MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 6799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014616	GAC	2	6	1639551	1639556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_014616	ATCAAT	2	12	1639557	1639568	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5003	NC_014616	TGC	2	6	1639601	1639606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_014616	CAA	2	6	1639706	1639711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_014616	GAA	2	6	1639780	1639785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014616	GCTT	2	8	1639792	1639799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_014616	TCA	2	6	1639817	1639822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_014616	TA	3	6	1639851	1639856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014616	A	6	6	1639856	1639861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014616	CGGCAT	2	12	1639894	1639905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_014616	ATTC	2	8	1640792	1640799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_014616	GCC	2	6	1640805	1640810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_014616	CGG	2	6	1640819	1640824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_014616	CGG	2	6	1640838	1640843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_014616	C	9	9	1642005	1642013	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5016	NC_014616	AT	3	6	1642081	1642086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014616	GCC	2	6	1642125	1642130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_014616	CCGG	2	8	1642136	1642143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_014616	CAA	2	6	1644211	1644216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_014616	CCA	2	6	1644253	1644258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_014616	GCCGG	2	10	1644282	1644291	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5022	NC_014616	CGCGG	3	15	1644293	1644307	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5023	NC_014616	GCC	2	6	1644334	1644339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_014616	GC	3	6	1644354	1644359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_014616	GA	3	6	1644380	1644385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014616	CCA	2	6	1645315	1645320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_014616	CAC	2	6	1645326	1645331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_014616	ATC	2	6	1645384	1645389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_014616	CATTGC	2	12	1645408	1645419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_014616	TTC	2	6	1645424	1645429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_014616	GCG	2	6	1645490	1645495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_014616	TCG	2	6	1645521	1645526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_014616	TCCT	2	8	1645566	1645573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_014616	TCG	2	6	1645603	1645608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_014616	CG	3	6	1645642	1645647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_014616	CGC	2	6	1645669	1645674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_014616	GCC	2	6	1645694	1645699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_014616	CT	3	6	1646638	1646643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_014616	GCC	2	6	1648938	1648943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_014616	TGGTC	2	10	1648969	1648978	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5041	NC_014616	GCAT	2	8	1648992	1648999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_014616	CCAG	2	8	1650397	1650404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_014616	TCCTT	2	10	1651148	1651157	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5044	NC_014616	GCG	2	6	1651188	1651193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_014616	GCCG	2	8	1651218	1651225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_014616	CGT	2	6	1651249	1651254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_014616	GCCG	2	8	1651316	1651323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_014616	TACA	2	8	1651425	1651432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_014616	TACT	2	8	1651488	1651495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_014616	GA	3	6	1652483	1652488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014616	ACA	2	6	1652617	1652622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_014616	TGT	2	6	1652647	1652652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014616	ACCG	2	8	1652655	1652662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_014616	CAA	2	6	1652686	1652691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_014616	AC	3	6	1652693	1652698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_014616	TGCC	2	8	1652861	1652868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_014616	CAG	2	6	1653147	1653152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_014616	TCC	2	6	1653171	1653176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_014616	TGT	2	6	1653226	1653231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014616	GGC	2	6	1653240	1653245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_014616	GTA	2	6	1653279	1653284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_014616	CT	3	6	1655399	1655404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_014616	CGAG	2	8	1655425	1655432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_014616	GC	3	6	1655435	1655440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_014616	CGA	2	6	1655535	1655540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_014616	CTCG	2	8	1655649	1655656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_014616	CGA	2	6	1655669	1655674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_014616	GCT	2	6	1656535	1656540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_014616	CGTG	2	8	1656604	1656611	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_014616	AGC	2	6	1656657	1656662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_014616	CGC	2	6	1656686	1656691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_014616	CGG	2	6	1656716	1656721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_014616	TTTGA	2	10	1657386	1657395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014616	A	6	6	1657451	1657456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014616	AGAAAA	2	12	1657463	1657474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014616	CCGG	2	8	1657482	1657489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_014616	CCG	2	6	1657507	1657512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_014616	GCG	2	6	1657520	1657525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_014616	ATA	2	6	1657580	1657585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_014616	ACT	2	6	1657590	1657595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_014616	GAG	2	6	1658277	1658282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014616	CAG	2	6	1658288	1658293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_014616	CCA	2	6	1658413	1658418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_014616	TCT	2	6	1658426	1658431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_014616	CGA	2	6	1658432	1658437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_014616	CGG	2	6	1658490	1658495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_014616	GTACA	2	10	1658595	1658604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5088	NC_014616	CGA	2	6	1659741	1659746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_014616	TCG	2	6	1659761	1659766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_014616	GCCG	2	8	1659802	1659809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_014616	CGC	2	6	1659832	1659837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_014616	GT	3	6	1659966	1659971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014616	AACC	2	8	1659976	1659983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_014616	GGT	2	6	1659985	