MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014172	ATAGAA	2	12	29204	29215	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014172	ATTTAA	2	12	37168	37179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014172	TGATTT	2	12	42149	42160	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014172	AAAATA	2	12	44615	44626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014172	TTTCAA	2	12	44662	44673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014172	GAAAAA	2	12	47517	47528	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014172	GAAAAA	2	12	48540	48551	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014172	TTACAA	2	12	48726	48737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014172	AAAGTA	2	12	57895	57906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014172	AATATT	2	12	58135	58146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014172	TAAAAA	2	12	59469	59480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014172	TAAAAA	2	12	69718	69729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014172	TAGTTC	2	12	72476	72487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014172	GTTTCA	2	12	72663	72674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014172	TAACAT	2	12	78696	78707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014172	ACATTA	2	12	80145	80156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014172	ATGTTA	2	12	80209	80220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014172	TTTTAA	2	12	91264	91275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014172	AATATA	2	12	91309	91320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014172	CTTTTA	2	12	115487	115498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014172	AATGGA	2	12	131967	131978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014172	AAAACA	2	12	133553	133564	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014172	TTGTTC	2	12	135491	135502	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014172	TGAAAT	2	12	145943	145954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014172	TTAATA	2	12	155272	155283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014172	TTTATA	2	12	160786	160797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014172	GGGAAT	2	12	199489	199500	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014172	TAGGTA	2	12	199808	199819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014172	ACTCAT	2	12	200686	200697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014172	TTATGT	2	12	205810	205821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014172	GAAGTT	2	12	211475	211486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014172	AAACCA	2	12	213689	213700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014172	AATCCA	2	12	215604	215615	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014172	AAATTG	2	12	216006	216017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014172	AAAAAT	2	12	234558	234569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014172	AAGAAA	2	12	236368	236379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014172	TCTAAA	2	12	247203	247214	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014172	CATAAT	2	12	251289	251300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014172	TTCTAT	2	12	257793	257804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014172	TATAAT	2	12	275592	275603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014172	TTGAAA	2	12	276614	276625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014172	TTTTCT	2	12	277424	277435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014172	TTTAAG	2	12	304071	304082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.