MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 2

Total Repeats: 8884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014118	CCCT	2	8	1306418	1306425	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4502	NC_014118	TTC	2	6	1306451	1306456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_014118	CGT	2	6	1306517	1306522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_014118	GC	3	6	1306525	1306530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_014118	GC	3	6	1306547	1306552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_014118	CGA	2	6	1306595	1306600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_014118	CCG	2	6	1306601	1306606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_014118	GC	3	6	1306621	1306626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_014118	TCG	2	6	1307975	1307980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_014118	CGA	2	6	1307998	1308003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_014118	GC	3	6	1308030	1308035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_014118	CGC	2	6	1308067	1308072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_014118	GT	4	8	1309553	1309560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_014118	GT	4	8	1309570	1309577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_014118	CTG	2	6	1309896	1309901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_014118	G	6	6	1310359	1310364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014118	AGC	2	6	1310381	1310386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_014118	TGA	2	6	1310880	1310885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_014118	GGT	2	6	1310895	1310900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014118	CGG	2	6	1311405	1311410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_014118	CTC	2	6	1312111	1312116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_014118	CGCAT	2	10	1312149	1312158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4523	NC_014118	GCG	2	6	1312159	1312164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_014118	CG	3	6	1312189	1312194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_014118	GTC	2	6	1312293	1312298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_014118	A	6	6	1312299	1312304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_014118	AGG	2	6	1312378	1312383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_014118	GCG	2	6	1313085	1313090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_014118	CG	3	6	1313104	1313109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_014118	AGGC	2	8	1313129	1313136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_014118	TTGA	2	8	1313179	1313186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_014118	TGG	2	6	1313190	1313195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_014118	TTGC	2	8	1313219	1313226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_014118	ATC	2	6	1313238	1313243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_014118	CAC	2	6	1314125	1314130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_014118	GCA	2	6	1314754	1314759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_014118	TCG	2	6	1314804	1314809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_014118	CAT	2	6	1314940	1314945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_014118	TATT	2	8	1314991	1314998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014118	GC	3	6	1315063	1315068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_014118	CGCC	2	8	1315097	1315104	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4542	NC_014118	CAT	2	6	1315161	1315166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_014118	ACG	2	6	1315175	1315180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_014118	ATG	2	6	1315199	1315204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014118	T	7	7	1315220	1315226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014118	GATT	2	8	1315234	1315241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014118	GCT	2	6	1315310	1315315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_014118	CGAT	2	8	1316328	1316335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_014118	T	7	7	1316413	1316419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_014118	GAAT	2	8	1316447	1316454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014118	TC	3	6	1317809	1317814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_014118	CGACG	2	10	1317824	1317833	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4553	NC_014118	CGGG	2	8	1317837	1317844	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_014118	GTC	2	6	1319073	1319078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_014118	GAT	2	6	1319095	1319100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014118	CG	3	6	1319108	1319113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_014118	TGCG	2	8	1319187	1319194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_014118	CGT	2	6	1319201	1319206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_014118	TGA	2	6	1319207	1319212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014118	TGA	2	6	1319216	1319221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014118	TTG	2	6	1325357	1325362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014118	CAG	2	6	1326293	1326298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_014118	AAAT	2	8	1326305	1326312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014118	GC	4	8	1327985	1327992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_014118	TCA	2	6	1327997	1328002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_014118	CAT	2	6	1328010	1328015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_014118	CTGA	2	8	1328192	1328199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_014118	CCGT	2	8	1328246	1328253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_014118	CGG	2	6	1328255	1328260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_014118	GTT	2	6	1328384	1328389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_014118	GAC	2	6	1328470	1328475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_014118	CGA	2	6	1328487	1328492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_014118	CCG	2	6	1328589	1328594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_014118	CATC	2	8	1328625	1328632	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_014118	GTA	2	6	1328650	1328655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014118	CCG	2	6	1328715	1328720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_014118	GCA	2	6	1328736	1328741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_014118	CGGC	2	8	1328755	1328762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_014118	GC	3	6	1328802	1328807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_014118	CAG	2	6	1328815	1328820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_014118	T	6	6	1328869	1328874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_014118	TCA	2	6	1328891	1328896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_014118	ACG	2	6	1328928	1328933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_014118	CGT	2	6	1328941	1328946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_014118	GCGG	2	8	1330984	1330991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_014118	TAT	2	6	1331066	1331071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_014118	AC	3	6	1331083	1331088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_014118	GCC	2	6	1331123	1331128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_014118	CCA	2	6	1331148	1331153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_014118	CG	3	6	1331156	