MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 6799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014616	TTG	2	6	267641	267646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014616	TTGG	2	8	267653	267660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014616	TCG	2	6	267684	267689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014616	CGC	2	6	267791	267796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_014616	T	6	6	268029	268034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014616	CGG	2	6	268054	268059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014616	CTA	2	6	268114	268119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014616	GGT	2	6	268258	268263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014616	TAC	2	6	268267	268272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_014616	GTC	2	6	269604	269609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_014616	CTG	2	6	269680	269685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_014616	CGTC	2	8	269697	269704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_014616	A	6	6	270674	270679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014616	AAT	2	6	270684	270689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014616	AT	3	6	270737	270742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014616	TTA	2	6	270782	270787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014616	GAG	2	6	270831	270836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014616	CAG	2	6	272273	272278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014616	GACT	2	8	272291	272298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_014616	C	8	8	272332	272339	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1021	NC_014616	CAGC	2	8	273106	273113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_014616	GTTG	2	8	273131	273138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014616	ATG	2	6	273196	273201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014616	TCG	2	6	277294	277299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014616	AAAGG	2	10	277327	277336	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014616	T	6	6	277796	277801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014616	GGT	2	6	277821	277826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014616	CCGT	2	8	277828	277835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_014616	AGGCGA	2	12	277836	277847	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1030	NC_014616	GCCG	2	8	277848	277855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_014616	GGT	2	6	277933	277938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014616	ATCT	2	8	278018	278025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_014616	AGAT	2	8	278137	278144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014616	TGA	3	9	278322	278330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014616	GCT	2	6	278359	278364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014616	TGCC	2	8	278393	278400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_014616	GCA	2	6	278412	278417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_014616	CGGC	2	8	278441	278448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_014616	CGC	2	6	278453	278458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_014616	CCG	2	6	278488	278493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_014616	GCC	2	6	278532	278537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_014616	AT	3	6	279786	279791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014616	CGT	2	6	279792	279797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_014616	CTC	2	6	281043	281048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_014616	CGA	2	6	281124	281129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014616	GATGT	2	10	281231	281240	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014616	GAAT	2	8	281256	281263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014616	AG	3	6	282609	282614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014616	CCG	2	6	282690	282695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_014616	TGC	2	6	284049	284054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_014616	TGG	2	6	284055	284060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014616	TGG	2	6	284085	284090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014616	GATG	2	8	284106	284113	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014616	TGG	2	6	284155	284160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014616	TCAT	2	8	284172	284179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_014616	CGT	2	6	284252	284257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014616	TCC	2	6	284972	284977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_014616	TCA	2	6	284988	284993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_014616	GTAT	2	8	285013	285020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014616	GGC	2	6	285066	285071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014616	TATGC	2	10	285111	285120	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_014616	CGAA	2	8	285149	285156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_014616	CGCA	2	8	286231	286238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_014616	ATA	2	6	286274	286279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014616	GGA	2	6	286294	286299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014616	AGCAC	2	10	286320	286329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1067	NC_014616	GGA	2	6	286346	286351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014616	AGAA	2	8	286397	286404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014616	GAG	2	6	286847	286852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014616	CAC	2	6	288799	288804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_014616	TA	3	6	291053	291058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014616	GGT	2	6	291095	291100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014616	CG	3	6	291127	291132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_014616	GCG	2	6	291156	291161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_014616	CCG	2	6	292224	292229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_014616	TTGC	2	8	293008	293015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_014616	GCGA	2	8	293022	293029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_014616	GTCT	2	8	293061	293068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_014616	CCA	2	6	293106	293111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_014616	T	6	6	293142	293147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014616	ATCT	2	8	293194	293201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_014616	AGAT	2	8	293313	293320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014616	GCG	2	6	293369	293374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_014616	CGG	2	6	293386	293391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014616	GT	3	6	294463	294468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014616	CGTT	2	8	294472	294479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_014616	GAAA	2	8	294522	294529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014616	A	7	7	294558	294564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014616	ATG	2	6	294569	294574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014616	ACG	2	6	294799	294804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_014616	TCG	2	6	294841	294846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_014616	