MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 2128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014172	CT	3	6	280994	280999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2002	NC_014172	T	6	6	281024	281029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_014172	T	6	6	281087	281092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_014172	C	6	6	281126	281131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2005	NC_014172	ACA	2	6	281188	281193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_014172	TTC	2	6	281211	281216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_014172	TTA	2	6	281338	281343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_014172	A	7	7	281369	281375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_014172	GGT	2	6	281479	281484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_014172	GATA	2	8	282044	282051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_014172	TAT	2	6	282097	282102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_014172	AT	3	6	282106	282111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_014172	TAA	2	6	282133	282138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_014172	TAA	2	6	282147	282152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_014172	AC	3	6	282178	282183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2016	NC_014172	TTA	2	6	282186	282191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_014172	T	8	8	282208	282215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_014172	TTCC	2	8	282387	282394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2019	NC_014172	AAGG	2	8	282402	282409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_014172	TAAA	2	8	297535	297542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_014172	A	6	6	297540	297545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_014172	T	6	6	297585	297590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_014172	A	6	6	297634	297639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_014172	T	6	6	297652	297657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_014172	GAAAA	2	10	297662	297671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_014172	GAA	2	6	297699	297704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_014172	TA	3	6	297726	297731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_014172	AAAAT	2	10	297780	297789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_014172	AT	3	6	297788	297793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_014172	TA	3	6	299046	299051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_014172	TG	3	6	299123	299128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_014172	AAAG	2	8	299130	299137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_014172	AGA	2	6	299163	299168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_014172	A	6	6	299201	299206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_014172	ATT	2	6	299255	299260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_014172	T	7	7	299293	299299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_014172	TTAAC	2	10	299302	299311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2038	NC_014172	AGAT	2	8	299335	299342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_014172	GAAT	2	8	299409	299416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_014172	A	6	6	299418	299423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_014172	T	6	6	299454	299459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_014172	CAG	2	6	299465	299470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_014172	AAT	2	6	299654	299659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_014172	AAT	2	6	299682	299687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_014172	ATGC	2	8	299720	299727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2046	NC_014172	CAA	2	6	299751	299756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_014172	AAG	2	6	299757	299762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_014172	ATT	2	6	299959	299964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_014172	T	7	7	300003	300009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_014172	ATA	2	6	301522	301527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_014172	A	7	7	301535	301541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_014172	TA	3	6	301560	301565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_014172	AT	4	8	301580	301587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_014172	AT	3	6	301612	301617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_014172	A	6	6	302351	302356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_014172	TAT	2	6	302389	302394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_014172	TTC	2	6	302396	302401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_014172	TTTTG	2	10	302426	302435	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_014172	CA	3	6	302462	302467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2060	NC_014172	T	6	6	302518	302523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_014172	TTTAAG	2	12	304071	304082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_014172	GATG	2	8	304104	304111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_014172	AACAA	2	10	304140	304149	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2064	NC_014172	ATT	3	9	304248	304256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_014172	TGG	2	6	304258	304263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_014172	A	6	6	304277	304282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_014172	ATA	2	6	304307	304312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_014172	TAA	2	6	304333	304338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_014172	GCA	2	6	304425	304430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_014172	CTTTT	2	10	304438	304447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2071	NC_014172	ATT	2	6	304462	304467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_014172	TAA	2	6	305100	305105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_014172	TAA	2	6	305226	305231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_014172	TAA	2	6	305245	305250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_014172	CAT	2	6	305269	305274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_014172	TTC	2	6	305286	305291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2077	NC_014172	ATCTC	2	10	305311	305320	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2078	NC_014172	AAT	3	9	306443	306451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_014172	CAT	2	6	306459	306464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2080	NC_014172	CCT	2	6	306470	306475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2081	NC_014172	TC	3	6	306497	306502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2082	NC_014172	GCCT	2	8	306516	306523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2083	NC_014172	T	6	6	307186	307191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_014172	T	6	6	307207	307212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_014172	ATT	2	6	307279	307284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2086	NC_014172	A	6	6	307628	307633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2087	NC_014172	TAAA	2	8	307794	307801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_014172	TAT	2	6	307839	307844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_014172	TA	3	6	308092	308097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_014172	GTAA	2	8	308125	308132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_014172	TCT	2	6	308243	308248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_014172	CCT	2	6	308333	308338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2093	NC_014172	AAT	2	6	308348	308353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_014172	TA	3	6	308365	308370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_014172	A	6	6	308370	308375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_014172	TAT	2	6	309628	309633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_014172	TAT	2	6	309641	309646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_014172	TCTA	2	8	309658	309665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2099	NC_014172	TTTC	2	8	309686	309693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2100	NC_014172	TTC	2	6	309709	309714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2101	NC_014172	TCTA	2	8	309715	309722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2102	NC_014172	AT	4	8	309726	309733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_014172	T	6	6	309736	309741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_014172	ATT	2	6	309746	309751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_014172	AGA	2	6	309807	309812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_014172	ATTAA	2	10	309823	309832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_014172	TAA	2	6	309838	309843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_014172	AAT	2	6	309867	309872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_014172	TAA	2	6	309885	309890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_014172	AT	3	6	309910	309915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_014172	TA	4	8	309931	309938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_014172	AAG	2	6	310995	311000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_014172	CAC	2	6	311071	311076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2114	NC_014172	TAT	3	9	311104	311112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_014172	TAAA	2	8	311115	311122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_014172	TA	3	6	311162	311167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_014172	T	6	6	311513	311518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_014172	TAA	2	6	311535	311540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_014172	AGG	2	6	311838	311843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_014172	T	7	7	311851	311857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_014172	T	6	6	312193	312198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_014172	ATA	2	6	312199	312204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_014172	TC	3	6	312219	312224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2124	NC_014172	TAAA	2	8	312240	312247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_014172	ATAAG	2	10	312306	312315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_014172	ATAG	2	8	312344	312351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_014172	TTA	2	6	312891	312896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_014172	TTG	2	6	312934	312939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.