MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014120	GCGG	2	8	3583	3590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014120	GCTG	2	8	3608	3615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014120	AGGC	2	8	6407	6414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014120	GAAA	2	8	6521	6528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014120	TAAA	2	8	7320	7327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014120	AGAT	2	8	28453	28460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014120	GAAC	2	8	30884	30891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014120	CGCC	3	12	35581	35592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_014120	ACCG	2	8	35745	35752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014120	TTGG	2	8	35803	35810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014120	AATG	2	8	36459	36466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014120	GGGC	2	8	36616	36623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014120	TCGG	2	8	36687	36694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014120	TCGC	2	8	37594	37601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014120	CAAT	2	8	37619	37626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014120	GCCT	2	8	38684	38691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014120	CCCG	2	8	41233	41240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_014120	TCCA	2	8	41560	41567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014120	GACG	2	8	48962	48969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014120	GCTG	2	8	49967	49974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014120	TGCT	2	8	52055	52062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014120	TGCA	2	8	52269	52276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014120	TGGG	2	8	53284	53291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014120	CGCC	2	8	53961	53968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014120	GAGT	2	8	54016	54023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014120	AGGA	2	8	62051	62058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014120	CGCT	2	8	62487	62494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014120	TCCA	2	8	62694	62701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014120	GTGA	2	8	62927	62934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014120	GCCT	2	8	63496	63503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014120	CGCT	2	8	63922	63929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014120	TTGA	2	8	63940	63947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014120	TGGT	2	8	64424	64431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014120	ATTC	2	8	66088	66095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014120	GTTC	2	8	66323	66330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014120	AAGC	2	8	69432	69439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014120	TTGT	2	8	69465	69472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014120	CTGG	2	8	69875	69882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014120	CAAT	2	8	70173	70180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014120	GACG	2	8	73704	73711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014120	AATT	2	8	75077	75084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014120	AATC	2	8	76879	76886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014120	CAAT	2	8	80194	80201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014120	CATG	2	8	80243	80250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014120	TCGG	2	8	80281	80288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014120	AGCG	2	8	81311	81318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014120	GCGT	2	8	84022	84029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014120	TGGC	2	8	84317	84324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014120	GGCC	2	8	85074	85081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014120	CACG	2	8	85132	85139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014120	TCGG	2	8	85410	85417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014120	TGCG	2	8	85883	85890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014120	CGTC	2	8	86345	86352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014120	CTTT	2	8	86795	86802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014120	GTGG	2	8	87201	87208	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014120	TGGC	2	8	87387	87394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014120	GCCT	2	8	87898	87905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014120	AGCA	2	8	87920	87927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014120	GACA	2	8	88635	88642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014120	CGTG	2	8	89570	89577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014120	GGGT	2	8	89599	89606	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014120	ACGG	2	8	91366	91373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014120	GCAA	2	8	92974	92981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014120	TGGC	2	8	93000	93007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014120	CGAC	2	8	93017	93024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014120	TGCG	2	8	93100	93107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014120	TGGC	2	8	93578	93585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014120	GCGA	2	8	93966	93973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014120	ATTG	2	8	94396	94403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014120	ACGC	2	8	94766	94773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014120	AGCG	2	8	95355	95362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014120	GTGC	2	8	98502	98509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014120	GCGT	2	8	101329	101336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014120	TGTC	2	8	101501	101508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014120	CAAA	2	8	101575	101582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014120	ACGA	2	8	101856	101863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014120	CGTG	2	8	101896	101903	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014120	GTAG	2	8	101958	101965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014120	AGGG	2	8	102112	102119	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014120	GGCG	2	8	102518	102525	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014120	ATGG	2	8	102907	102914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014120	GATT	2	8	113924	113931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014120	CGAC	2	8	117240	117247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014120	CAGT	2	8	120745	120752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014120	GCAG	2	8	123637	123644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014120	CCTT	2	8	123953	123960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014120	GACT	2	8	123997	124004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014120	ACAA	2	8	131095	131102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014120	AGCG	2	8	132248	132255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014120	AGCG	2	8	135068	135075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014120	CCAA	2	8	135534	135541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014120	GGCA	2	8	136205	136212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014120	ATGA	2	8	136279	136286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014120	CCGC	2	8	136306	136313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_014120	GCGG	2	8	137167	137174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014120	CTGG	2	8	137483	137490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014120	CCGG	2	8	137643	137650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014120	AAGC	2	8	137688	137695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014120	TTGC	2	8	137889	137896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014120	CTGA	2	8	138080	138087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014120	GGAT	2	8	138185	138192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014120	GTCG	2	8	138877	138884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014120	GACG	2	8	140573	140580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014120	ACCC	2	8	140599	140606	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_014120	CATC	2	8	140702	140709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014120	GTGC	2	8	140847	140854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014120	GGAT	2	8	141159	141166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014120	AGGC	2	8	141173	141180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014120	AGCG	2	8	141279	141286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014120	TCAT	2	8	142548	142555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014120	CGGA	2	8	142718	142725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014120	ACGG	2	8	142814	142821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014120	CCAC	2	8	142863	142870	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_014120	CTGG	2	8	142933	142940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014120	CTCC	2	8	143029	143036	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_014120	GCCG	2	8	143458	143465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014120	GCAT	2	8	145187	145194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014120	ATTG	2	8	145709	145716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014120	AATC	2	8	145790	145797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014120	GCCA	2	8	145844	145851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014120	TCGC	2	8	146064	146071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014120	ATCG	2	8	152004	152011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014120	GTTG	2	8	152278	152285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014120	ATAA	2	8	158547	158554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014120	GCCA	2	8	161513	161520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014120	AGCA	2	8	161703	161710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014120	CTGC	2	8	171039	171046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014120	CCGT	2	8	171242	171249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014120	GACG	2	8	172402	172409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014120	AGCG	2	8	172674	172681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014120	GACT	2	8	172981	172988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014120	GCGA	2	8	172995	173002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014120	CACG	2	8	173014	173021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014120	GTCA	2	8	173141	173148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014120	CGGT	2	8	173418	173425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014120	CATA	2	8	173759	173766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014120	GAAC	2	8	173806	173813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014120	TGCA	2	8	176983	176990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014120	CGGC	2	8	180099	180106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014120	CATA	2	8	180218	180225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014120	GTCG	2	8	180282	180289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014120	CACT	2	8	182812	182819	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014120	CAAG	2	8	184538	184545	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014120	GCAC	2	8	184548	184555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014120	CAAG	2	8	184667	184674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014120	TCAA	2	8	184755	184762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014120	CAGC	2	8	186787	186794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014120	AGCG	2	8	187272	187279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014120	CTAT	2	8	187931	187938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014120	ATGC	2	8	188195	188202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014120	CCTT	2	8	190158	190165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014120	TTCC	2	8	191492	191499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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331	NC_014120	CGGG	2	8	345760	345767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.