MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 chromosome 1

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014387	AATAG	2	10	1617	1626	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014387	TCTGT	2	10	14965	14974	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014387	CATTT	2	10	21364	21373	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014387	GAATT	2	10	23743	23752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014387	ATACT	2	10	39735	39744	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014387	TAAAA	2	10	55928	55937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014387	GCTTG	2	10	66466	66475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014387	TCGTG	2	10	93539	93548	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014387	GGGAG	2	10	94974	94983	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014387	CCGTA	2	10	96042	96051	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014387	AGAGG	2	10	96268	96277	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014387	ATATG	2	10	101652	101661	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014387	CAAAA	2	10	111625	111634	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014387	TAAAA	2	10	114136	114145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014387	ATATT	2	10	125926	125935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014387	GTTTT	2	10	132096	132105	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014387	ATAGC	2	10	135619	135628	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014387	AGACA	2	10	160862	160871	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014387	TATAA	2	10	177287	177296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014387	ATATT	2	10	180091	180100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014387	TAAGC	2	10	185389	185398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014387	GAAGT	2	10	201694	201703	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014387	AACTA	2	10	205789	205798	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014387	TATAA	2	10	218239	218248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014387	ATATG	2	10	224872	224881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014387	GGTTT	2	10	237905	237914	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014387	CTTTG	2	10	245476	245485	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014387	ATAGT	2	10	281085	281094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014387	AGTTT	2	10	284204	284213	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014387	TCGTG	2	10	291280	291289	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014387	GGGAG	2	10	292749	292758	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014387	CCGTA	2	10	293817	293826	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014387	AGAGG	2	10	294043	294052	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014387	ATAAG	2	10	307293	307302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014387	ATAGA	2	10	348386	348395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014387	CTATA	2	10	355250	355259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014387	ATTAA	2	10	359614	359623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014387	TTGTA	2	10	377754	377763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014387	ATAGA	2	10	380513	380522	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014387	ATTTT	2	10	380663	380672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014387	GGGCT	2	10	384140	384149	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014387	TCCGA	2	10	385360	385369	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014387	ATGTA	2	10	395216	395225	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014387	TGATT	2	10	395561	395570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014387	TATAA	2	10	420520	420529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014387	ATATG	2	10	432317	432326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014387	ATAAA	2	10	437873	437882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014387	AGAGG	2	10	442505	442514	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014387	AAAGC	2	10	445971	445980	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014387	AAAGC	2	10	446011	446020	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014387	TCTTT	2	10	459316	459325	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014387	TCTCA	2	10	462015	462024	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014387	ATTAT	2	10	479877	479886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014387	TTTTG	2	10	488209	488218	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014387	TATAA	2	10	488291	488300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014387	GCTTG	2	10	511639	511648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014387	AATGA	2	10	526472	526481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014387	GAAGT	2	10	601968	601977	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014387	ATTAC	2	10	604090	604099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014387	AAACA	2	10	623834	623843	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014387	GAAAA	2	10	624644	624653	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014387	TATTT	2	10	625716	625725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014387	TCAGT	2	10	690240	690249	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014387	ATAAA	2	10	713467	713476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014387	TAAAT	2	10	713513	713522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014387	AATAA	2	10	715260	715269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014387	TAATT	2	10	720358	720367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014387	ATATT	2	10	720369	720378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014387	AGTAG	2	10	720399	720408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014387	TTTTC	2	10	720609	720618	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014387	TCGTG	2	10	730118	730127	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014387	GGGAG	2	10	731553	731562	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014387	CCGTA	2	10	732621	732630	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014387	AGAGG	2	10	732847	732856	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014387	AGGAT	2	10	742000	742009	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014387	ATATA	2	10	769751	769760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014387	TTTTC	2	10	773345	773354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014387	TTATG	2	10	776051	776060	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014387	