MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 2

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014540	GAAACG	2	12	32546	32557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014540	CGCCCG	2	12	62505	62516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014540	TGCGGG	2	12	104119	104130	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014540	TGCCGC	2	12	112720	112731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014540	TGCGCT	2	12	121516	121527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014540	TGTGGC	8	48	136128	136175	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014540	GTGGCT	2	12	136177	136188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014540	GCCGTG	2	12	136193	136204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014540	GCATGC	2	12	187364	187375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014540	TGTCGG	2	12	191782	191793	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014540	ACACGC	2	12	197184	197195	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014540	GAAGGC	2	12	211776	211787	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014540	GCAATC	2	12	214615	214626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014540	AAAGCG	2	12	226176	226187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014540	CGGCGT	2	12	226275	226286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014540	CGGCCG	2	12	232788	232799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014540	GCACGG	2	12	323690	323701	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014540	CGCCCG	2	12	323952	323963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014540	CGGGGC	2	12	329881	329892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014540	GTTTTG	2	12	332299	332310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014540	CGACCG	2	12	338518	338529	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014540	TACCGA	2	12	365239	365250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014540	GGCCGC	2	12	383751	383762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014540	GCAACG	2	12	409921	409932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014540	GCAGTG	2	12	452471	452482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014540	ACCGTG	2	12	452662	452673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014540	CTGCAA	2	12	499203	499214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014540	CGTGCC	2	12	506581	506592	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014540	AAAAAT	2	12	515690	515701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014540	ATGGCG	2	12	562176	562187	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014540	CATGCG	2	12	621033	621044	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014540	AACAAT	2	12	637210	637221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014540	AGTCTG	2	12	701778	701789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014540	TTCGGG	2	12	772958	772969	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014540	TGTGTT	2	12	785756	785767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014540	GCCCGC	2	12	833318	833329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014540	GCGGCT	2	12	848009	848020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014540	GCGAGC	2	12	884970	884981	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014540	GCGCAC	2	12	908996	909007	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014540	TCCGCC	2	12	947996	948007	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014540	TGTTGG	2	12	957524	957535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014540	CCGGCG	2	12	966850	966861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014540	CGCCAC	2	12	970753	970764	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014540	AACCGT	2	12	1019434	1019445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014540	TGCCAA	2	12	1021279	1021290	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014540	TGCCGC	7	42	1021393	1021434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014540	GGCATT	2	12	1048703	1048714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014540	AGCACG	2	12	1060331	1060342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014540	GCACAA	2	12	1073639	1073650	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014540	GCGCGA	2	12	1106864	1106875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014540	ACTGCA	2	12	1130174	1130185	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014540	ACGGCA	2	12	1130216	1130227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014540	GGAAAC	2	12	1132222	1132233	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014540	GAACAC	2	12	1161343	1161354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014540	GGTAGT	2	12	1237499	1237510	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014540	ACACTC	2	12	1237524	1237535	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014540	GAAACA	2	12	1257704	1257715	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014540	TTTATA	2	12	1267463	1267474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014540	CGGTCA	2	12	1323866	1323877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014540	TGCAAG	3	18	1327563	1327580	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014540	GCAACG	2	12	1396186	1396197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014540	GCCTCC	2	12	1422542	1422553	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014540	TTGCCG	2	12	1443717	1443728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014540	GGAGAT	2	12	1452465	1452476	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014540	CGGGCA	2	12	1471280	1471291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014540	ACTTCG	2	12	1471391	1471402	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014540	GGCCGA	2	12	1486910	1486921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014540	GCACGC	2	12	1487903	1487914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014540	GTTGTA	2	12	1488446	1488457	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014540	CAGTAC	2	12	1488462	1488473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014540	TGGAAA	2	12	1509632	1509643	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014540	CATTGC	2	12	1545688	1545699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014540	CTCGCG	2	12	1560212	1560223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014540	GTGGCT	2	12	1572456	1572467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014540	GTCGCA	2	12	1574374	1574385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014540	GCGCCC	2	12	1617959	1617970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014540	CGCGTG	2	12	1676296	1676307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014540	TTCGCC	2	12	1703478	1703489	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014540	ATTTTT	2	12	1725065	1725076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014540	TTTCCA	2	12	1757934	1757945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014540	AGCGGC	2	12	1758128	1758139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014540	GTTTGA	2	12	1778492	1778503	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014540	CTGCCT	2	12	1779665	1779676	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014540	CAACCA	2	12	1783795	1783806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014540	TTGCAT	2	12	1789966	1789977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014540	TTGCCG	2	12	1806579	1806590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014540	TTTATC	2	12	1848701	1848712	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014540	CGGCCG	2	12	1851700	1851711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014540	ACAGCG	2	12	1871633	1871644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014540	GAAGCA	2	12	1872091	1872102	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014540	AAGCCG	2	12	1890110	1890121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014540	CGCGCC	2	12	1890288	1890299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014540	TTCGCG	2	12	1890522	1890533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014540	GCACTC	2	12	1911133	1911144	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014540	GTTCCG	2	12	1967316	1967327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014540	AGCCAA	2	12	2023960	2023971	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014540	TTGCGA	2	12	2029184	2029195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014540	GAGCGC	2	12	2040517	2040528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014540	TCAGGC	2	12	2134844	2134855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014540	GTCGGT	2	12	2150151	2150162	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014540	TCATTT	2	12	2167524	2167535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014540	CGGCAA	2	12	2190918	2190929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014540	AGCGGC	2	12	2226779	2226790	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014540	AAACCG	2	12	2231047	2231058	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014540	CGTGCA	2	12	2236875	2236886	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014540	CGGCAG	2	12	2242619	2242630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014540	TGCCGC	2	12	2248456	2248467	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014540	CGTCGG	2	12	2272014	2272025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014540	CCGCAA	2	12	2276571	2276582	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014540	GGAGCA	2	12	2320315	2320326	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014540	ATTCGC	2	12	2366894	2366905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014540	ATGCAT	2	12	2388463	2388474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014540	AGGGCG	2	12	2415943	2415954	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014540	CCTCGA	2	12	2418694	2418705	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014540	CCTCGC	3	18	2418712	2418729	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014540	TCACGC	2	12	2451943	2451954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014540	GTTGCG	2	12	2469284	2469295	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014540	GCCGGC	2	12	2504532	2504543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014540	GCGCAA	2	12	2581468	2581479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014540	GCCGGC	2	12	2585067	2585078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014540	AGCCAC	3	18	2623334	2623351	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014540	AAGCCC	2	12	2624953	2624964	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014540	GCATAA	2	12	2641372	2641383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014540	AAGCGC	2	12	2651528	2651539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014540	GGGAAG	2	12	2651899	2651910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014540	ACCGCA	2	12	2685400	2685411	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014540	TATTTG	2	12	2721416	2721427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014540	GCGCCT	3	18	2798601	2798618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014540	GGCAGT	2	12	2864488	2864499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014540	GGAAGC	2	12	2964825	2964836	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014540	CGGGGG	2	12	2965539	2965550	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.