MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014616	ACAT	2	8	1746	1753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014616	AGGA	2	8	5420	5427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014616	TGGC	2	8	12363	12370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014616	GCCG	2	8	15158	15165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014616	CGGC	2	8	16520	16527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014616	TGGC	2	8	16720	16727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014616	GTTT	2	8	16822	16829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014616	GCCA	2	8	17541	17548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014616	CTTA	2	8	18219	18226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014616	GCTG	2	8	29219	29226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014616	ATCT	2	8	29390	29397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014616	TAGA	2	8	29508	29515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014616	GAAA	2	8	30918	30925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014616	GAAA	2	8	31554	31561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014616	CGGC	2	8	31859	31866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014616	CTGC	2	8	34612	34619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014616	TTCC	2	8	35126	35133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014616	GTCA	2	8	35463	35470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014616	CCCG	2	8	36660	36667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_014616	GCCT	2	8	38065	38072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014616	GCCG	2	8	38197	38204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014616	ACGA	2	8	44872	44879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014616	CTCA	2	8	46074	46081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014616	TGAT	2	8	46280	46287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014616	TGCG	2	8	46397	46404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014616	GCTG	2	8	54500	54507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014616	ATCT	2	8	54578	54585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014616	TAGA	2	8	54696	54703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014616	TGCT	2	8	56011	56018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014616	GAGG	2	8	58026	58033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014616	GCCA	2	8	59426	59433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014616	CAGA	2	8	62129	62136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014616	ATGA	2	8	63351	63358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014616	TCGG	2	8	63436	63443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014616	CAGG	2	8	65734	65741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014616	TACA	2	8	65784	65791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014616	GAAG	2	8	67167	67174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014616	ATCC	2	8	70148	70155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014616	TATG	2	8	70170	70177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014616	AGGT	2	8	70271	70278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014616	CGTC	2	8	71254	71261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014616	GCGG	2	8	71284	71291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014616	TGCG	2	8	71362	71369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014616	GAAA	2	8	74270	74277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014616	TGTA	2	8	84788	84795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014616	CATA	2	8	84990	84997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014616	CGTT	2	8	88663	88670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014616	GGAC	2	8	88710	88717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014616	GCCT	2	8	88724	88731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014616	CAAT	2	8	89064	89071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014616	AAAG	2	8	89378	89385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014616	GGAA	2	8	94518	94525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014616	CCGG	2	8	98137	98144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014616	TCCC	2	8	99504	99511	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_014616	CATC	2	8	104286	104293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014616	AAGT	2	8	118757	118764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014616	GAAT	2	8	122054	122061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014616	GCGT	2	8	122282	122289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014616	GGAA	2	8	123093	123100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014616	GGTG	2	8	123106	123113	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014616	GCGG	2	8	123290	123297	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014616	GCCT	2	8	123314	123321	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014616	CGGC	2	8	124762	124769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014616	GCCT	2	8	128241	128248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014616	TGCG	2	8	128619	128626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014616	GATA	2	8	130402	130409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014616	GCTG	2	8	131889	131896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014616	GCCG	2	8	152553	152560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014616	CCCG	2	8	152603	152610	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_014616	CGCC	2	8	154896	154903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_014616	TCTA	2	8	158071	158078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014616	AGAT	2	8	158189	158196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014616	CTGT	2	8	162522	162529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014616	CAGA	2	8	165209	165216	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014616	ATTC	2	8	166883	166890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014616	CGAA	2	8	169141	169148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014616	GCGG	2	8	173136	173143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014616	ATGG	2	8	174843	174850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014616	TACT	2	8	181025	181032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014616	ACCT	2	8	181054	181061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014616	TAGG	2	8	181083	181090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014616	CTAA	2	8	183724	183731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014616	ACGC	2	8	184127	184134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014616	CGGT	2	8	185707	185714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014616	GCCA	2	8	185760	185767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014616	GCTG	2	8	185877	185884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014616	TAGG	2	8	187523	187530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014616	CCGG	2	8	189048	189055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014616	GTCG	2	8	190171	190178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014616	CCGG	2	8	198765	198772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014616	TGTC	2	8	198878	198885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014616	ACAG	2	8	198903	198910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014616	AGCG	2	8	200920	200927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014616	GTCG	2	8	202057	202064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014616	GACT	2	8	202067	202074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014616	CCTG	2	8	