MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014718	CCGGAC	2	12	15157	15168	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014718	GCCGTA	2	12	23506	23517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014718	GACGCC	2	12	67498	67509	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014718	ATCGGT	2	12	68819	68830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014718	TAGTCG	2	12	79804	79815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014718	TATTTT	2	12	109571	109582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014718	GGAACA	2	12	178931	178942	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014718	GCATGG	2	12	179141	179152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014718	GGCGCA	2	12	218998	219009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014718	TCTAAA	2	12	342721	342732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014718	TTGCCC	2	12	369743	369754	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014718	GGCTGG	2	12	373784	373795	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014718	ACCGCG	3	18	433467	433484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014718	ATTTAA	2	12	462959	462970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014718	TTCCTG	2	12	502771	502782	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014718	ACGGCA	2	12	543475	543486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014718	CGGCCC	2	12	543535	543546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014718	CGGCGC	2	12	555461	555472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014718	TGACGA	2	12	569278	569289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014718	GGAATT	2	12	578021	578032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014718	TCTGCT	2	12	578568	578579	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014718	CGCGAA	2	12	587960	587971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014718	CGAGCC	2	12	613532	613543	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014718	CTCAAA	2	12	638925	638936	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014718	GATTCA	2	12	639514	639525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014718	CAAAAT	2	12	639977	639988	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014718	TCTGCT	2	12	672005	672016	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014718	ATCGAT	2	12	690793	690804	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014718	TTGGCC	2	12	715853	715864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014718	TGCCAG	2	12	716263	716274	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014718	AAGGAC	2	12	766514	766525	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014718	AGCGCG	2	12	796740	796751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014718	GTAGGC	2	12	797452	797463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014718	GAGCGC	2	12	808844	808855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014718	TTATTT	2	12	813614	813625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014718	ACTAGC	2	12	817091	817102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.