MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	ATTTTT	2	12	1145	1156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014330	TTTTTA	2	12	18389	18400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014330	ATATTT	2	12	53298	53309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014330	TAATAT	2	12	64180	64191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014330	TATTTT	2	12	82357	82368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014330	TAAATA	2	12	88639	88650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014330	TACAAA	2	12	112784	112795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014330	TTTAAT	2	12	135280	135291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014330	ATTATA	2	12	150964	150975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014330	ATCATT	2	12	195183	195194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014330	TAAAAA	2	12	242201	242212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014330	TGGTAT	2	12	268413	268424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014330	AATATT	2	12	272639	272650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014330	TATTAA	2	12	276847	276858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014330	TACAAA	2	12	292724	292735	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014330	TAAAAA	2	12	298656	298667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014330	AAAATC	2	12	305964	305975	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014330	ATAGTC	2	12	318939	318950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014330	ATTTAA	2	12	323581	323592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014330	AAAAAT	2	12	332817	332828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014330	GCTTAG	2	12	425850	425861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014330	GCCCCC	2	12	436141	436152	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_014330	ATCATA	2	12	436273	436284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014330	AAAATT	2	12	436292	436303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014330	TAGTTT	2	12	450585	450596	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014330	ATGTAA	2	12	450812	450823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014330	ATTTTA	2	12	466099	466110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014330	TTTTAT	2	12	476672	476683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014330	TAAAAA	2	12	536390	536401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014330	ATTTTT	2	12	545103	545114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014330	AATTAT	2	12	547764	547775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014330	TTTAAT	2	12	591335	591346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014330	TAAGTA	2	12	622995	623006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014330	ACTTTT	2	12	660547	660558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014330	TTTAAA	2	12	672056	672067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014330	TATAAA	2	12	676467	676478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014330	TATAAA	2	12	686346	686357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014330	AAATAT	2	12	687878	687889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014330	AAAATA	2	12	691698	691709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014330	AATTTT	2	12	699404	699415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014330	AAATAT	2	12	699787	699798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014330	TTAATT	2	12	711140	711151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014330	AAAACA	2	12	748996	749007	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014330	TATACA	2	12	752369	752380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014330	ATTTTA	2	12	764254	764265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014330	TTATAT	2	12	765831	765842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014330	AAGTAA	2	12	778421	778432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014330	TTAAAT	2	12	782587	782598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014330	ATAAAA	2	12	786623	786634	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014330	TTTTAT	3	18	800942	800959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014330	ATAAAA	2	12	812802	812813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014330	TAATAT	2	12	823042	823053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014330	GGTATT	2	12	835637	835648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014330	GTAAAA	2	12	835743	835754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014330	TTTATA	2	12	866800	866811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014330	TAAAAA	2	12	880126	880137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014330	ATTTTT	2	12	890064	890075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014330	ATATAG	2	12	892309	892320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014330	TTATAA	2	12	892342	892353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014330	GTATAT	2	12	929834	929845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014330	AAAATA	2	12	957273	957284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014330	GTTTTT	2	12	970631	970642	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014330	ATTTTT	2	12	980504	980515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014330	TTTTTA	2	12	1000357	1000368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014330	TAGTTG	2	12	1021159	1021170	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014330	TAAAAT	2	12	1026309	1026320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014330	AAGAAA	2	12	1035537	1035548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014330	TGAATA	2	12	1038641	1038652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014330	TTCTAT	2	12	1062920	1062931	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014330	CTTAAA	2	12	1081399	1081410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014330	TTATAA	2	12	1100170	1100181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014330	AAGTGC	2	12	1115610	1115621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014330	TACCTT	2	12	1129069	1129080	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014330	CATAAA	2	12	1136743	1136754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014330	TTATAA	2	12	1149498	1149509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014330	CTATTA	2	12	1171788	1171799	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014330	TGATAT	2	12	1182373	1182384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014330	TAATAT	2	12	1184394	1184405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014330	TTTTAT	2	12	1214570	1214581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014330	AATCAA	2	12	1230262	1230273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014330	ATACTA	2	12	1232434	1232445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014330	AAAAAT	2	12	1246345	1246356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014330	TTTTTA	2	12	1261995	1262006	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014330	TATAAA	2	12	1296126	1296137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014330	ATTTTT	2	12	1311661	1311672	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014330	ATTTAA	2	12	1327100	1327111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014330	AATAAA	2	12	1328182	1328193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014330	TAAAAA	2	12	1329820	1329831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014330	ATTAAT	2	12	1349269	1349280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014330	AATTAA	2	12	1382276	1382287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014330	TATAAT	2	12	1391754	1391765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014330	TGATAG	2	12	1439572	1439583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014330	TAAGAA	2	12	1474576	1474587	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014330	ATTTTT	2	12	1479307	1479318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014330	TATAAT	2	12	1491558	1491569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014330	ATAATT	2	12	1499628	1499639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014330	ATTTAT	2	12	1507708	1507719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014330	TGGTAT	2	12	1518251	1518262	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014330	TTTATA	2	12	1523511	1523522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014330	ATTAAA	2	12	1553142	1553153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014330	ACAAAA	2	12	1569649	1569660	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014330	TAAAAA	2	12	1583029	1583040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014330	TTTATT	2	12	1590064	1590075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014330	AAATTA	2	12	1593636	1593647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014330	TTATAT	2	12	1621232	1621243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014330	ATATGT	2	12	1632001	1632012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014330	TTTCAT	2	12	1635949	1635960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014330	ATTTTA	2	12	1685646	1685657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014330	TGTTTT	2	12	1702570	1702581	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014330	TTTTAG	2	12	1709930	1709941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014330	ACCCTC	2	12	1711371	1711382	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014330	ATTACT	2	12	1712329	1712340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014330	TATTTT	2	12	1713880	1713891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014330	ATTTTT	2	12	1714425	1714436	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014330	TATTTT	2	12	1736122	1736133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014330	TAAAAA	2	12	1788547	1788558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014330	ATTATA	2	12	1799053	1799064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014330	TAAAAC	2	12	1836006	1836017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014330	CGTATA	2	12	1864492	1864503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014330	TATCAA	2	12	1875452	1875463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014330	ATGCAA	2	12	1891022	1891033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014330	TTTAAA	2	12	1891115	1891126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014330	TTATAT	2	12	1902655	1902666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014330	CTTTTT	2	12	1915971	1915982	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014330	TGTATT	2	12	1940794	1940805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014330	TAAAAA	2	12	2003010	2003021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014330	TCAAAA	2	12	2016150	2016161	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014330	ATTTAA	2	12	2033081	2033092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014330	ATAAAA	2	12	2036460	2036471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014330	TAAAAC	2	12	2090225	2090236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014330	TATAAT	2	12	2095547	2095558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014330	ATTTAT	2	12	2141112	2141123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014330	CAAAAT	2	12	2156187	2156198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014330	AAATTA	2	12	2159657	2159668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014330	TAAAAA	2	12	2175570	2175581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014330	TTTTTA	2	12	2176188	2176199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014330	TATTTT	2	12	2185887	2185898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014330	ATAATC	2	12	2194484	2194495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_014330	TAAAGC	2	12	2213903	2213914	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014330	AATTTA	2	12	2219723	2219734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014330	TTTTAT	2	12	2248196	2248207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014330	CTTTAT	2	12	2263166	2263177	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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154	NC_014330	AATTAT	2	12	2461327	2461338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.