MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 1

Total Repeats: 698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014539	CCGGG	2	10	32305	32314	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014539	GCTTG	2	10	32716	32725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014539	GGCTG	2	10	33833	33842	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014539	GCAGT	2	10	33865	33874	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014539	GATTG	2	10	34731	34740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014539	TTTGG	2	10	36155	36164	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014539	CGTGT	2	10	41239	41248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014539	GTCGA	2	10	41302	41311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014539	AGGCA	2	10	64858	64867	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014539	GCGTT	2	10	66554	66563	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014539	TGATG	2	10	67417	67426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014539	ACGGC	2	10	71811	71820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014539	CCCGT	2	10	71888	71897	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_014539	GTGCC	2	10	78469	78478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014539	GGCCG	2	10	78987	78996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014539	GCGCC	2	10	80394	80403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014539	AGCTG	2	10	80526	80535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014539	GCGCC	2	10	83904	83913	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_014539	TCGCG	2	10	89660	89669	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014539	GGGCC	2	10	100048	100057	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014539	GCCAG	2	10	100165	100174	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014539	CTGGC	2	10	103851	103860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014539	TTCTG	2	10	110466	110475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014539	GCCGC	2	10	119612	119621	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_014539	TGGGG	2	10	144613	144622	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014539	CGGCC	2	10	156250	156259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_014539	ATGCG	2	10	160888	160897	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014539	CGCGG	2	10	162564	162573	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014539	TCGAC	2	10	166659	166668	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014539	TTCCC	2	10	171428	171437	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_014539	AAACG	2	10	171948	171957	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014539	GCGCG	2	10	173267	173276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014539	GCAGC	2	10	173328	173337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014539	GCGCG	2	10	173815	173824	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014539	TTTTG	2	10	174612	174621	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014539	CAGCG	2	10	183029	183038	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014539	GAGCG	2	10	186601	186610	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014539	CCGGC	2	10	186809	186818	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_014539	CCTGC	2	10	199864	199873	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014539	TTGCA	2	10	200070	200079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014539	GGCGT	2	10	201165	201174	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014539	TCGGG	2	10	208708	208717	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014539	TGCGC	2	10	209862	209871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014539	AGGCG	2	10	210025	210034	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014539	GGATC	2	10	211680	211689	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014539	GCAAA	2	10	212630	212639	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014539	TTGCG	2	10	223723	223732	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014539	TGCGG	2	10	223818	223827	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014539	TTTTG	2	10	225758	225767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014539	CGTTA	2	10	230419	230428	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014539	GCGCA	2	10	242122	242131	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014539	CTTTT	2	10	242310	242319	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014539	GCTTC	2	10	271694	271703	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014539	GCATG	2	10	276476	276485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014539	AAGTC	2	10	287768	287777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014539	CGCGC	2	10	290089	290098	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_014539	GCCGC	2	10	292422	292431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_014539	GGGCG	2	10	300929	300938	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014539	GCGGT	2	10	312982	312991	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014539	GGGCC	2	10	313946	313955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014539	CGGCG	2	10	319265	319274	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014539	CGGTC	2	10	327175	327184	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014539	GCTGC	2	10	329092	329101	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014539	GCTGG	2	10	332782	332791	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014539	GCGCC	2	10	332831	332840	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_014539	GCCGA	2	10	339334	339343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014539	CCGCG	2	10	369972	369981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_014539	TGTCA	2	10	375196	375205	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014539	GCCGC	2	10	375289	375298	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_014539	GTCGA	2	10	383859	383868	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014539	GCGAG	2	10	417481	417490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014539	GCGCC	2	10	426009	426018	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_014539	CGCGC	2	10	451281	451290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014539	CCGCG	2	10	456739	456748	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014539	GGCGC	2	10	464690	464699	