MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 2142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014718	ATG	2	6	422273	422278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014718	CATT	2	8	422284	422291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_014718	CGAC	2	8	422317	422324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_014718	GCT	2	6	422347	422352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_014718	CAA	2	6	422953	422958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_014718	CCG	2	6	422990	422995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_014718	ATGG	2	8	424096	424103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014718	CGA	2	6	424104	424109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014718	AATT	2	8	424189	424196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014718	TAA	2	6	424212	424217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014718	TCT	2	6	424534	424539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_014718	GAC	2	6	426620	426625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_014718	TCA	2	6	426748	426753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014718	TAA	2	6	426883	426888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014718	CGA	2	6	426906	426911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014718	CG	3	6	426914	426919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_014718	GTT	2	6	427019	427024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014718	CTT	2	6	427064	427069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014718	TTGC	2	8	429467	429474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_014718	GCAG	2	8	429502	429509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_014718	GC	3	6	429515	429520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_014718	GGA	2	6	429558	429563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014718	CGC	2	6	429632	429637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_014718	CTAAA	2	10	432382	432391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_014718	CG	3	6	432399	432404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_014718	CG	3	6	432420	432425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_014718	CGT	2	6	432445	432450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_014718	G	6	6	433039	433044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014718	GCC	2	6	433050	433055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_014718	GGA	2	6	433066	433071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014718	GC	3	6	433300	433305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_014718	CGC	2	6	433348	433353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_014718	CCG	2	6	433450	433455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_014718	ACCGCG	3	18	433467	433484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_014718	TGC	2	6	434972	434977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014718	GATG	2	8	434987	434994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014718	CG	3	6	436517	436522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_014718	GC	4	8	436560	436567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_014718	ATG	2	6	436612	436617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014718	T	6	6	436695	436700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014718	TAA	2	6	436860	436865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014718	TAC	2	6	439545	439550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_014718	CGC	2	6	439585	439590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_014718	AAT	2	6	439600	439605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014718	TA	3	6	439632	439637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014718	ATA	3	9	439635	439643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014718	ATG	2	6	439655	439660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014718	GT	3	6	439741	439746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014718	ACA	2	6	439764	439769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014718	ATG	2	6	439811	439816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014718	GCT	2	6	439823	439828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_014718	GCA	2	6	439837	439842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014718	GTC	2	6	440658	440663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014718	ATG	2	6	440945	440950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014718	CTC	2	6	442422	442427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_014718	TGCC	2	8	442447	442454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_014718	GCT	2	6	442586	442591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014718	TCG	2	6	442594	442599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_014718	GAT	2	6	442660	442665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014718	GAC	2	6	442676	442681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014718	TCGC	2	8	442715	442722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_014718	CAC	2	6	443203	443208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014718	TTTA	2	8	443210	443217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014718	TCA	2	6	443278	443283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_014718	CTT	2	6	443312	443317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014718	GGTC	2	8	443375	443382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_014718	CTGC	2	8	443386	443393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_014718	GCC	2	6	444677	444682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_014718	CGA	2	6	444704	444709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_014718	CAG	2	6	444825	444830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_014718	TGA	2	6	445272	445277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014718	ATTT	2	8	445407	445414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014718	T	6	6	445412	445417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014718	ACA	2	6	445444	445449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_014718	ATT	2	6	445452	445457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014718	CAT	2	6	445459	445464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014718	CA	3	6	445495	445500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_014718	T	6	6	445534	445539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014718	GAAAA	2	10	445540	445549	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014718	AGA	2	6	445653	445658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014718	TCG	2	6	445669	445674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014718	TC	3	6	445786	445791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_014718	TTAG	2	8	445832	445839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014718	GCA	2	6	445918	445923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014718	AAGC	2	8	445968	445975	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_014718	CCAA	2	8	445999	446006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_014718	TAAA	2	8	446034	446041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014718	CAAT	2	8	446069	446076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_014718	ACG	2	6	446096	446101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014718	GCAG	2	8	446126	446133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_014718	GAT	2	6	446148	446153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014718	CGC	2	6	453991	453996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_014718	TGA	2	6	454096	454101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014718	GC	3	6	454135	454140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_014718	ATCA	2	8	454227	454234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_014718	TCT	2	6	460255	460260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_014718	GGATC	2	10	460262	460271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_014718	TTA	2	6	460294	460299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014718	CTG	2	6	460318	460323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014718	CGC	2	6	460324	460329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_014718	CGCC	2	8	460332	460339	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1102	NC_014718	A	6	6	460343	460348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014718	GC	3	6	460354	460359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_014718	A	6	6	460368	460373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014718	AG	3	6	460379	460384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014718	CTG	2	6	460426	460431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_014718	GCGA	2	8	460778	460785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_014718	ACG	2	6	461342	461347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014718	TCCG	2	8	461390	461397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_014718	CAT	2	6	461414	461419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014718	CCT	2	6	461449	461454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_014718	GCG	2	6	461495	461500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014718	A	6	6	461508	461513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014718	CGA	2	6	461528	461533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_014718	CG	3	6	461547	461552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_014718	TTG	2	6	461661	461666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014718	GTCG	2	8	461723	461730	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_014718	GCC	2	6	461738	461743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_014718	GTT	2	6	461750	461755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014718	CTG	2	6	461811	461816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014718	CGG	2	6	462273	462278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_014718	CGC	2	6	462290	462295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_014718	CCA	2	6	462457	462462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_014718	CGA	2	6	462492	462497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014718	ATC	2	6	462510	462515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_014718	CGG	2	6	462559	462564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014718	TCG	2	6	462603	462608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014718	AGA	2	6	462629	462634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014718	CGT	2	6	462709	462714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_014718	GTC	3	9	462726	462734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_014718	CCAGC	2	10	462850	462859	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1132	NC_014718	CGC	2	6	462896	462901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_014718	TGCCC	2	10	462907	462916	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1134	NC_014718	ATTTAA	2	12	462959	462970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014718	AGG	2	6	463045	463050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_014718	GACA	2	8	567793	567800	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1403	NC_014718	GTA	2	6	567891	567896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_014718	ACG	2	6	568051	568056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_014718	ACC	2	6	568057	568062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_014718	GCC	2	6	568082	568087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1442	NC_014718	GC	3	6	572980	572985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1449	NC_014718	CG	3	6	573302	573307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1454	NC_014718	TA	3	6	573572	573577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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