MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23 chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014479	TTTCCC	2	12	3136	3147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014479	TCCAAT	2	12	6806	6817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014479	ATAAAT	2	12	45634	45645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014479	TTTTTG	2	12	51621	51632	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014479	GTTTTT	2	12	272359	272370	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014479	CAAAAG	2	12	287155	287166	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014479	GCTTCC	2	12	287436	287447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014479	TTCATT	2	12	322877	322888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014479	ATTTTT	2	12	363659	363670	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014479	ATGATA	2	12	419018	419029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014479	AGAGAC	2	12	435837	435848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014479	TTTTTA	2	12	436321	436332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014479	TCCTTT	2	12	480225	480236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014479	ATTTTT	2	12	515504	515515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014479	AAAAGG	2	12	529915	529926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014479	TGATGC	2	12	533161	533172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014479	TCTGTC	2	12	543277	543288	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014479	GTTTTT	2	12	543733	543744	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014479	ATAAAT	2	12	565700	565711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014479	TCAATA	2	12	576396	576407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014479	TTCAAA	2	12	581822	581833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014479	TGTTGC	2	12	596502	596513	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014479	ATTTTG	2	12	665670	665681	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014479	CTTTCT	2	12	675212	675223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014479	ACATAT	2	12	758104	758115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014479	TACTTT	2	12	819766	819777	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014479	GAAACG	2	12	851783	851794	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014479	CAATGG	2	12	866582	866593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014479	GAACAA	2	12	903300	903311	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014479	GTGTTT	2	12	912547	912558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014479	TTATCA	2	12	912620	912631	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014479	TTTTTA	2	12	912868	912879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014479	CTTTTT	2	12	913674	913685	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014479	TTTTCA	2	12	955064	955075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014479	AAAGAA	2	12	996434	996445	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014479	GGAGAT	2	12	1006486	1006497	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014479	TCTTTT	2	12	1035101	1035112	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014479	CGGAAG	2	12	1035987	1035998	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014479	TAGAAA	2	12	1055237	1055248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014479	ATCTTA	2	12	1069207	1069218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014479	CTTTTT	2	12	1119366	1119377	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014479	AGCATG	2	12	1134415	1134426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014479	ATTAAA	2	12	1185374	1185385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014479	TATACT	2	12	1227617	1227628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014479	GTAAGA	2	12	1235593	1235604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014479	ATCATT	2	12	1436073	1436084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014479	ATGAAA	2	12	1437934	1437945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014479	GCATTG	2	12	1447960	1447971	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014479	AAAACA	2	12	1512918	1512929	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014479	TTATTT	2	12	1530358	1530369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014479	CTTTTT	2	12	1531249	1531260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014479	AAAGAA	2	12	1645876	1645887	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014479	AATATG	2	12	1679316	1679327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014479	TCCTTC	2	12	1698078	1698089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014479	AACATG	2	12	1741056	1741067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014479	TTTCAT	2	12	1850155	1850166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014479	TTTTAA	2	12	1885707	1885718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014479	TAAATT	2	12	1919778	1919789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014479	AAGAGA	2	12	1954388	1954399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014479	ATCATT	2	12	2028280	2028291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014479	TTATTT	2	12	2028436	2028447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014479	TATGAT	2	12	2035285	2035296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014479	TCTTTA	2	12	2036115	2036126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014479	TCGATT	2	12	2060714	2060725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014479	CAAAAT	2	12	2065103	2065114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014479	CATTCA	2	12	2113405	2113416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014479	CCTTAT	2	12	2134713	2134724	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014479	TATCAC	2	12	2137471	2137482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014479	TTATGT	2	12	2158261	2158272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014479	TCATAT	2	12	2168229	2168240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014479	GAAAAC	2	12	2233143	2233154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014479	ATTTTA	2	12	2240704	2240715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014479	TTTCGA	2	12	2295683	2295694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014479	GAAAAT	2	12	2401591	2401602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014479	ATGGCA	2	12	2419970	2419981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014479	TGACTT	2	12	2482003	2482014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014479	GCAAAA	2	12	2498041	2498052	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014479	ACAGAC	2	12	2508953	2508964	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014479	CATTTC	2	12	2513670	2513681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014479	CCCTTA	2	12	2538701	2538712	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014479	ATACAA	2	12	2539916	2539927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014479	GATTTT	2	12	2606083	2606094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014479	GTTCAC	2	12	2609348	2609359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014479	ACAAAA	2	12	2648683	2648694	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014479	CCCTCT	2	12	2701075	2701086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014479	ATGAAA	2	12	2725331	2725342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014479	ATCCTT	2	12	2749385	2749396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014479	CTCTTT	2	12	2751345	2751356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014479	TTTAAG	2	12	2778134	2778145	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014479	TATTCA	2	12	2778778	2778789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014479	CTTATC	2	12	2829747	2829758	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014479	CATTAT	2	12	2839207	2839218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014479	AAAAGA	2	12	2872921	2872932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014479	CAAAAA	2	12	2980849	2980860	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014479	AAAAAG	2	12	3011964	3011975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014479	ATTATC	2	12	3075827	3075838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014479	TATTTA	2	12	3091863	3091874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014479	TACACC	2	12	3096840	3096851	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014479	GTTTTA	2	12	3098563	3098574	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014479	ATTTAA	2	12	3201190	3201201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014479	AGTTTG	2	12	3242765	3242776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014479	CAAAAA	2	12	3290147	3290158	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014479	TTCGCA	2	12	3330501	3330512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014479	ACAAAA	2	12	3342915	3342926	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014479	ATTTAT	2	12	3347364	3347375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014479	TCTTTT	2	12	3353249	3353260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014479	TAAATG	2	12	3389809	3389820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014479	GTATAT	2	12	3416650	3416661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014479	TTCTTT	2	12	3543986	3543997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014479	CAGAAA	2	12	3586357	3586368	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014479	TGAGGA	2	12	3597889	3597900	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014479	TTAAAT	2	12	3600254	3600265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014479	TCAAAA	2	12	3611945	3611956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014479	TCATTT	2	12	3646061	3646072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014479	CTTTCT	2	12	3687156	3687167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014479	ATCTGT	2	12	3851282	3851293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014479	TGATAA	2	12	3890374	3890385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014479	TCGCTC	2	12	3925799	3925810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014479	GTTTTT	2	12	3947797	3947808	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014479	CCTCTT	2	12	4003093	4003104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014479	CATAAA	2	12	4019935	4019946	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.