1659990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014616	TGT	2	6	1660023	1660028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014616	TCA	2	6	1660030	1660035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_014616	GAT	2	6	1660055	1660060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014616	CGAAAC	2	12	1660215	1660226	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_014616	CCAGA	2	10	1660264	1660273	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5100	NC_014616	CA	3	6	1660340	1660345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_014616	GCTT	2	8	1660361	1660368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_014616	AAGG	2	8	1660381	1660388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014616	GCC	2	6	1660395	1660400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_014616	CTT	2	6	1660419	1660424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_014616	ACG	2	6	1661181	1661186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_014616	AGC	2	6	1661259	1661264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_014616	TCC	2	6	1661268	1661273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_014616	TCCC	2	8	1662868	1662875	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5109	NC_014616	C	7	7	1662873	1662879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5110	NC_014616	GGC	2	6	1662893	1662898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_014616	CGC	2	6	1662908	1662913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_014616	C	6	6	1663049	1663054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5113	NC_014616	TAT	2	6	1663128	1663133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014616	GAA	2	6	1664830	1664835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014616	TCC	2	6	1664881	1664886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_014616	G	10	10	1664914	1664923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_014616	GAG	2	6	1664949	1664954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014616	CCT	2	6	1664977	1664982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_014616	TTG	2	6	1668372	1668377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014616	AGG	2	6	1668388	1668393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014616	TCG	2	6	1668397	1668402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014616	GATG	2	8	1668408	1668415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014616	AGCAA	2	10	1668423	1668432	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5124	NC_014616	CAC	2	6	1668452	1668457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_014616	TCA	2	6	1668563	1668568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_014616	CCGA	2	8	1668595	1668602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_014616	CTG	2	6	1668623	1668628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_014616	TA	4	8	1668684	1668691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014616	GCG	2	6	1669658	1669663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014616	TGCGGC	2	12	1669705	1669716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_014616	CTGAGG	2	12	1669740	1669751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5132	NC_014616	TGCA	2	8	1669901	1669908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5133	NC_014616	CT	3	6	1669986	1669991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5134	NC_014616	ACC	2	6	1670119	1670124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5135	NC_014616	TGG	3	9	1672238	1672246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_014616	ACC	2	6	1672250	1672255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5137	NC_014616	TCTCC	2	10	1673175	1673184	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5138	NC_014616	CGG	2	6	1673199	1673204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5141	NC_014616	GTC	2	6	1673834	1673839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5143	NC_014616	GGCA	2	8	1673856	1673863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5145	NC_014616	CAT	2	6	1679207	1679212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5155	NC_014616	CGC	3	9	1685893	1685901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5164	NC_014616	ATG	2	6	1687565	1687570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_014616	TTCA	2	8	1712195	1712202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5246	NC_014616	CGGT	2	8	1712234	1712241	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5247	NC_014616	GATG	2	8	1713183	1713190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_014616	TG	3	6	1713222	1713227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_014616	CA	3	6	1713236	1713241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5250	NC_014616	CGC	2	6	1713293	1713298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5251	NC_014616	TG	3	6	1713520	1713525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_014616	GAC	2	6	1713544	1713549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_014616	GAG	2	6	1713555	1713560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_014616	CTC	2	6	1713993	1713998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5255	NC_014616	CAA	2	6	1714058	1714063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_014616	CAT	2	6	1714064	1714069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_014616	CCG	2	6	1714074	1714079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5258	NC_014616	CGG	2	6	1714091	1714096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_014616	TGCA	2	8	1714103	1714110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5260	NC_014616	CCT	2	6	1715168	1715173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_014616	GCG	2	6	1715192	1715197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_014616	GT	3	6	1715297	1715302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_014616	CG	3	6	1715308	1715313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5264	NC_014616	GCAGC	2	10	1715314	1715323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5265	NC_014616	TCG	2	6	1715340	1715345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5267	NC_014616	CCG	2	6	1716389	1716394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5270	NC_014616	CAT	2	6	1717562	1717567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5273	NC_014616	ATC	2	6	1718753	1718758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5275	NC_014616	CCCG	2	8	1718801	1718808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5276	NC_014616	TA	3	6	1718829	1718834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5282	NC_014616	CG	4	8	1721416	1721423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5283	NC_014616	GTC	2	6	1723588	1723593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5287	NC_014616	CGCA	2	8	1723731	1723738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5288	NC_014616	CGC	2	6	1723754	1723759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5292	NC_014616	TTCG	2	8	1725613	1725620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5293	NC_014616	ACA	2	6	1725658	1725663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5294	NC_014616	CTT	3	9	1725693	1725701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5300	NC_014616	TCACA	2	10	1727112	1727121	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5327	NC_014616	CGC	2	6	1748361	1748366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5362	NC_014616	CAAAA	2	10	1759987	1759996	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5369	NC_014616	CGCA	2	8	1760520	1760527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5382	NC_014616	TCCCC	2	10	1762180	1762189	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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5388	NC_014616	GTG	2	6	1764439	1764444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_014616	CAC	2	6	1764518	1764523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5500	NC_014616	TTAA	2	8	1812212	1812219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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