CTGAT	2	10	781550	781559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014387	GAGCG	2	10	783431	783440	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014387	AATTC	2	10	823663	823672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014387	TGTAA	2	10	844825	844834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014387	TATGA	2	10	851158	851167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014387	CAAAT	2	10	853001	853010	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014387	GAAAA	2	10	856198	856207	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014387	AGCTA	2	10	856274	856283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014387	TCTTT	2	10	941936	941945	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014387	AGTAT	2	10	947539	947548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014387	CAATA	2	10	947993	948002	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014387	TTATT	2	10	951341	951350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014387	ATGAA	2	10	951566	951575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014387	ATTTA	2	10	965717	965726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014387	TGATG	2	10	968900	968909	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014387	CTTGT	2	10	972961	972970	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014387	GAAAG	2	10	1025747	1025756	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014387	GCATA	2	10	1068238	1068247	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014387	TAATG	2	10	1079674	1079683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014387	ATATT	2	10	1079943	1079952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014387	ATGAA	2	10	1081519	1081528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014387	GAAAA	2	10	1083829	1083838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014387	CTTAA	2	10	1091090	1091099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014387	TTATG	2	10	1119885	1119894	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014387	TAAAT	2	10	1141109	1141118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014387	GCAGG	2	10	1142837	1142846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014387	TGTGG	2	10	1149086	1149095	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014387	CTCCC	2	10	1160438	1160447	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_014387	AGGAG	2	10	1160457	1160466	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014387	CTTTT	2	10	1169448	1169457	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014387	GAGAA	2	10	1204470	1204479	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014387	TATGA	2	10	1204809	1204818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014387	AGTCT	2	10	1207119	1207128	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014387	TAAAC	2	10	1248701	1248710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014387	GTTTT	2	10	1259381	1259390	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014387	AAAAG	2	10	1262579	1262588	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014387	AATTT	2	10	1282828	1282837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014387	AAAAT	2	10	1305109	1305118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014387	ATGAT	2	10	1359952	1359961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014387	AAAAT	2	10	1364806	1364815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014387	ATGAT	2	10	1366596	1366605	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014387	AGTGG	2	10	1377127	1377136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014387	TAAGG	2	10	1455197	1455206	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014387	GCTTG	2	10	1461360	1461369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014387	ATTAC	2	10	1477972	1477981	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014387	AAATG	2	10	1487607	1487616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014387	TCGTG	2	10	1536862	1536871	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014387	GGGAG	2	10	1538328	1538337	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014387	CCGTA	2	10	1539396	1539405	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014387	AGAGG	2	10	1539622	1539631	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014387	GTGAG	2	10	1540939	1540948	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014387	ATATG	2	10	1582044	1582053	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014387	TTAAC	2	10	1585597	1585606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014387	TGTGA	2	10	1615938	1615947	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014387	GATTT	2	10	1616546	1616555	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014387	TTATT	2	10	1627900	1627909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014387	TTATA	2	10	1628023	1628032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014387	ACTTA	2	10	1638627	1638636	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014387	GAAGG	2	10	1638648	1638657	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014387	TATAT	2	10	1659767	1659776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014387	AAAAT	2	10	1682133	1682142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014387	TGTTT	2	10	1682516	1682525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014387	TAATA	2	10	1688820	1688829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014387	GAGGG	2	10	1690193	1690202	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014387	TAAAT	2	10	1702867	1702876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014387	TGTTT	2	10	1703863	1703872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014387	TTGCT	2	10	1703948	1703957	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014387	AAATA	2	10	1704055	1704064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_014387	TAATA	2	10	3046922	3046931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_014387	AAAAG	2	10	3242556	3242565	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014387	TTAAC	2	10	3254027	3254036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_014387	CCATG	2	10	3282313	3282322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_014387	AAAAT	2	10	3282515	3282524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_014387	CTTTT	2	10	3321454	3321463	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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312	NC_014387	AAAAG	2	10	3501495	3501504	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
313	NC_014387	TAATT	2	10	3514254	3514263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_014387	TAATA	2	10	3529473	3529482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.