CGA	2	6	294869	294874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_014616	GC	3	6	294878	294883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_014616	GC	3	6	294973	294978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_014616	GCC	2	6	294995	295000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_014616	CAT	2	6	295024	295029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_014616	CG	3	6	295083	295088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_014616	CAA	2	6	295129	295134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014616	CCT	2	6	296338	296343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_014616	CGT	2	6	296363	296368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_014616	CAA	2	6	296381	296386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_014616	CGA	2	6	296643	296648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014616	CAAG	2	8	296662	296669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_014616	CGA	2	6	296671	296676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_014616	AGC	2	6	296701	296706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_014616	CGT	2	6	296747	296752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_014616	CGC	2	6	296753	296758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_014616	CAC	2	6	296762	296767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_014616	GAT	2	6	296768	296773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014616	GGCCGG	2	12	296814	296825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014616	CGC	2	6	296893	296898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_014616	ATA	2	6	296906	296911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014616	GAA	2	6	296912	296917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014616	CAT	2	6	299207	299212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_014616	TCG	2	6	299251	299256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_014616	CGA	2	6	299267	299272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_014616	GCC	2	6	299290	299295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_014616	GGC	2	6	299331	299336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_014616	TATT	2	8	299344	299351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014616	AAT	2	6	299389	299394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014616	GAG	2	6	299415	299420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014616	CCA	2	6	299872	299877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_014616	ATG	2	6	299883	299888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014616	CTG	2	6	299897	299902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014616	GC	3	6	299988	299993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_014616	ACG	2	6	299998	300003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014616	GC	3	6	300070	300075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_014616	C	8	8	300098	300105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1129	NC_014616	CGCTC	2	10	300111	300120	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1130	NC_014616	TA	3	6	300208	300213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014616	ATC	2	6	300237	300242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014616	GGT	2	6	300271	300276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014616	ATG	2	6	300341	300346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014616	CG	3	6	300378	300383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_014616	AGGACG	2	12	300423	300434	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1136	NC_014616	GCCG	2	8	301472	301479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_014616	CG	3	6	303354	303359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_014616	CCGA	2	8	303396	303403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_014616	A	6	6	305179	305184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_014616	TCC	2	6	305189	305194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1151	NC_014616	GCG	2	6	307664	307669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1152	NC_014616	ATTC	2	8	307676	307683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1153	NC_014616	CCGGC	2	10	307706	307715	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1154	NC_014616	GGC	2	6	307734	307739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_014616	GC	3	6	307743	307748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1156	NC_014616	GAAG	2	8	307760	307767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_014616	TGCC	2	8	309098	309105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1171	NC_014616	GCC	2	6	312805	312810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1174	NC_014616	CGC	2	6	316395	316400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1175	NC_014616	CCGGC	2	10	316426	316435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1183	NC_014616	ACC	2	6	318006	318011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1224	NC_014616	CGG	2	6	325583	325588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1242	NC_014616	GGT	2	6	331650	331655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_014616	GC	3	6	334097	334102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1250	NC_014616	GTC	2	6	334148	334153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_014616	GCATC	2	10	334194	334203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1252	NC_014616	TAAG	2	8	334231	334238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_014616	GAA	2	6	334290	334295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_014616	ATA	2	6	334379	334384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_014616	ATG	2	6	334497	334502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_014616	AAATAG	2	12	340319	340330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_014616	GGC	2	6	340345	340350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_014616	T	6	6	340356	340361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_014616	ATGG	2	8	340376	340383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_014616	CGG	2	6	341566	341571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1264	NC_014616	GC	3	6	341610	341615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_014616	TC	3	6	344880	344885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1269	NC_014616	CAG	2	6	347445	347450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_014616	AC	3	6	347458	347463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1271	NC_014616	AGG	2	6	347499	347504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_014616	CG	3	6	348564	348569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1402	NC_014616	TGG	2	6	381637	381642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_014616	CGG	2	6	381647	381652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_014616	CG	3	6	381685	381690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1405	NC_014616	AAG	2	6	381693	381698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_014616	GAT	2	6	381844	381849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_014616	CGCT	2	8	382102	382109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1410	NC_014616	GGC	2	6	382127	382132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_014616	CGG	2	6	382186	382191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_014616	CCG	2	6	382196	382201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_014616	TGG	2	6	382259	382264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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