MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014638	ACAT	2	8	1746	1753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014638	AGGA	2	8	5419	5426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014638	GACG	2	8	11609	11616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014638	TGGC	2	8	12364	12371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014638	CGTG	2	8	12435	12442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014638	GCCG	2	8	15231	15238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014638	CGGC	2	8	16593	16600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014638	TCGG	2	8	16649	16656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014638	TGGC	2	8	16793	16800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014638	GTTT	2	8	16894	16901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014638	GACC	2	8	17888	17895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014638	GCTC	2	8	18056	18063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014638	GTTG	2	8	22106	22113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014638	TGCG	2	8	23276	23283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014638	GCTG	2	8	34332	34339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014638	ATCT	2	8	34504	34511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014638	TAGA	2	8	34622	34629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014638	GAAA	2	8	36032	36039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014638	GAAA	2	8	36668	36675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014638	CGGC	2	8	36973	36980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014638	GCCG	2	8	39585	39592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014638	CATG	2	8	39718	39725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014638	CTGC	2	8	39726	39733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014638	GTCA	2	8	40573	40580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014638	CCCG	2	8	41770	41777	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_014638	GCCG	2	8	43307	43314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014638	CTCA	2	8	49436	49443	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014638	TGAT	2	8	49642	49649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014638	TGCG	2	8	49759	49766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014638	CGCC	2	8	55911	55918	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_014638	GCGG	2	8	56086	56093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014638	GCTG	2	8	57859	57866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014638	ATCT	2	8	57937	57944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014638	TAGA	2	8	58055	58062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014638	TGCT	2	8	59369	59376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014638	GGCG	2	8	60170	60177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014638	CGGC	2	8	60657	60664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014638	GAGG	2	8	61383	61390	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014638	TCCG	2	8	62698	62705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014638	GCCA	2	8	62782	62789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014638	TCAG	2	8	68196	68203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014638	GCAC	2	8	68323	68330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014638	ACGA	2	8	68367	68374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014638	GTTT	2	8	68473	68480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014638	GCCC	2	8	77763	77770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014638	TGGT	2	8	79314	79321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014638	ACCA	2	8	83376	83383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014638	CAGG	2	8	83388	83395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014638	GGCC	2	8	83407	83414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014638	CCAC	2	8	84288	84295	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014638	GGCG	2	8	84547	84554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014638	CGTC	2	8	88990	88997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014638	GTTT	2	8	89210	89217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014638	TCTT	2	8	92148	92155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014638	ACGA	2	8	96776	96783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014638	TGTA	2	8	98412	98419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014638	AAGT	2	8	98778	98785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014638	TCGT	2	8	99334	99341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014638	GAAT	2	8	101702	101709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014638	GCGT	2	8	101932	101939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014638	GCGG	2	8	102939	102946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014638	GCCT	2	8	102963	102970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014638	CGGC	2	8	104161	104168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014638	TGCG	2	8	107931	107938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014638	GATA	2	8	109713	109720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014638	GCTG	2	8	111200	111207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014638	GTCG	2	8	116822	116829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014638	CATC	2	8	116938	116945	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014638	GCCG	2	8	131886	131893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014638	CCCG	2	8	131936	131943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_014638	CGCC	2	8	134217	134224	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_014638	TCTA	2	8	137392	137399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014638	AGAT	2	8	137510	137517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014638	CGCC	2	8	142503	142510	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_014638	CGCC	2	8	144549	144556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_014638	ATTC	2	8	146114	146121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014638	CGAA	2	8	148357	148364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014638	GATG	2	8	153789	153796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014638	AGAA	2	8	153906	153913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014638	TCGT	2	8	155711	155718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014638	GCTC	2	8	155978	155985	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014638	GTGG	2	8	158413	158420	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014638	CAAT	2	8	159522	159529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014638	TAAA	2	8	159654	159661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014638	CCGG	2	8	161217	161224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014638	GTCG	2	8	162340	162347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014638	TGTC	2	8	168877	168884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014638	AGCG	2	8	170918	170925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014638	GTCG	2	8	172055	172062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014638	GACT	2	8	172065	172072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014638	ATCT	2	8	181315	181322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014638	AGAT	2	8	181434	181441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014638	GGGT	2	8	181670	181677	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014638	GTTG	2	8	182333	182340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014638	TGGA	2	8	187935	187942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014638	GCGG	2	8	191125	191132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014638	GGCC	2	8	191151	191158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014638	GTTC	2	8	191450	191457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014638	GCTC	2	8	194312	194319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014638	GGAA	2	8	197131	197138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014638	TGAT	3	12	198078	198089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014638	TATC	2	8	198099	198106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014638	AGAA	2	8	199945	199952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014638	GTCC	2	8	200803	200810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014638	CGTT	2	8	200934	