1331161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_014118	CTGG	2	8	1336014	1336021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_014118	CG	3	6	1336102	1336107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_014118	TCG	2	6	1336131	1336136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_014118	GCG	2	6	1336176	1336181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_014118	GGC	2	6	1338140	1338145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_014118	TG	3	6	1338171	1338176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_014118	TGGG	2	8	1338241	1338248	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014118	GAT	2	6	1338281	1338286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014118	GTAA	2	8	1338342	1338349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014118	GAG	2	6	1338358	1338363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014118	GGTC	2	8	1338368	1338375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_014118	GAA	2	6	1339135	1339140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014118	GTCA	2	8	1339194	1339201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_014118	AGAC	2	8	1339244	1339251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4605	NC_014118	GC	3	6	1339283	1339288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_014118	CG	3	6	1339334	1339339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_014118	TCG	2	6	1339455	1339460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_014118	TCG	2	6	1339546	1339551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_014118	AGCC	2	8	1339651	1339658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_014118	TTC	2	6	1339664	1339669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_014118	ATCGA	2	10	1339904	1339913	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4612	NC_014118	TGC	2	6	1339934	1339939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_014118	GCC	2	6	1339964	1339969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_014118	CAT	2	6	1339974	1339979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_014118	GTTC	2	8	1340101	1340108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_014118	CTT	2	6	1340146	1340151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_014118	CCA	2	6	1340207	1340212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_014118	ATC	2	6	1340239	1340244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_014118	TCG	2	6	1340252	1340257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_014118	AT	3	6	1340260	1340265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014118	TGAA	2	8	1340266	1340273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014118	GCC	2	6	1340275	1340280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_014118	ACT	3	9	1340288	1340296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_014118	CAT	2	6	1340344	1340349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_014118	CG	3	6	1340414	1340419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_014118	CAT	2	6	1340521	1340526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_014118	TTC	2	6	1340579	1340584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_014118	GAT	2	6	1340644	1340649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_014118	GAA	2	6	1340656	1340661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_014118	ATC	2	6	1340718	1340723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_014118	CAA	2	6	1340728	1340733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_014118	CA	3	6	1340773	1340778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4633	NC_014118	CAT	2	6	1340797	1340802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_014118	AC	3	6	1340847	1340852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4635	NC_014118	CGC	2	6	1342255	1342260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4636	NC_014118	TGT	2	6	1342322	1342327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_014118	ATG	2	6	1342365	1342370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_014118	CA	3	6	1342390	1342395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4639	NC_014118	TCG	2	6	1342451	1342456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4640	NC_014118	CG	3	6	1342495	1342500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4641	NC_014118	GAA	2	6	1342528	1342533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4642	NC_014118	GTCA	2	8	1342587	1342594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4643	NC_014118	AGAC	2	8	1342637	1342644	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4644	NC_014118	AGAT	2	8	1342657	1342664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4645	NC_014118	GC	3	6	1342676	1342681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4646	NC_014118	CG	3	6	1342727	1342732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4650	NC_014118	GTC	2	6	1343437	1343442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4652	NC_014118	ACG	2	6	1343566	1343571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4653	NC_014118	CGC	2	6	1343705	1343710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4654	NC_014118	GTC	2	6	1343737	1343742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4660	NC_014118	TCCA	2	8	1346739	1346746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4662	NC_014118	CTG	2	6	1346793	1346798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4663	NC_014118	AAT	2	6	1346800	1346805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4664	NC_014118	GTC	2	6	1346876	1346881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4665	NC_014118	CTG	2	6	1346882	1346887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4671	NC_014118	TCGC	2	8	1347139	1347146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4725	NC_014118	GCCTC	2	10	1361642	1361651	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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4728	NC_014118	AC	3	6	1361688	1361693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4729	NC_014118	GGC	2	6	1362959	1362964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4731	NC_014118	GAAA	2	8	1362996	1363003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4732	NC_014118	CTC	2	6	1363095	1363100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4740	NC_014118	TAA	2	6	1369063	1369068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4741	NC_014118	T	6	6	1369089	1369094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_014118	GC	3	6	1371175	1371180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4743	NC_014118	TCGT	2	8	1371833	1371840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4744	NC_014118	CGG	2	6	1371869	1371874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4748	NC_014118	TCG	2	6	1379582	1379587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4750	NC_014118	GAA	2	6	1379607	1379612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4752	NC_014118	TTC	2	6	1379741	1379746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4753	NC_014118	CCA	2	6	1379762	1379767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4754	NC_014118	GC	3	6	1380143	1380148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4755	NC_014118	CTA	2	6	1380176	1380181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4757	NC_014118	GCA	2	6	1380342	1380347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4758	NC_014118	GCG	2	6	1380399	1380404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4759	NC_014118	GCC	2	6	1380435	1380440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4896	NC_014118	AAATC	2	10	1407878	1407887	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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