MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 3

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014119	CGCGG	2	10	9704	9713	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014119	ATCGC	2	10	10478	10487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014119	GAATT	2	10	11454	11463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014119	ATCTC	2	10	11984	11993	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014119	GCCGT	2	10	16582	16591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014119	AGCGT	2	10	32261	32270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014119	ACGCA	2	10	53895	53904	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014119	GCGAT	2	10	54477	54486	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014119	CGAAA	2	10	57292	57301	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014119	CGATG	2	10	60422	60431	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014119	CCGTT	2	10	61048	61057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014119	ACGGA	2	10	65211	65220	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014119	GCCAG	2	10	65789	65798	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014119	TGCGC	2	10	66594	66603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014119	CCGCT	2	10	100011	100020	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014119	GCGTG	2	10	108514	108523	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014119	AGGCG	2	10	115107	115116	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014119	CGCTT	2	10	115144	115153	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014119	TCCGC	2	10	118493	118502	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_014119	TGCGA	2	10	131697	131706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014119	GCCAC	2	10	131847	131856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_014119	TCCGG	2	10	150114	150123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014119	GAAAC	2	10	152941	152950	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014119	TCGTA	2	10	155082	155091	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014119	ACGCC	2	10	155883	155892	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_014119	CGTCG	4	20	156043	156062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014119	ATTAG	2	10	160324	160333	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014119	AAAGC	2	10	162131	162140	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014119	GCGAA	2	10	206410	206419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014119	CGCGC	2	10	211116	211125	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_014119	TGGCG	2	10	232723	232732	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014119	GCAAA	2	10	232886	232895	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014119	GCGCG	2	10	235420	235429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014119	CGTTC	2	10	237655	237664	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014119	GCTAC	2	10	247157	247166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014119	TGCGC	2	10	247198	247207	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014119	CAGGA	2	10	248863	248872	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014119	CCGGT	2	10	250023	250032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014119	CCTCT	2	10	250195	250204	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014119	TCGAC	2	10	256302	256311	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014119	CTGCC	2	10	257526	257535	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014119	CAGCG	2	10	261027	261036	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014119	TCGCC	2	10	261186	261195	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014119	CGCCC	2	10	266801	266810	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_014119	CGGGA	2	10	269352	269361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014119	GACGC	2	10	272101	272110	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014119	TGGCG	2	10	272775	272784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014119	GCGTC	2	10	280459	280468	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014119	GATGC	2	10	296398	296407	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014119	TGCTT	2	10	298461	298470	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014119	ACGCA	2	10	307822	307831	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014119	CGCGC	2	10	328710	328719	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_014119	GCGCG	2	10	328735	328744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014119	GACAG	2	10	333303	333312	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014119	GCGCG	2	10	336805	336814	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014119	GGCGC	2	10	336999	337008	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014119	CGGGA	2	10	345458	345467	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014119	CTGTC	2	10	345582	345591	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014119	CATTC	2	10	346032	346041	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014119	GGCGA	2	10	365887	365896	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014119	CGGAA	2	10	376057	376066	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014119	TCATG	2	10	379386	379395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014119	GCCTT	2	10	385936	385945	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014119	GCGAC	2	10	386684	386693	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014119	CGATG	2	10	388006	388015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014119	CCATG	2	10	411809	411818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014119	GATCG	2	10	429735	429744	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014119	AGCGC	2	10	429773	429782	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014119	TTCGA	2	10	438521	438530	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014119	AGCGT	2	10	444913	444922	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014119	CGCGC	2	10	465246	465255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014119	TGGCG	2	10	466240	466249	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014119	TGGTG	2	10	468449	468458	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014119	GCGGG	2	10	499891	499900	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014119	TGCAT	2	10	501234	501243	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014119	CCGGA	2	10	501504	501513	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014119	GCTGC	2	10	506652	506661	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014119	CCGCG	2	10	510962	510971	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014119	GCAAC	2	10	513779	513788	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014119	GCTTT	2	10	524604	524613	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014119	CGGCG	2	10	526742	526751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014119	GTCGC	2	10	528298	528307	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014119	CGCGC	2	10	531427	531436	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_014119	CACGA	2	10	531853	531862	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014119	TGCTT	2	10	546658	546667	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014119	GCACT	2	10	559149	559158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014119	AATGC	2	10	571453	571462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014119	CGGTG	2	10	571539	571548	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014119	GCTTC	2	10	581947	581956	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014119	