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014722	GCG	3	9	92979	92987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014722	ACG	2	6	95507	95512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014722	GGC	2	6	101775	101780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014722	GCC	2	6	101792	101797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014722	TCA	2	6	101834	101839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014722	CTC	2	6	101873	101878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014722	GCG	2	6	102364	102369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014722	CGC	2	6	102375	102380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014722	CGG	3	9	107907	107915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014722	CCG	2	6	107955	107960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014722	GAT	2	6	107973	107978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014722	GCG	2	6	108001	108006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014722	CGC	2	6	108007	108012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014722	CGA	2	6	108076	108081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014722	CGC	2	6	108120	108125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014722	GCG	2	6	108635	108640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014722	GCT	2	6	110059	110064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014722	TGC	2	6	110442	110447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014722	GCG	2	6	110468	110473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014722	CTA	2	6	112951	112956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014722	TTC	2	6	113184	113189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014722	GTT	2	6	113505	113510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014722	CGG	2	6	113682	113687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014722	TCA	2	6	113710	113715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_014722	CGG	2	6	113822	113827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014722	CGA	2	6	113843	113848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014722	TGG	2	6	113877	113882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_014722	TGG	2	6	273845	273850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_014722	CGT	2	6	276395	276400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_014722	CCG	2	6	308759	308764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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