MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 2142

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014718	CAG	2	6	782310	782315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_014718	GCCG	2	8	782335	782342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_014718	GCC	2	6	782353	782358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2004	NC_014718	CCCG	2	8	782365	782372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2005	NC_014718	TCG	2	6	782404	782409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_014718	CCG	2	6	782461	782466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_014718	CGAA	2	8	782799	782806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2008	NC_014718	GCT	2	6	782852	782857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_014718	CGA	2	6	784135	784140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_014718	CG	4	8	784213	784220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_014718	TGC	2	6	784229	784234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_014718	TG	3	6	784265	784270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_014718	GAT	2	6	784296	784301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_014718	GCG	2	6	784341	784346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_014718	GTCC	2	8	784370	784377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2016	NC_014718	GCG	2	6	789339	789344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_014718	CG	5	10	789343	789352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2018	NC_014718	AGG	2	6	789385	789390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_014718	ACG	2	6	792667	792672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_014718	CGC	2	6	795868	795873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2021	NC_014718	TGC	2	6	796456	796461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_014718	TGGC	2	8	796463	796470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2023	NC_014718	GCC	2	6	796659	796664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2024	NC_014718	TCG	2	6	796687	796692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_014718	AGCGCG	2	12	796740	796751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_014718	GCG	2	6	796784	796789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_014718	GC	3	6	796827	796832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2028	NC_014718	TGT	2	6	796927	796932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_014718	CGAA	2	8	796952	796959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2030	NC_014718	A	6	6	796976	796981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_014718	GATT	2	8	797040	797047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_014718	CAAG	2	8	797124	797131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2033	NC_014718	GGT	2	6	797229	797234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_014718	TTC	2	6	797254	797259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_014718	GT	3	6	797278	797283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_014718	GTAGGC	2	12	797452	797463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2037	NC_014718	ATA	2	6	797564	797569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_014718	TGCC	2	8	797586	797593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_014718	TCA	2	6	797595	797600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_014718	GA	3	6	797601	797606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_014718	GGT	2	6	797609	797614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_014718	TCGC	2	8	797615	797622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2043	NC_014718	CAG	2	6	797628	797633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_014718	GCC	2	6	797653	797658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2045	NC_014718	ACT	2	6	797768	797773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_014718	GCGCC	2	10	798052	798061	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2047	NC_014718	TGG	2	6	798062	798067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_014718	T	6	6	798078	798083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_014718	TGA	2	6	798541	798546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_014718	AAT	2	6	798887	798892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_014718	AG	3	6	798904	798909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_014718	CCG	2	6	799837	799842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_014718	CAA	2	6	799845	799850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_014718	TAT	2	6	799870	799875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_014718	GTC	2	6	802337	802342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_014718	CTA	2	6	804165	804170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_014718	AGC	2	6	804199	804204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_014718	TGTA	2	8	804219	804226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_014718	AGC	2	6	804230	804235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_014718	GGTT	2	8	804245	804252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_014718	AGT	2	6	804296	804301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_014718	GCG	2	6	804416	804421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_014718	CGA	2	6	804497	804502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_014718	GCT	2	6	804526	804531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_014718	TGC	2	6	804545	804550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_014718	AGG	2	6	804569	804574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_014718	GCA	2	6	804615	804620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_014718	TGC	2	6	804634	804639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_014718	AAC	2	6	804847	804852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_014718	GTC	2	6	804891	804896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2071	NC_014718	GC	3	6	805562	805567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2072	NC_014718	GGC	2	6	807232	807237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2073	NC_014718	TTCAG	2	10	807250	807259	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2074	NC_014718	TTGGT	2	10	807506	807515	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_014718	CGC	2	6	807525	807530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2076	NC_014718	CG	3	6	807533	807538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2077	NC_014718	TCG	2	6	807539	807544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2078	NC_014718	AAAT	2	8	807580	807587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_014718	GAC	2	6	808816	808821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2080	NC_014718	CGA	2	6	808822	808827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2081	NC_014718	GC	3	6	808838	808843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2082	NC_014718	GAGCGC	2	12	808844	808855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2083	NC_014718	GGCAC	2	10	808955	808964	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2084	NC_014718	GCG	2	6	808995	809000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2085	NC_014718	GCT	2	6	813062	813067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2086	NC_014718	CTGT	2	8	813575	813582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2087	NC_014718	TTATTT	2	12	813614	813625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_014718	GCG	2	6	813670	813675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2089	NC_014718	GAC	2	6	813683	813688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_014718	T	6	6	813701	813706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_014718	GCT	2	6	813710	813715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_014718	GCG	2	6	813730	813735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_014718	GAA	2	6	813746	813751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_014718	GGT	2	6	813789	813794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_014718	GCGA	2	8	813853	813860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2096	NC_014718	TTGC	2	8	813934	813941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2097	NC_014718	CGC	2	6	814976	814981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_014718	A	7	7	815064	815070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_014718	GTC	2	6	815108	815113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_014718	GGCG	2	8	815182	815189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2101	NC_014718	GCG	2	6	815199	815204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_014718	TG	3	6	815233	815238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_014718	CTGC	2	8	815312	815319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2104	NC_014718	GTATG	2	10	815335	815344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_014718	CAT	2	6	816031	816036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_014718	TC	3	6	816911	816916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2107	NC_014718	ATG	2	6	816969	816974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_014718	GCC	2	6	816975	816980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2109	NC_014718	GCGAC	2	10	816992	817001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2110	NC_014718	GCT	2	6	817075	817080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_014718	ACTAGC	2	12	817091	817102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_014718	CGA	2	6	817112	817117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_014718	CCA	2	6	817119	817124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2114	NC_014718	TCC	2	6	817155	817160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2115	NC_014718	TAAT	2	8	817191	817198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_014718	AGC	2	6	817208	817213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_014718	TAAT	2	8	817231	817238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_014718	ACC	2	6	817248	817253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2119	NC_014718	GCG	2	6	817257	817262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_014718	GCG	2	6	818890	818895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_014718	GCG	2	6	818936	818941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2122	NC_014718	GGC	2	6	818949	818954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_014718	CGCAG	2	10	819006	819015	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2124	NC_014718	TCG	2	6	819054	819059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_014718	TGC	2	6	819061	819066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_014718	TCG	2	6	819099	819104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_014718	CG	4	8	819103	819110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2128	NC_014718	CTG	2	6	819170	819175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_014718	CTG	2	6	819481	819486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_014718	TGC	2	6	819487	819492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_014718	ATGGC	2	10	820473	820482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2132	NC_014718	GT	3	6	820502	820507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_014718	GT	3	6	820525	820530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_014718	TTC	2	6	820595	820600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_014718	GC	3	6	820645	820650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2136	NC_014718	CAA	2	6	820736	820741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_014718	TGC	2	6	820760	820765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2138	NC_014718	GC	3	6	820800	820805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2139	NC_014718	CG	3	6	820957	820962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2140	NC_014718	CAC	2	6	821943	821948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2141	NC_014718	GCA	2	6	821960	821965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_014718	CGTTG	2	10	821980	821989	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.