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014539	CTCGC	2	10	473271	473280	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_014539	TCAAT	2	10	481377	481386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014539	CGGCG	2	10	481430	481439	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014539	AAGCG	2	10	489397	489406	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014539	CGCTT	2	10	490425	490434	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014539	GTTCG	2	10	502546	502555	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014539	CCGCG	2	10	515493	515502	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_014539	AACCA	2	10	538563	538572	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014539	GCGCC	2	10	541283	541292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_014539	GGCGA	2	10	551922	551931	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014539	CTTGA	2	10	554147	554156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014539	GAACC	2	10	555004	555013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014539	CCGAA	2	10	555099	555108	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014539	CCGAA	2	10	555116	555125	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014539	AAGCC	2	10	555130	555139	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014539	CGGCG	2	10	561562	561571	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014539	GCCGC	2	10	593260	593269	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_014539	TTGCG	2	10	597062	597071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014539	CCGCG	2	10	600496	600505	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_014539	ACGAG	2	10	604936	604945	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014539	GTCGC	3	15	611340	611354	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014539	CACGT	2	10	631789	631798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014539	CGGGT	2	10	644090	644099	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014539	TTGAT	2	10	647887	647896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014539	GGAGT	2	10	648138	648147	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014539	AGCCG	2	10	650289	650298	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014539	CGTGC	2	10	650328	650337	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014539	CGGCG	2	10	652318	652327	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014539	TGATT	2	10	654658	654667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014539	GCTCG	2	10	659329	659338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014539	CGCGC	2	10	662843	662852	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014539	CGCAG	2	10	677475	677484	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014539	GCACG	2	10	694114	694123	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014539	CGCTG	2	10	695333	695342	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014539	TCGGT	2	10	702362	702371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014539	ACGGC	2	10	702965	702974	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014539	CGGCC	2	10	704308	704317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_014539	CTGTC	2	10	724087	724096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014539	GCTGC	2	10	724649	724658	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014539	ACAGC	2	10	729595	729604	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014539	CGGCG	2	10	738251	738260	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_014539	GCGCC	2	10	741137	741146	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_014539	ACACC	2	10	751497	751506	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_014539	ATTCG	2	10	758775	758784	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014539	AACAG	2	10	765315	765324	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014539	TGTGG	2	10	771184	771193	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014539	TCGCC	2	10	773440	773449	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_014539	ATGGC	2	10	775273	775282	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014539	CCGGT	2	10	776382	776391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014539	CACGC	2	10	776530	776539	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_014539	GTTGG	2	10	792915	792924	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014539	ATCCA	2	10	794807	794816	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014539	GGGTC	2	10	796818	796827	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014539	CCGCT	2	10	796910	796919	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014539	CTTCT	2	10	807094	807103	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014539	GGCAT	2	10	813557	813566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014539	TTTCA	2	10	829459	829468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014539	CCGGA	2	10	829928	829937	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014539	CGACA	2	10	831729	831738	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014539	CGGGG	2	10	841074	841083	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014539	TGGCG	2	10	841643	841652	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014539	GCGCC	2	10	845262	845271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_014539	TCGCA	2	10	845405	845414	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014539	CATCA	2	10	863645	863654	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014539	TTTGA	2	10	869260	869269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014539	CGAGT	2	10	890029	890038	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014539	ACTCA	2	10	892813	892822	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_014539	CCTGC	2	10	896695	896704	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_014539	GCAAG	2	10	901030	901039	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014539	GCTTC	2	10	903703	903712	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_014539	CGTGA	2	10	903795	903804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014539	CGTGA	2	10	904255	904264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_014539	GCCGC	2	10	1088752	1088761	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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269	NC_014539	AACCG	2	10	1626844	1626853	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_014539	GTGCA	2	10	1642344	1642353	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
