MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 7668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014638	CCG	2	6	1741674	1741679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_014638	CGG	2	6	1741691	1741696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_014638	CCT	2	6	1742768	1742773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_014638	GCG	2	6	1742792	1742797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014638	GT	3	6	1742897	1742902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014638	CG	3	6	1742908	1742913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_014638	GCAGC	2	10	1742914	1742923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6008	NC_014638	TCG	2	6	1742940	1742945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_014638	AAT	2	6	1743951	1743956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_014638	CCG	2	6	1743989	1743994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_014638	ATC	2	6	1745040	1745045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014638	CGC	2	6	1745066	1745071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_014638	TCA	2	6	1745076	1745081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_014638	CAT	2	6	1745163	1745168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_014638	GCA	2	6	1746337	1746342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_014638	GCC	2	6	1746346	1746351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_014638	ATC	2	6	1746354	1746359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_014638	CGGG	2	8	1746374	1746381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_014638	CCCG	2	8	1746402	1746409	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6020	NC_014638	TA	3	6	1746430	1746435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014638	CAT	2	6	1746453	1746458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_014638	GCG	2	6	1748000	1748005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014638	ACA	2	6	1748146	1748151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_014638	TC	3	6	1748880	1748885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_014638	GCT	2	6	1748920	1748925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_014638	CGTG	2	8	1748998	1749005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_014638	CG	4	8	1749017	1749024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_014638	CCG	2	6	1749126	1749131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_014638	GC	3	6	1749138	1749143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_014638	CGG	2	6	1749150	1749155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_014638	CCCG	2	8	1749169	1749176	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6032	NC_014638	CGC	2	6	1749192	1749197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_014638	AGC	2	6	1749233	1749238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_014638	GAG	2	6	1749251	1749256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_014638	CA	3	6	1749276	1749281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_014638	GGA	2	6	1751086	1751091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_014638	GTC	2	6	1751099	1751104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_014638	GTC	2	6	1751189	1751194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014638	ATC	2	6	1751198	1751203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_014638	G	6	6	1751230	1751235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014638	CA	3	6	1751278	1751283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_014638	CGC	2	6	1751320	1751325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_014638	CGCA	2	8	1751330	1751337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_014638	CGC	2	6	1751353	1751358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_014638	TCG	3	9	1753011	1753019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_014638	GCCAC	2	10	1753122	1753131	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6047	NC_014638	TAT	2	6	1753161	1753166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_014638	GC	3	6	1753206	1753211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_014638	TTCG	2	8	1753212	1753219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_014638	ACA	2	6	1753257	1753262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_014638	CTT	3	9	1753292	1753300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_014638	ACC	2	6	1753340	1753345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_014638	CAA	2	6	1753366	1753371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_014638	CG	3	6	1753382	1753387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_014638	TGA	2	6	1753405	1753410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_014638	TA	3	6	1754703	1754708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_014638	TCACA	2	10	1754711	1754720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6058	NC_014638	TCA	2	6	1754732	1754737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_014638	CGG	2	6	1756877	1756882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_014638	ACG	2	6	1756885	1756890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014638	CGG	2	6	1756913	1756918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_014638	CGAT	2	8	1757573	1757580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_014638	CAG	2	6	1760287	1760292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_014638	GCC	2	6	1760299	1760304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_014638	GGC	2	6	1761912	1761917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_014638	CGGCG	2	10	1762679	1762688	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6067	NC_014638	CCAC	2	8	1762718	1762725	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6068	NC_014638	TTC	2	6	1762734	1762739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014638	TCG	2	6	1762769	1762774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_014638	GAG	2	6	1764253	1764258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_014638	CAC	2	6	1764334	1764339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_014638	CT	3	6	1764346	1764351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_014638	ATG	2	6	1764383	1764388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6075	NC_014638	CCG	2	6	1764536	1764541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_014638	TCC	2	6	1764552	1764557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_014638	CG	3	6	1764565	1764570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_014638	GCA	2	6	1764585	1764590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6080	NC_014638	GA	3	6	1764610	1764615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_014638	ACA	2	6	1764676	1764681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_014638	TGT	2	6	1764706	1764711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6084	NC_014638	GC	3	6	1764786	1764791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_014638	TCG	2	6	1764896	1764901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6090	NC_014638	ATGCA	2	10	1768659	1768668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6091	NC_014638	GCG	2	6	1768689	1768694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6093	NC_014638	CACTG	2	10	1769336	1769345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6094	NC_014638	TCC	2	6	1769360	1769365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_014638	CGCC	2	8	1769375	1769382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6096	NC_014638	AGGC	2	8	1769395	1769402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6100	NC_014638	TG	4	8	1770066	1770073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014638	CGA	2	6	1775905	1775910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014638	CG	3	6	1775921	1775926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_014638	CGC	2	6	1775928	1775933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_014638	GGA	2	6	1775952	1775957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_014638	ACG	2	6	1775975	1775980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_014638	AT	3	6	1776075	1776080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014638	GC	3	6	1776098	1776103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_014638	CCGCG	2	10	1776114	1776123	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6110	NC_014638	CA	3	6	1776146	1776151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_014638	TG	3	6	1776296	1776301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_014638	CA	3	6	1776315	1776320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_014638	GTG	2	6	1776345	1776350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6117	NC_014638	ACG	2	6	1778007	1778012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_014638	CGA	2	6	1778079	1778084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_014638	CG	3	6	1778107	1778112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_014638	AAG	2	6	1778125	1778130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_014638	TCC	2	6	1782956	1782961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_014638	GTG	2	6	1782964	1782969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_014638	CCT	2	6	1782989	1782994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_014638	T	7	7	1783004	1783010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_014638	GC	3	6	1783013	1783018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_014638	AC	3	6	1783042	1783047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_014638	CAG	2	6	1783087	1783092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_014638	GAC	2	6	1783099	1783104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_014638	ACA	2	6	1783118	1783123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_014638	CCCG	2	8	1783179	1783186	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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6132	NC_014638	TTCC	2	8	1785326	1785333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6259	NC_014638	ACC	2	6	1824516	1824521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6260	NC_014638	CAA	2	6	1824522	1824527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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