MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 18672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014150	TTA	2	6	800849	800854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014150	ATT	2	6	800863	800868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014150	AT	3	6	800910	800915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014150	TAA	2	6	800918	800923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014150	TA	5	10	800926	800935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014150	AT	3	6	800946	800951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014150	TAAA	2	8	800983	800990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014150	A	6	6	800988	800993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014150	TAA	2	6	801015	801020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014150	TAT	2	6	801024	801029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014150	TAT	3	9	801058	801066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014150	ATA	2	6	801072	801077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014150	ATT	2	6	801080	801085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_014150	TAAT	2	8	802489	802496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014150	ATA	2	6	802515	802520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014150	T	6	6	802538	802543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014150	AAT	2	6	802544	802549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014150	TTAA	2	8	803220	803227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014150	TAT	2	6	803242	803247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014150	AAT	3	9	803251	803259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014150	CT	3	6	804934	804939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_014150	TTG	2	6	804942	804947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014150	TACTA	2	10	804969	804978	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4024	NC_014150	T	7	7	805014	805020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014150	TCA	2	6	805051	805056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_014150	ATT	2	6	805120	805125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014150	TTA	2	6	805130	805135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_014150	T	6	6	805187	805192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014150	TGTA	2	8	805204	805211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014150	ACT	2	6	805218	805223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_014150	ATCT	2	8	805226	805233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_014150	A	6	6	805245	805250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_014150	CT	3	6	805263	805268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_014150	CTT	2	6	805276	805281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_014150	TA	3	6	805284	805289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_014150	TTTTCT	2	12	805305	805316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4037	NC_014150	TAT	2	6	805342	805347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_014150	ATC	2	6	805368	805373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_014150	T	6	6	805374	805379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014150	TA	3	6	805391	805396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014150	TCT	2	6	805414	805419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_014150	AAT	3	9	805423	805431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_014150	CTAATA	2	12	805437	805448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4044	NC_014150	TAA	2	6	805489	805494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014150	TAA	2	6	805496	805501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_014150	T	6	6	805506	805511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_014150	TAT	2	6	805520	805525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_014150	CTT	2	6	805584	805589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_014150	T	8	8	805588	805595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_014150	AAT	2	6	805631	805636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_014150	CTT	2	6	805648	805653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_014150	ATT	2	6	805686	805691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014150	T	6	6	805690	805695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_014150	AATT	2	8	805696	805703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_014150	T	6	6	805705	805710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014150	AT	3	6	807040	807045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014150	TA	4	8	807070	807077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014150	AATAA	2	10	807078	807087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014150	TAAA	2	8	807088	807095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_014150	ATTAA	2	10	807097	807106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_014150	A	6	6	807838	807843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_014150	TA	3	6	807922	807927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014150	ATT	2	6	808615	808620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014150	TAA	2	6	808641	808646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014150	A	6	6	808645	808650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_014150	TAA	2	6	808674	808679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_014150	AAAT	2	8	808690	808697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_014150	AATT	2	8	808718	808725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_014150	T	8	8	808754	808761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_014150	AT	3	6	808783	808788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_014150	TAT	2	6	808794	808799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014150	TA	3	6	808802	808807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_014150	GTA	2	6	808808	808813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_014150	GTATAT	2	12	808850	808861	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_014150	TAT	3	9	808876	808884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_014150	T	6	6	808886	808891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_014150	TG	3	6	809622	809627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014150	AAT	2	6	809634	809639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014150	A	7	7	809657	809663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_014150	TAA	2	6	809672	809677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_014150	AAAT	2	8	809689	809696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_014150	AATT	2	8	809717	809724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_014150	AT	3	6	809786	809791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014150	TAT	2	6	809804	809809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_014150	T	6	6	809812	809817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_014150	AT	3	6	809857	809862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_014150	A	6	6	809863	809868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_014150	C	6	6	809873	809878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4089	NC_014150	T	7	7	809884	809890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_014150	TAA	2	6	809900	809905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014150	ATG	2	6	810447	810452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_014150	TCC	2	6	810496	810501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_014150	TCA	2	6	810555	810560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_014150	TAA	2	6	810579	810584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014150	T	6	6	810599	810604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_014150	T	6	6	810609	810614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_014150	AAT	2	6	810645	810650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014150	ATTG	2	8	810671	810678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014150	TAT	2	6	810679	810684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_014150	AT	3	6	810690	810695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014150	TGATT	44	220	810696	810915	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014150	TAA	2	6	810924	810929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014150	TAT	2	6	810959	810964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_014150	TA	3	6	810974	810979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014150	TAAA	2	8	812592	812599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014150	TAT	2	6	812602	812607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014150	AATT	2	8	812611	812618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014150	TAA	2	6	812632	812637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014150	T	6	6	812638	812643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014150	ATT	2	6	813125	813130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014150	AT	3	6	813141	813146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014150	A	6	6	813166	813171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014150	GAA	2	6	813174	813179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014150	A	6	6	813178	813183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014150	AT	3	6	813192	813197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014150	ATT	2	6	813202	813207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014150	CAC	2	6	813251	813256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_014150	TTAT	2	8	813260	813267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014150	AT	3	6	813266	813271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014150	TAA	2	6	813275	813280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014150	GTT	2	6	813301	813306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014150	TTA	2	6	813339	813344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014150	AT	3	6	813356	813361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014150	CCT	2	6	813701	813706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_014150	ATT	2	6	813715	813720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014150	T	6	6	813725	813730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_014150	ATA	2	6	813784	813789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014150	A	6	6	815183	815188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014150	TA	4	8	816552	816559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_014150	TATAT	2	10	816567	816576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_014150	TAA	2	6	816577	816582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014150	TAA	2	6	816589	816594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_014150	ATT	2	6	816597	816602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_014150	ATA	2	6	816619	816624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_014150	TAAT	2	8	816632	816639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_014150	TAA	2	6	817775	817780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_014150	CT	3	6	818139	818144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_014150	T	6	6	818144	818149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4140	NC_014150	T	6	6	818170	818175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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