MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 18672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014150	TAT	2	6	884167	884172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014150	ATC	2	6	884227	884232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_014150	AT	3	6	884272	884277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_014150	AAC	2	6	884371	884376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_014150	TA	3	6	884380	884385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014150	ATT	2	6	885987	885992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_014150	TAA	2	6	886821	886826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_014150	A	6	6	886842	886847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_014150	CTA	2	6	886864	886869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_014150	T	7	7	886874	886880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014150	ACA	2	6	886910	886915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_014150	AGCAT	2	10	886938	886947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4513	NC_014150	ATA	2	6	886949	886954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_014150	AT	3	6	886965	886970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_014150	ATT	2	6	886978	886983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014150	TTTAT	2	10	887025	887034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014150	T	6	6	890455	890460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014150	TGA	2	6	890541	890546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_014150	TAA	2	6	890561	890566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014150	A	6	6	890583	890588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_014150	CGG	2	6	890628	890633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_014150	GCT	2	6	890645	890650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_014150	GAAC	2	8	890660	890667	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_014150	CAAA	2	8	890672	890679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4525	NC_014150	TA	3	6	890685	890690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_014150	AT	3	6	890698	890703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_014150	ATTT	2	8	890707	890714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_014150	ATA	2	6	891504	891509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_014150	CTT	2	6	891521	891526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_014150	TA	3	6	891527	891532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_014150	A	6	6	891532	891537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_014150	TAT	2	6	892536	892541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_014150	TATAA	2	10	892545	892554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_014150	TAA	2	6	892563	892568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_014150	AT	4	8	892588	892595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014150	T	6	6	892595	892600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_014150	ATA	2	6	892629	892634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_014150	ATC	3	9	892646	892654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4540	NC_014150	AAT	2	6	894817	894822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_014150	AT	3	6	894827	894832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_014150	AAT	2	6	894858	894863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014150	ATT	2	6	894879	894884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014150	TAA	2	6	894906	894911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014150	A	6	6	894910	894915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014150	ATAAA	2	10	894940	894949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014150	TAA	2	6	896101	896106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_014150	AT	3	6	896116	896121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014150	TTAT	2	8	896153	896160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_014150	TAA	2	6	896180	896185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014150	ATT	2	6	896194	896199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014150	AATA	2	8	896222	896229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014150	A	7	7	896239	896245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014150	TGCCT	2	10	896277	896286	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4555	NC_014150	AAT	2	6	896322	896327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014150	AACT	2	8	896334	896341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_014150	TA	3	6	896367	896372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_014150	TTA	2	6	896385	896390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_014150	TATT	2	8	896435	896442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014150	AT	3	6	896446	896451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014150	TAAAA	2	10	896453	896462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014150	A	7	7	898416	898422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_014150	ATAA	2	8	898438	898445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014150	TA	3	6	898446	898451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_014150	ATAA	2	8	898454	898461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_014150	A	8	8	898460	898467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_014150	ATT	2	6	898471	898476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_014150	ATA	3	9	898477	898485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_014150	TA	3	6	898484	898489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014150	AC	3	6	898549	898554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_014150	AAT	7	21	898559	898579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_014150	A	7	7	898617	898623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_014150	ATA	2	6	898656	898661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_014150	AC	3	6	898672	898677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_014150	ATA	2	6	898697	898702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4579	NC_014150	TAA	2	6	899452	899457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_014150	TA	3	6	899489	899494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014150	AAT	2	6	899499	899504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_014150	TATT	2	8	899509	899516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_014150	T	7	7	899525	899531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_014150	AT	4	8	899560	899567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_014150	TAA	2	6	899582	899587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_014150	AATC	2	8	901725	901732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4599	NC_014150	ATTT	2	8	905419	905426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014150	TAA	2	6	905439	905444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014150	TATTT	2	10	905465	905474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014150	ATT	2	6	905475	905480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014150	TTAA	2	8	905484	905491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4605	NC_014150	ATT	3	9	907473	907481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014150	TAT	2	6	907489	907494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_014150	ATTAAA	2	12	907497	907508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_014150	TAAA	2	8	907523	907530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014150	TA	3	6	907550	907555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_014150	T	7	7	907562	907568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014150	C	6	6	907572	907577	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4612	NC_014150	T	6	6	907586	907591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014150	CA	3	6	907644	907649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_014150	TTA	2	6	907655	907660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014150	T	7	7	907695	907701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014150	AATC	2	8	907725	907732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_014150	TAA	2	6	907739	907744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_014150	TTTA	2	8	907788	907795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014150	AC	3	6	907801	907806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_014150	ATA	2	6	907853	907858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014150	AAT	2	6	907889	907894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014150	ATA	2	6	907902	907907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_014150	TAT	2	6	907933	907938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_014150	A	6	6	907940	907945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_014150	TA	3	6	907975	907980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_014150	TTAAA	2	10	907989	907998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_014150	ATA	2	6	908001	908006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_014150	ATA	2	6	908392	908397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_014150	TCT	2	6	908409	908414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_014150	AAT	2	6	908968	908973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_014150	TA	3	6	908982	908987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_014150	T	6	6	908989	908994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_014150	TTTATA	2	12	909005	909016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4638	NC_014150	AAAATA	2	12	909046	909057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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