MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 7654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	AAT	2	6	2	7	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014150	ATA	2	6	21	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014150	TAA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014150	GAT	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014150	CCT	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014150	ATA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014150	ATA	2	6	1728	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014150	ATA	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014150	CAT	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014150	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014150	AAT	2	6	1863	1868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014150	TAA	3	9	2021	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014150	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014150	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014150	AAT	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014150	TAA	2	6	6409	6414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014150	AAT	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014150	ATA	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014150	AAT	2	6	7251	7256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014150	ATA	2	6	7597	7602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014150	TGC	2	6	10068	10073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014150	AAT	2	6	10108	10113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014150	CTT	2	6	10177	10182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014150	AAG	2	6	10200	10205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014150	TAA	2	6	12359	12364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014150	ATG	2	6	13322	13327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014150	TAT	2	6	13340	13345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014150	ATT	2	6	13347	13352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014150	TTA	3	9	13476	13484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014150	TAA	2	6	15569	15574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014150	TTA	2	6	15575	15580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014150	TAA	2	6	16790	16795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014150	TAA	2	6	17603	17608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014150	TAA	2	6	17716	17721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014150	TAA	2	6	17775	17780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014150	CGG	2	6	17791	17796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014150	ATC	2	6	17835	17840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014150	CGC	2	6	17855	17860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014150	ATT	2	6	19785	19790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014150	TAT	2	6	21270	21275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014150	ATT	2	6	21281	21286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014150	ATA	2	6	23182	23187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014150	TAT	2	6	23259	23264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014150	ATT	2	6	23309	23314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014150	ATG	2	6	27151	27156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014150	ATT	2	6	27182	27187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014150	TAA	2	6	27209	27214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014150	TAA	2	6	29862	29867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014150	ATA	2	6	29919	29924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014150	TAT	2	6	29931	29936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014150	TAT	2	6	29949	29954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014150	ATA	2	6	30061	30066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014150	TAA	2	6	30155	30160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014150	TAT	2	6	30255	30260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014150	ATT	2	6	31617	31622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014150	ATA	2	6	31623	31628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014150	ATT	2	6	34135	34140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014150	AAT	2	6	34146	34151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014150	TAT	2	6	35380	35385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014150	AAT	3	9	38073	38081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014150	ATT	2	6	38193	38198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014150	TTA	2	6	38221	38226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014150	TAT	2	6	38248	38253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014150	AAT	2	6	38259	38264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014150	TAA	2	6	38273	38278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014150	TGT	2	6	42222	42227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014150	GTG	2	6	42314	42319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014150	TAA	2	6	42370	42375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014150	TAA	2	6	43503	43508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014150	ATT	2	6	43518	43523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014150	TAT	3	9	43540	43548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014150	TAT	2	6	44611	44616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014150	ATA	2	6	48033	48038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014150	TAT	2	6	48057	48062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014150	ATT	3	9	48078	48086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014150	TTA	2	6	48167	48172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014150	ATC	2	6	49274	49279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014150	ATT	2	6	49351	49356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014150	TAT	2	6	49399	49404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014150	GTT	2	6	49514	49519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014150	AAG	2	6	49532	49537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014150	ATT	2	6	49542	49547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014150	AAT	2	6	49591	49596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014150	TAT	2	6	49617	49622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014150	TAA	2	6	49637	49642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014150	TAA	2	6	49648	49653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014150	ATT	2	6	49700	49705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014150	AGG	2	6	49723	49728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014150	TAT	3	9	50473	50481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014150	CAG	2	6	50495	50500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014150	AGT	2	6	51559	51564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014150	TAT	2	6	53422	53427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014150	ATA	2	6	54567	54572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014150	TAT	2	6	54686	54691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014150	TAA	2	6	55692	55697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014150	AAT	2	6	55711	55716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014150	TAT	2	6	55725	55730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014150	ATA	2	6	55731	55736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014150	TAA	2	6	55737	55742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014150	ATT	2	6	55901	55906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014150	ATT	2	6	55926	55931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014150	AAT	2	6	58130	58135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014150	ATA	2	6	58149	58154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014150	AAT	2	6	58166	58171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014150	ATA	2	6	59008	59013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014150	TAT	2	6	59050	59055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014150	TAA	2	6	59066	59071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014150	ATT	3	9	61199	61207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014150	ATT	2	6	61243	61248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014150	TAA	2	6	61269	61274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014150	TAA	2	6	61276	61281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014150	ATT	2	6	61428	61433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014150	ATA	2	6	61462	61467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014150	ATT	2	6	63183	63188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014150	TAA	2	6	63197	63202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014150	TTA	2	6	63285	63290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014150	TAT	2	6	63321	63326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014150	TAT	2	6	63349	63354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014150	CTA	2	6	63397	63402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014150	ATA	2	6	65448	65453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014150	AGT	2	6	67403	67408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014150	TAA	3	9	68574	68582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014150	TAT	2	6	68613	68618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014150	ATA	2	6	68630	68635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014150	TAT	2	6	69700	69705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014150	ATA	2	6	69728	69733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014150	TAA	2	6	69916	69921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014150	AAT	2	6	70016	70021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014150	TGA	2	6	70047	70052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014150	ATA	2	6	70070	70075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014150	TAA	2	6	71730	71735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014150	TAA	2	6	72069	72074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014150	TTA	2	6	76005	76010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014150	ATG	2	6	76034	76039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014150	TAA	2	6	76067	76072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014150	ATT	2	6	76110	76115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014150	TTG	2	6	78242	78247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014150	ATT	2	6	79648	79653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014150	ATA	2	6	79905	79910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014150	TAA	2	6	82418	82423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014150	TTC	2	6	83513	83518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014150	CTC	2	6	83548	83553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_014150	ATT	2	6	83630	83635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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