CTCGC	2	10	589351	589360	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_014119	TCGAT	2	10	591447	591456	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014119	GAATG	2	10	595552	595561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014119	ATCTA	2	10	610273	610282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014119	GAGCG	2	10	612572	612581	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014119	GCCGC	2	10	630592	630601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014119	CGCAA	2	10	649413	649422	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014119	GCTGG	2	10	656802	656811	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014119	AGCGC	2	10	656858	656867	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014119	GGGTG	2	10	658499	658508	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014119	GCGTC	2	10	668076	668085	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014119	GTCGC	2	10	670946	670955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014119	CGTTG	2	10	675148	675157	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014119	GTGCG	2	10	678899	678908	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014119	CGGCG	2	10	682220	682229	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014119	CGCGC	2	10	685719	685728	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_014119	CTCAC	2	10	685785	685794	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014119	AAATA	2	10	719417	719426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014119	TTGAA	2	10	739658	739667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014119	AGGTG	2	10	744272	744281	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014119	AGGTG	2	10	744399	744408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014119	AATGT	2	10	749175	749184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014119	CATGC	2	10	765369	765378	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014119	CGCGT	2	10	765413	765422	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014119	TCATC	2	10	765543	765552	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014119	AAGCA	2	10	772387	772396	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014119	ACCCA	2	10	773826	773835	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_014119	GGCTT	2	10	778732	778741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014119	TCATC	2	10	802071	802080	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014119	CATTT	2	10	802101	802110	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014119	TCGTT	2	10	802214	802223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014119	CCAGG	2	10	802447	802456	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014119	AGGCG	2	10	818066	818075	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014119	GGGTT	2	10	825176	825185	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014119	CCGCG	2	10	838321	838330	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_014119	TGGCG	2	10	840459	840468	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014119	GCAAG	2	10	840997	841006	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014119	GCGTA	2	10	851264	851273	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014119	GACGG	2	10	855817	855826	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014119	GCCGA	2	10	860721	860730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014119	TCTGT	2	10	867914	867923	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014119	GCACG	2	10	871779	871788	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014119	TTCAG	2	10	872069	872078	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014119	GCTCG	2	10	872385	872394	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014119	CGGCG	2	10	873505	873514	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014119	CGGCG	2	10	873724	873733	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014119	AGGGA	2	10	883218	883227	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014119	TCCCT	2	10	883934	883943	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_014119	CTGTC	2	10	902897	902906	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014119	GATTC	2	10	903914	903923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014119	GCCTT	2	10	904038	904047	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_014119	GCTCG	2	10	908364	908373	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014119	TCATT	2	10	908640	908649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014119	GTTGC	2	10	916658	916667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014119	CCGTT	2	10	925097	925106	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014119	AAGCG	2	10	935707	935716	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014119	CGACT	2	10	935994	936003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014119	ATCTG	2	10	937692	937701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014119	TGCTT	2	10	941846	941855	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014119	GGCGC	2	10	941920	941929	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
150	NC_014119	TGTCT	2	10	981215	981224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_014119	ATCGA	2	10	982648	982657	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014119	CGCGG	2	10	1000409	1000418	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_014119	ATGCG	2	10	1057605	1057614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_014119	TCGCT	2	10	1058179	1058188	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_014119	GTGCC	2	10	1071350	1071359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
160	NC_014119	TGGCG	2	10	1083271	1083280	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
161	NC_014119	AGTGC	2	10	1083338	1083347	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_014119	GTCGT	2	10	1084201	1084210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_014119	CGCTT	2	10	1095760	1095769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_014119	ATCGC	2	10	1098739	1098748	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_014119	CACGA	2	10	1100086	1100095	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_014119	GCCGC	2	10	1146567	1146576	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
168	NC_014119	CCGTT	2	10	1147827	1147836	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_014119	CAGCA	2	10	1154926	1154935	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_014119	GCGAG	2	10	1160298	1160307	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
171	NC_014119	GAACG	2	10	1195902	1195911	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_014119	TGAAA	2	10	1202535	1202544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014119	GGCGT	2	10	1204004	1204013	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
174	NC_014119	GTTTC	2	10	1217093	1217102	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_014119	GCAGC	2	10	1245480	1245489	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_014119	GGGCG	2	10	1246261	1246270	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
177	NC_014119	GGCGA	2	10	1255328	1255337	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
178	NC_014119	GTCGC	2	10	1258399	1258408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
179	NC_014119	GCGCC	2	10	1258712	1258721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
180	NC_014119	GGCGG	2	10	1263147	1263156	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
181	NC_014119	AACGG	2	10	1269435	1269444	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_014119	GTCGA	2	10	1274523	1274532	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.