202197	202204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014616	ATCT	2	8	211318	211325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014616	AGAT	2	8	211437	211444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014616	GTTG	2	8	212336	212343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014616	TGGA	2	8	217938	217945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014616	GGCG	2	8	220369	220376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014616	GTTC	2	8	221920	221927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014616	GCGA	2	8	222222	222229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014616	GACA	2	8	222504	222511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014616	CCGA	2	8	224817	224824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014616	TTGA	2	8	224862	224869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014616	TAAC	2	8	227565	227572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014616	CCAG	2	8	227760	227767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014616	ACCG	2	8	235118	235125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014616	GGAA	2	8	235719	235726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014616	CGGT	2	8	237035	237042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014616	GGCC	2	8	237055	237062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014616	GTAA	2	8	239763	239770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014616	CGTG	2	8	243804	243811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014616	CTGG	2	8	244218	244225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014616	GGCC	2	8	244292	244299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014616	CTGA	2	8	250482	250489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014616	AAGC	2	8	252965	252972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014616	GTTC	2	8	255282	255289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014616	CAAT	2	8	255393	255400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014616	ATTG	2	8	255409	255416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014616	GCCG	3	12	257820	257831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014616	AGAC	2	8	257851	257858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014616	GCCG	2	8	258557	258564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014616	GGAG	2	8	260856	260863	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014616	CGGC	2	8	260967	260974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014616	TAGA	2	8	261010	261017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014616	CGGG	2	8	262169	262176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014616	GCCA	2	8	263209	263216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014616	TCGG	2	8	263288	263295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014616	ATCT	2	8	263369	263376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014616	AGAT	2	8	263477	263484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014616	CGGG	2	8	263976	263983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014616	GAGC	2	8	264080	264087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014616	TACA	2	8	264142	264149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014616	AGTG	2	8	264614	264621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014616	TCGT	2	8	266316	266323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014616	TCGT	2	8	267047	267054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014616	TTGG	2	8	267653	267660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014616	CGTC	2	8	269697	269704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014616	GACT	2	8	272291	272298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014616	CAGC	2	8	273106	273113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014616	GTTG	2	8	273131	273138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014616	CCGT	2	8	277828	277835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014616	GCCG	2	8	277848	277855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014616	ATCT	2	8	278018	278025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014616	AGAT	2	8	278137	278144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014616	TGCC	2	8	278393	278400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014616	CGGC	2	8	278441	278448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014616	GAAT	2	8	281256	281263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014616	GATG	2	8	284106	284113	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014616	TCAT	2	8	284172	284179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014616	GTAT	2	8	285013	285020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014616	CGAA	2	8	285149	285156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014616	CGCA	2	8	286231	286238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NC_014616	AGAA	2	8	286397	286404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014616	TTGC	2	8	293008	293015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_014616	GCGA	2	8	293022	293029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_014616	GTCT	2	8	293061	293068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_014616	ATCT	2	8	293194	293201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_014616	AGAT	2	8	293313	293320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014616	CGTT	2	8	294472	294479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_014616	GAAA	2	8	294522	294529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014616	CAAG	2	8	296662	296669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_014616	GCCG	2	8	301472	301479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_014616	TTGT	2	8	305219	305226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014616	CCTC	2	8	307305	307312	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
170	NC_014616	ACGG	2	8	307320	307327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_014616	ATTC	2	8	307676	307683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_014616	GAAG	2	8	307760	307767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014616	TGCC	2	8	309098	309105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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180	NC_014616	CCTC	2	8	321979	321986	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
181	NC_014616	CCTC	2	8	323470	323477	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
182	NC_014616	GCGG	2	8	323717	323724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_014616	ATGG	2	8	340376	340383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_014616	GACA	2	8	597608	597615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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296	NC_014616	GCTT	2	8	609101	609108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
297	NC_014616	GACG	2	8	613348	613355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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493	NC_014616	GCTT	2	8	1175044	1175051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_014616	CATT	2	8	1191375	1191382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
495	NC_014616	CTCA	2	8	1191464	1191471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_014616	CTTC	2	8	1196301	1196308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_014616	GAAC	2	8	1196352	1196359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_014616	CGTC	2	8	1203048	1203055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_014616	GACG	2	8	1203072	1203079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_014616	GATG	2	8	1209026	1209033	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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