MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 6799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014616	CGA	2	6	164935	164940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_014616	GGA	2	6	164942	164947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014616	AT	3	6	165068	165073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014616	G	6	6	165134	165139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014616	CAGA	2	8	165209	165216	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_014616	GA	3	6	165215	165220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014616	CGG	2	6	165288	165293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014616	TGC	2	6	165295	165300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_014616	TTG	2	6	165306	165311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014616	CTG	2	6	166708	166713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014616	CGG	2	6	166724	166729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_014616	AGA	2	6	166802	166807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014616	TGC	2	6	166815	166820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_014616	ATTC	2	8	166883	166890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_014616	TC	3	6	166889	166894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_014616	GGC	2	6	166954	166959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014616	GC	3	6	166958	166963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_014616	CTG	2	6	166992	166997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_014616	GAT	2	6	168997	169002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014616	GTT	2	6	169085	169090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014616	GCC	2	6	169123	169128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_014616	CGAA	2	8	169141	169148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_014616	AAT	2	6	169162	169167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014616	TGC	2	6	169210	169215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_014616	TTG	2	6	169263	169268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014616	ACA	2	6	171552	171557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014616	CCG	2	6	171580	171585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_014616	GCC	3	9	173116	173124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_014616	GCGG	2	8	173136	173143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
530	NC_014616	ATC	2	6	173168	173173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014616	TCATT	2	10	173188	173197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_014616	GT	3	6	173242	173247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014616	GAC	2	6	174237	174242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_014616	TGC	2	6	174414	174419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014616	TGT	2	6	174425	174430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014616	GAA	2	6	174502	174507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014616	GCC	2	6	174657	174662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_014616	GTG	2	6	174703	174708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014616	ATGG	2	8	174843	174850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014616	CTT	2	6	179149	179154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_014616	GGC	2	6	179292	179297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014616	GGA	2	6	179314	179319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014616	GCT	2	6	179515	179520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014616	GAC	2	6	179615	179620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014616	CGA	2	6	179672	179677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_014616	CAG	2	6	179729	179734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014616	CAT	2	6	179777	179782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_014616	CCT	2	6	179793	179798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_014616	TGC	2	6	179806	179811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014616	ATCGG	2	10	179820	179829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
551	NC_014616	GCA	2	6	180131	180136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014616	AG	3	6	180159	180164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014616	GTG	2	6	180204	180209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014616	GAT	2	6	180227	180232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014616	CGA	2	6	180323	180328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_014616	ATC	2	6	180519	180524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014616	TACT	2	8	181025	181032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_014616	ACCT	2	8	181054	181061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_014616	TAGG	2	8	181083	181090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014616	GAT	2	6	181166	181171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014616	AG	3	6	181222	181227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014616	CGG	2	6	181230	181235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014616	ATG	2	6	181242	181247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014616	TGT	2	6	181252	181257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014616	CTG	2	6	181290	181295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014616	CGT	2	6	182039	182044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014616	CTAA	2	8	183724	183731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_014616	AGTTC	2	10	183763	183772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
569	NC_014616	GC	3	6	183813	183818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_014616	CA	3	6	183839	183844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_014616	G	7	7	183918	183924	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014616	TTG	2	6	183929	183934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014616	AGC	2	6	183976	183981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014616	CTG	2	6	184067	184072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014616	GAT	2	6	184087	184092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014616	ACGC	2	8	184127	184134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_014616	CGG	2	6	184165	184170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_014616	TCG	2	6	184194	184199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014616	TGG	2	6	184241	184246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014616	TG	3	6	184262	184267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014616	GGC	2	6	184296	184301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_014616	TGG	2	6	184357	184362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014616	GGA	2	6	184457	184462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014616	CAGGC	2	10	184470	184479	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
585	NC_014616	CAA	3	9	185676	185684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_014616	CGGT	2	8	185707	185714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_014616	GCCA	2	8	185760	185767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_014616	TGC	2	6	185771	185776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_014616	GC	3	6	185857	185862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_014616	GCTG	2	8	185877	185884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_014616	ACG	2	6	185938	185943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014616	CTA	2	6	185979	185984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_014616	CGA	2	6	186006	186011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_014616	GGC	2	6	186064	186069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014616	CGC	2	6	186135	186140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_014616	ATG	2	6	186155	186160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014616	TAA	2	6	186168	186173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014616	CGACCT	2	12	186174	186185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
599	NC_014616	GTG	2	6	186226	186231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014616	ACC	2	6	186301	186306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_014616	GAA	2	6	187412	187417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014616	TTG	2	6	187436	187441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014616	GAG	2	6	187479	187484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014616	TAGG	2	8	187523	187530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014616	CCA	2	6	187552	187557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_014616	G	6	6	187616	187621	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014616	CAG	2	6	187657	187662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014616	CGG	2	6	189040	189045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_014616	CCGG	2	8	189048	189055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_014616	GGT	2	6	189062	189067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014616	GTCG	2	8	190171	190178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
