MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY186

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014390	ATTT	2	8	1389	1396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014390	AAAG	2	8	1534	1541	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014390	TTTG	2	8	3077	3084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014390	AGGC	2	8	11037	11044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014390	AGGC	2	8	11135	11142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014390	AAAG	2	8	16012	16019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014390	GATA	2	8	20187	20194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014390	GCTG	2	8	23163	23170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014390	AAGA	2	8	26387	26394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014390	TAAC	2	8	26491	26498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014390	GAAA	2	8	35610	35617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014390	TGAA	2	8	47798	47805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014390	GAAA	2	8	53481	53488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014390	AGAT	2	8	54511	54518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014390	TAAA	2	8	58403	58410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014390	ATTT	2	8	60412	60419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014390	TTAT	2	8	64343	64350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014390	TAAT	2	8	64654	64661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014390	TAGC	2	8	67804	67811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014390	AACA	2	8	67906	67913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014390	TCAT	2	8	68284	68291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014390	TCTA	2	8	69945	69952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014390	ATTT	2	8	73958	73965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014390	ATTT	2	8	77408	77415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014390	TATT	2	8	78983	78990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014390	TTTA	2	8	79642	79649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014390	ATTA	2	8	79713	79720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014390	AATA	2	8	79734	79741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014390	ATTA	2	8	79770	79777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014390	GCAA	2	8	79962	79969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014390	GCAA	2	8	80069	80076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014390	TGGA	2	8	87942	87949	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014390	GGTT	2	8	87975	87982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014390	CAAT	2	8	97449	97456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014390	TTAA	2	8	99101	99108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014390	TGTA	2	8	101853	101860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014390	ACTT	2	8	101886	101893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014390	AGTT	2	8	102074	102081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014390	ATCA	2	8	102089	102096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014390	GTTT	2	8	103280	103287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014390	TATG	2	8	104677	104684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014390	ATGA	2	8	106563	106570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014390	AAAG	2	8	107113	107120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014390	AAAC	2	8	107511	107518	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014390	TAAA	2	8	107562	107569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014390	TAAT	2	8	107601	107608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014390	GATC	2	8	108878	108885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014390	TTGT	2	8	109616	109623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014390	TTAA	2	8	123920	123927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014390	ACAA	2	8	136560	136567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014390	AACT	2	8	136822	136829	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014390	TTAC	2	8	143587	143594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014390	TAAA	2	8	145921	145928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014390	ATTC	2	8	145939	145946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014390	TTAT	2	8	150096	150103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014390	TTCA	2	8	150150	150157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014390	TTCT	2	8	150284	150291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014390	TGAA	2	8	150389	150396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014390	TAAT	2	8	153121	153128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014390	AGCT	2	8	156239	156246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014390	TTTC	2	8	156417	156424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014390	CCAG	2	8	156569	156576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014390	TCCT	2	8	157468	157475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014390	GCTG	2	8	161931	161938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014390	CAAA	2	8	163699	163706	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014390	ATTT	2	8	163720	163727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014390	TTTA	2	8	165045	165052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014390	TAAA	2	8	167109	167116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014390	TCTA	2	8	168296	168303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014390	GCAG	2	8	168348	168355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014390	AAAC	2	8	168445	168452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014390	TAAT	2	8	174345	174352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014390	AATC	2	8	178489	178496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014390	GCTG	2	8	182222	182229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014390	TTTA	2	8	182235	182242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014390	TACA	2	8	182323	182330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014390	TATT	2	8	182642	182649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014390	ATAA	2	8	182895	182902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014390	ATTT	2	8	183075	183082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014390	ATTA	2	8	185474	185481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014390	TATT	2	8	185703	185710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014390	TTAC	2	8	185871	185878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.