MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014616	TCGCGT	2	12	15280	15291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014616	AGGCGA	2	12	40481	40492	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014616	GCATAT	2	12	40739	40750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014616	GCTGAT	2	12	44781	44792	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014616	TTACAT	2	12	56115	56126	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014616	AGTTCA	2	12	85134	85145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014616	GGATGC	2	12	98170	98181	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014616	GTTCAA	2	12	118738	118749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014616	TGCTTT	2	12	128631	128642	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014616	CGACCT	2	12	186174	186185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014616	TGCGGA	2	12	192610	192621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014616	AAACAA	2	12	200778	200789	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014616	ACGGGT	2	12	205237	205248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014616	GCGGGA	2	12	220577	220588	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014616	AGGCGA	2	12	277836	277847	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014616	GGCCGG	2	12	296814	296825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014616	AGGACG	2	12	300423	300434	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014616	CCACCC	2	12	323506	323517	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_014616	AAATAG	2	12	340319	340330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014616	TTTAAT	2	12	345793	345804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014616	ATGAAC	2	12	363938	363949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014616	CGCGTC	2	12	370869	370880	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014616	ACATCA	2	12	375590	375601	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014616	CCGCAA	2	12	377891	377902	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014616	GAGCGC	2	12	384198	384209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014616	GCCCCG	2	12	392907	392918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014616	GCGTGC	2	12	420331	420342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014616	TTTTGC	2	12	423864	423875	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014616	CCGATA	2	12	435214	435225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014616	CCGACG	2	12	445041	445052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014616	TTGATG	2	12	470415	470426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014616	CAAACA	2	12	481407	481418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014616	GATGCG	2	12	500705	500716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014616	AACGTC	2	12	560301	560312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014616	TGGCGA	2	12	623039	623050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014616	GGCGAA	2	12	668782	668793	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014616	TGCGAA	2	12	674158	674169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014616	CCGTGC	2	12	676866	676877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014616	TGCGCC	2	12	684222	684233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014616	CTTCGG	2	12	684277	684288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014616	GCGGTG	2	12	716610	716621	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014616	CCGTGT	2	12	717262	717273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014616	CTTGCG	2	12	747556	747567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014616	GTTTTT	2	12	767438	767449	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014616	GTATCG	2	12	787557	787568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014616	TTTCGT	2	12	812751	812762	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014616	AACCGG	2	12	815204	815215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014616	GAGTGA	2	12	822806	822817	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014616	CAAAAA	2	12	919296	919307	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014616	TCCCGC	2	12	946365	946376	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014616	AGTCGA	2	12	972849	972860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014616	GATTGG	2	12	978153	978164	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014616	CGCGTT	2	12	1011200	1011211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014616	CCCGCT	2	12	1048811	1048822	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014616	GGGTGG	2	12	1050620	1050631	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014616	CAGTGA	2	12	1058871	1058882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014616	CGAGCG	2	12	1106337	1106348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014616	CTGCCG	2	12	1152349	1152360	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014616	CGTCAC	2	12	1251708	1251719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014616	CGCGGC	2	12	1251726	1251737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014616	CGGGTA	2	12	1257668	1257679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014616	AACGCA	2	12	1259100	1259111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014616	CCCGTT	2	12	1273756	1273767	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014616	CCCGCG	2	12	1289179	1289190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014616	AGTGAT	2	12	1333741	1333752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014616	TCCGGC	2	12	1337865	1337876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014616	GACGCC	2	12	1355041	1355052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014616	GGTTTT	2	12	1430447	1430458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014616	CCGGTT	2	12	1430509	1430520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014616	CGTTCG	2	12	1457622	1457633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014616	ATATGC	2	12	1468348	1468359	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014616	CAACGG	2	12	1485430	1485441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014616	CATCAG	2	12	1493561	1493572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014616	GCTTGC	2	12	1499305	1499316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014616	GCCCAC	2	12	1502505	1502516	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014616	CCAATC	2	12	1523984	1523995	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014616	CGATGA	2	12	1533336	1533347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014616	CGCGCC	2	12	1564897	1564908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014616	CCGCGT	2	12	1568888	1568899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014616	AGCGCC	2	12	1578461	1578472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014616	GGCCTC	2	12	1582819	1582830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014616	ATCGGC	2	12	1626091	1626102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014616	GCCGGC	2	12	1629769	1629780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014616	ATCAAT	2	12	1639557	1639568	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014616	CGGCAT	2	12	1639894	1639905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014616	CATTGC	2	12	1645408	1645419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014616	AGAAAA	2	12	1657463	1657474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014616	CGAAAC	2	12	1660215	1660226	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014616	TGCGGC	2	12	1669705	1669716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014616	CTGAGG	2	12	1669740	1669751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014616	GTTCTT	2	12	1691942	1691953	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014616	GTGACG	2	12	1776626	1776637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014616	GCGGAT	2	12	1864546	1864557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014616	TAGGCG	2	12	1937960	1937971	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014616	CGTCAC	2	12	1973392	1973403	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014616	CCGGCC	2	12	1999383	1999394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014616	CCTTGC	2	12	2008321	2008332	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014616	CGTCAA	2	12	2054973	2054984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014616	TCGGCA	2	12	2056222	2056233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014616	ATGCCG	2	12	2071320	2071331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014616	CATTTC	2	12	2082830	2082841	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014616	TATGGT	2	12	2092322	2092333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014616	TCGAAA	2	12	2097151	2097162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014616	TTTTCA	2	12	2113062	2113073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014616	CGCGCC	2	12	2119048	2119059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014616	CGCGCC	2	12	2126156	2126167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014616	ATGCCG	2	12	2133235	2133246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014616	CATCCC	2	12	2163840	2163851	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.