200941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014638	CACG	2	8	200970	200977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014638	CATC	2	8	202497	202504	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014638	CGTG	2	8	203903	203910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014638	CGAT	2	8	205678	205685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014638	AGGA	2	8	206113	206120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014638	ACCT	2	8	207957	207964	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014638	AGGT	2	8	207976	207983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014638	GGAA	2	8	210367	210374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014638	TTGC	2	8	210386	210393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014638	GATG	2	8	216117	216124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014638	GCTC	2	8	216287	216294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014638	AGAA	2	8	220453	220460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014638	TCCA	2	8	220759	220766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014638	GAAA	2	8	222624	222631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014638	GGTG	2	8	222994	223001	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014638	ACCG	2	8	223669	223676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014638	CGGT	2	8	223808	223815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014638	CGGT	2	8	223887	223894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014638	GGCC	2	8	223907	223914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014638	GCGT	2	8	226535	226542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014638	CAGC	2	8	226560	226567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014638	GTAA	2	8	226622	226629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014638	CGTG	2	8	230663	230670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014638	CTGG	2	8	231067	231074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014638	GGCC	2	8	231141	231148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014638	CTGA	2	8	237331	237338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014638	AAGC	2	8	239814	239821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014638	GTTC	2	8	242131	242138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014638	CAAT	2	8	242242	242249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014638	ATTG	2	8	242258	242265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014638	GGGT	2	8	244579	244586	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014638	GCCG	3	12	244672	244683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014638	AGAC	2	8	244703	244710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014638	GCCG	2	8	245409	245416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014638	GGAG	2	8	247726	247733	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014638	CGGC	2	8	247837	247844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014638	CGGG	2	8	249039	249046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014638	GCCA	2	8	250079	250086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014638	TCGG	2	8	250158	250165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014638	ATCT	2	8	250239	250246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014638	AGAT	2	8	250347	250354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014638	CGGG	2	8	250846	250853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014638	GAGC	2	8	250950	250957	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014638	TACA	2	8	251012	251019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014638	TTCT	2	8	251439	251446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014638	AGTG	2	8	251484	251491	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014638	TCGT	2	8	253186	253193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014638	TTGG	2	8	254521	254528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014638	CGTC	2	8	256566	256573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014638	GACT	2	8	259159	259166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_014638	TCAT	2	8	271041	271048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_014638	CGCA	2	8	273100	273107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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177	NC_014638	GTCT	2	8	279932	279939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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184	NC_014638	CCGA	2	8	290264	290271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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193	NC_014638	GCAC	2	8	304940	304947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_014638	AGGA	2	8	308422	308429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_014638	TTGT	2	8	332872	332879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_014638	GCCG	2	8	463186	463193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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301	NC_014638	CCGC	2	8	475322	475329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
302	NC_014638	GACG	2	8	475840	475847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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311	NC_014638	ATTC	2	8	499432	499439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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334	NC_014638	CATG	2	8	565309	565316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
335	NC_014638	CGGT	2	8	565321	565328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
336	NC_014638	GACG	2	8	565821	565828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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341	NC_014638	GTCG	2	8	579156	579163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
342	NC_014638	CCCG	2	8	584544	584551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
343	NC_014638	GACA	2	8	584792	584799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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345	NC_014638	GCTT	2	8	596274	596281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
346	NC_014638	GACG	2	8	600517	600524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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349	NC_014638	CCGG	2	8	602854	602861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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352	NC_014638	CTTA	2	8	624762	624769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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366	NC_014638	CCGG	2	8	655182	655189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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421	NC_014638	TCGC	2	8	786885	786892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
422	NC_014638	CGTG	3	12	792358	792369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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424	NC_014638	AGGG	2	8	792450	792457	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
425	NC_014638	TGAT	2	8	797219	797226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
426	NC_014638	GTGC	2	8	798838	798845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
427	NC_014638	AGCG	2	8	807453	807460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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430	NC_014638	TTTC	2	8	808726	808733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
431	NC_014638	CCGG	2	8	811093	811100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
432	NC_014638	GGCG	2	8	812981	812988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
433	NC_014638	AAGA	2	8	824718	824725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_014638	CTTG	2	8	841883	841890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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441	NC_014638	ATGA	2	8	858834	858841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014638	GGTG	2	8	861395	861402	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014638	GGCG	2	8	862073	862080	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
444	NC_014638	GGCC	2	8	862220	862227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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490	NC_014638	GGAA	2	8	962413	962420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014638	CGGC	2	8	986776	986783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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