271	NC_014539	ACGTG	2	10	1672798	1672807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
272	NC_014539	GCGGT	2	10	1681778	1681787	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
273	NC_014539	CTCAG	2	10	1695778	1695787	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_014539	GCGCT	2	10	1699836	1699845	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_014539	TAGCA	2	10	1760675	1760684	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_014539	GCGCC	2	10	1765367	1765376	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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402	NC_014539	ACCGG	2	10	2323119	2323128	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
403	NC_014539	GCGAT	2	10	2326426	2326435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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410	NC_014539	GACCG	2	10	2374921	2374930	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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421	NC_014539	GAATT	2	10	2447947	2447956	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
422	NC_014539	ACCGA	2	10	2459745	2459754	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
423	NC_014539	CGCGC	2	10	2467705	2467714	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
424	NC_014539	TGGTC	2	10	2468584	2468593	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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426	NC_014539	TGCCG	2	10	2477406	2477415	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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430	NC_014539	AGCGC	2	10	2498779	2498788	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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440	NC_014539	TGCGC	2	10	2558127	2558136	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
441	NC_014539	CGCGC	2	10	2569759	2569768	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
442	NC_014539	AGTCG	2	10	2575928	2575937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
443	NC_014539	CGTGG	2	10	2577235	2577244	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
444	NC_014539	CGTCC	4	20	2577416	2577435	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
445	NC_014539	CGTCA	4	20	2577436	2577455	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
446	NC_014539	CACGT	3	15	2577459	2577473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
447	NC_014539	CACGT	2	10	2577479	2577488	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
448	NC_014539	CACGT	2	10	2577494	2577503	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
449	NC_014539	CGTCA	2	10	2577511	2577520	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
450	NC_014539	CCTCA	2	10	2577554	2577563	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
451	NC_014539	GCATT	2	10	2579931	2579940	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
452	NC_014539	TGCGC	2	10	2583288	2583297	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
453	NC_014539	CCCGG	2	10	2586037	2586046	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
454	NC_014539	CGGTT	2	10	2619842	2619851	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
455	NC_014539	CACCG	2	10	2628889	2628898	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
456	NC_014539	CAGTC	2	10	2631541	2631550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
457	NC_014539	CGATG	2	10	2649038	2649047	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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459	NC_014539	GCATT	2	10	2656685	2656694	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
460	NC_014539	TGTTC	2	10	2665768	2665777	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
461	NC_014539	GCAGC	2	10	2667595	2667604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
462	NC_014539	ACGAA	2	10	2670287	2670296	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
463	NC_014539	TCTGC	2	10	2676977	2676986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
464	NC_014539	GAGCC	2	10	2677010	2677019	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
465	NC_014539	CGCGG	2	10	2677393	2677402	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
466	NC_014539	CGATT	2	10	2678062	2678071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
467	NC_014539	CCCGG	2	10	2678398	2678407	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
468	NC_014539	CGGCG	2	10	2678437	2678446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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471	NC_014539	GATGA	2	10	2691714	2691723	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_014539	AGACA	2	10	2694699	2694708	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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477	NC_014539	AGCGC	2	10	2712943	2712952	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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484	NC_014539	CCCGG	2	10	2750828	2750837	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
485	NC_014539	CGATG	2	10	2789890	2789899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
486	NC_014539	GCGAC	2	10	2793973	2793982	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
487	NC_014539	CGGCG	2	10	2799791	2799800	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
488	NC_014539	GAAAA	2	10	2806686	2806695	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
489	NC_014539	AGGCG	2	10	2809523	2809532	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
490	NC_014539	CAGGC	2	10	2814999	2815008	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
491	NC_014539	AGCCA	2	10	2834433	2834442	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
492	NC_014539	CTTTT	2	10	2835907	2835916	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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495	NC_014539	GCGCC	2	10	2874706	2874715	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
496	NC_014539	GGCGT	2	10	2887965	2887974	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
497	NC_014539	GACGC	2	10	2888884	2888893	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
498	NC_014539	GCAAC	2	10	2892689	2892698	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
499	NC_014539	CCGCC	2	10	2905592	2905601	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
500	NC_014539	AAAAG	2	10	2937663	2937672	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

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