612	NC_014616	ATG	2	6	190223	190228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014616	GAT	2	6	190255	190260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014616	ATG	2	6	190280	190285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014616	CCG	2	6	192547	192552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_014616	CGG	2	6	192599	192604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_014616	TGCGGA	2	12	192610	192621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_014616	TAC	2	6	193971	193976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014616	TGT	2	6	195353	195358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014616	CGC	2	6	196512	196517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_014616	AAGAG	2	10	197050	197059	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014616	CCGG	2	8	198765	198772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_014616	CAT	2	6	198807	198812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014616	TGC	2	6	198838	198843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014616	TGTC	2	8	198878	198885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_014616	ACAG	2	8	198903	198910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
627	NC_014616	CGC	2	6	198921	198926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_014616	TGT	2	6	198930	198935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014616	TGT	2	6	198994	198999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014616	AGG	2	6	199047	199052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014616	CGC	2	6	199055	199060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_014616	TGC	2	6	199073	199078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_014616	CGC	2	6	199085	199090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_014616	ACC	2	6	199098	199103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_014616	GTT	2	6	199110	199115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014616	CTG	2	6	199116	199121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_014616	ATT	3	9	199131	199139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014616	T	7	7	199245	199251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014616	GA	4	8	199293	199300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014616	A	6	6	199308	199313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_014616	A	6	6	200762	200767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_014616	CAA	3	9	200768	200776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_014616	AAACAA	2	12	200778	200789	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
644	NC_014616	AGG	2	6	200850	200855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
645	NC_014616	AGCG	2	8	200920	200927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
646	NC_014616	CGG	2	6	200932	200937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_014616	CTCCG	2	10	202024	202033	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
648	NC_014616	GCC	2	6	202050	202055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
649	NC_014616	GTCG	2	8	202057	202064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
650	NC_014616	GACT	2	8	202067	202074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
651	NC_014616	GCC	2	6	202094	202099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_014616	GCG	2	6	202118	202123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_014616	CCTG	2	8	202197	202204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
654	NC_014616	GGC	2	6	202261	202266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_014616	CG	3	6	202346	202351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
656	NC_014616	GTT	2	6	203558	203563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
657	NC_014616	GAC	3	9	203583	203591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_014616	TG	3	6	203688	203693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
659	NC_014616	CA	3	6	203702	203707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
660	NC_014616	GA	3	6	203761	203766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
661	NC_014616	TGG	2	6	203875	203880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
662	NC_014616	GTC	2	6	203905	203910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_014616	GCC	2	6	204956	204961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
664	NC_014616	TGC	2	6	205039	205044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_014616	GTG	2	6	205047	205052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
666	NC_014616	GGA	2	6	205066	205071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
667	NC_014616	TG	3	6	205081	205086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
668	NC_014616	CA	3	6	205114	205119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
669	NC_014616	GA	3	6	205173	205178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
670	NC_014616	CA	3	6	205203	205208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
671	NC_014616	CCG	2	6	205228	205233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
672	NC_014616	ACGGGT	2	12	205237	205248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
673	NC_014616	CCT	2	6	209176	209181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_014616	GGT	2	6	209291	209296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
675	NC_014616	TGG	2	6	209377	209382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
676	NC_014616	CG	3	6	209421	209426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
677	NC_014616	GCG	2	6	209428	209433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_014616	CGT	2	6	211019	211024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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680	NC_014616	CGC	2	6	211092	211097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
681	NC_014616	CGC	2	6	211101	211106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
682	NC_014616	CAC	2	6	211224	211229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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685	NC_014616	AGAT	2	8	211437	211444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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687	NC_014616	CGG	2	6	212301	212306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
688	NC_014616	GTTG	2	8	212336	212343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
689	NC_014616	GTT	2	6	212359	212364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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701	NC_014616	GCC	2	6	220544	220549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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709	NC_014616	TG	3	6	221549	221554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
710	NC_014616	GAG	2	6	221592	221597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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713	NC_014616	ATC	2	6	221777	221782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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723	NC_014616	GACA	2	8	222504	222511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
724	NC_014616	ATT	2	6	222522	222527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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726	NC_014616	T	6	6	222642	222647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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741	NC_014616	CGG	2	6	224783	224788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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751	NC_014616	CGG	2	6	225202	225207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_014616	GAA	2	6	225242	225247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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756	NC_014616	GCC	2	6	225648	225653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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764	NC_014616	ACGTC	2	10	226123	226132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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766	NC_014616	CAC	2	6	226324	226329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
767	NC_014616	GCG	2	6	226384	226389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_014616	GTC	2	6	226439	226444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_014616	ACA	3	9	226498	226506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_014616	CA	5	10	226505	226514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
771	NC_014616	AGC	2	6	226516	226521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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