MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium DSM 319 chromosome

Total Repeats: 300

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014103	ATTTTT	2	12	9142	9153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014103	TTATAT	2	12	29695	29706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014103	ATTTTT	2	12	29855	29866	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014103	GTGGAG	2	12	40718	40729	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014103	ATGTTA	2	12	55987	55998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014103	AAACAA	2	12	140792	140803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014103	AATAAA	2	12	151086	151097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014103	TGCTTT	2	12	152546	152557	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014103	ATTTTT	2	12	153902	153913	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014103	AAAATG	2	12	178119	178130	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014103	TCATTT	2	12	209489	209500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014103	ATTTTT	2	12	233811	233822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014103	GAAAAT	2	12	274094	274105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014103	GCAGAA	2	12	277027	277038	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014103	GTAAAC	2	12	380386	380397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014103	TGTATA	2	12	383514	383525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014103	AATAGG	2	12	396210	396221	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014103	TTTTTA	2	12	405041	405052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014103	AAGTAA	2	12	419572	419583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014103	AAGCTT	2	12	472771	472782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014103	AAACTA	3	18	485296	485313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014103	ATGAAA	2	12	495412	495423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014103	TATGTT	2	12	498697	498708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014103	ATAAAA	2	12	525686	525697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014103	GCGCTT	2	12	557504	557515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014103	ATTTTT	2	12	583721	583732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014103	TCATAT	2	12	589709	589720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014103	ATTTTT	2	12	594024	594035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014103	TAAAAA	2	12	640486	640497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014103	TAAAAA	2	12	665635	665646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014103	CGCTAT	2	12	681348	681359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014103	AATTGT	2	12	708793	708804	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014103	TTTTCA	2	12	711310	711321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014103	ATAGAA	2	12	726640	726651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014103	ATTTTC	2	12	727986	727997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014103	TCTTTT	2	12	734107	734118	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014103	TTGAAA	2	12	736332	736343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014103	GAAATT	2	12	752758	752769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014103	TATTGC	2	12	784338	784349	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014103	AGTAAT	2	12	785385	785396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014103	TATGGT	2	12	811355	811366	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014103	TAAAAT	2	12	815553	815564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014103	ATTTTC	2	12	823185	823196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014103	TTTAAA	2	12	830351	830362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014103	AAAAGA	2	12	847956	847967	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014103	ATGGTG	2	12	855699	855710	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014103	AGTTAA	2	12	859065	859076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014103	TGCTTT	2	12	885446	885457	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014103	ATGGTG	2	12	926643	926654	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014103	AGATTT	2	12	985496	985507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014103	ATTCAC	2	12	1025846	1025857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014103	ATTGTG	2	12	1040522	1040533	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014103	TCTTTT	2	12	1045984	1045995	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014103	ATCTAG	2	12	1091014	1091025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014103	ATAATT	2	12	1091041	1091052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014103	TAGTTT	2	12	1091533	1091544	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014103	ATTAAG	2	12	1098398	1098409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014103	ATTATA	2	12	1104774	1104785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014103	TAATTT	2	12	1108854	1108865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014103	TCTTTT	2	12	1156045	1156056	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014103	ATATCT	2	12	1169439	1169450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014103	ATTTTT	2	12	1174642	1174653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014103	ATAAAA	2	12	1237575	1237586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014103	ATTAAT	2	12	1244323	1244334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014103	TAATTT	2	12	1252845	1252856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014103	ACTAAC	2	12	1304213	1304224	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014103	ATTTTT	2	12	1322505	1322516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014103	AGTTAA	2	12	1383890	1383901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014103	GTCCGC	2	12	1386763	1386774	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014103	TTTTGT	2	12	1395054	1395065	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014103	AAAATT	2	12	1517106	1517117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014103	GCAATA	2	12	1522612	1522623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014103	TTATTT	2	12	1597410	1597421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014103	TGAGAG	2	12	1601296	1601307	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014103	TAGAAA	2	12	1609529	1609540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014103	AAAGTA	2	12	1612500	1612511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014103	TTTCTC	2	12	1614926	1614937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014103	CAAGAA	2	12	1614957	1614968	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014103	TTTTTA	2	12	1615985	1615996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014103	TTTCTT	2	12	1627180	1627191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014103	ATAATG	2	12	1654578	1654589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014103	AAATTA	2	12	1655230	1655241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014103	TTCATA	2	12	1655547	1655558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014103	TTTATC	2	12	1658775	1658786	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014103	AAGAAA	2	12	1661771	1661782	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014103	TAATTT	2	12	1663534	1663545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014103	CAAGTG	2	12	1665949	1665960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014103	TTTTCT	2	12	1671432	1671443	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014103	CTTAAA	2	12	1672543	1672554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014103	TATAAA	2	12	1675894	1675905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014103	TAAGCT	2	12	1678413	1678424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014103	TTTTTA	2	12	1710446	1710457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014103	AAGAAT	2	12	1718498	1718509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014103	TAGAAA	2	12	1721490	1721501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014103	GCAAAT	2	12	1721502	1721513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014103	TAAAAA	2	12	1725198	1725209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014103	TTTTTA	2	12	1747280	1747291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014103	CAAGTG	2	12	1751940	1751951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014103	AGTGAA	2	12	1753142	1753153	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014103	CTTAAA	2	12	1759021	1759032	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014103	ACTATT	2	12	1759060	1759071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014103	TCAAAA	2	12	1773686	1773697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014103	ATATAA	2	12	1776459	1776470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014103	ATTTTT	2	12	1787574	1787585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014103	TTAAAG	2	12	1788653	1788664	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014103	ATACAG	2	12	1792435	1792446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014103	TGAATA	2	12	1794543	1794554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014103	ACTTTT	2	12	1802999	1803010	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014103	AAAGAA	2	12	1812202	1812213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014103	ATGTAA	2	12	1837834	1837845	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014103	CATGCA	2	12	1850180	1850191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014103	TAAATA	2	12	1859859	1859870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014103	ATCATT	2	12	1884022	1884033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014103	GAAAGA	2	12	1884079	1884090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014103	TTAACG	2	12	1894979	1894990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014103	TTTTAT	2	12	1904009	1904020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014103	GAAAAC	2	12	1925277	1925288	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014103	AAAAGA	2	12	1961040	1961051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014103	AAAATA	2	12	1973988	1973999	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014103	TGAAAA	2	12	2042512	2042523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014103	AAGTAA	2	12	2066029	2066040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014103	ATGGTG	2	12	2110873	2110884	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014103	AGAAAA	2	12	2149766	2149777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014103	TCAAAG	2	12	2151816	2151827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014103	GACATA	2	12	2168906	2168917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014103	TATTAG	2	12	2178668	2178679	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014103	CGTTAA	2	12	2187027	2187038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014103	TTTTTC	2	12	2194715	2194726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014103	AAAATA	2	12	2228060	2228071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014103	ATGAAG	2	12	2247331	2247342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014103	TATTTA	2	12	2253288	2253299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014103	CGAGGG	2	12	2263617	2263628	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014103	GAAGAG	2	12	2281414	2281425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014103	TAGGGA	2	12	2281760	2281771	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014103	TATGTA	2	12	2293285	2293296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014103	TTTCCT	2	12	2305472	2305483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NC_014103	AAGGCA	2	12	2362199	2362210	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_014103	TATGTA	2	12	2379114	2379125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014103	CAAAAA	2	12	2387687	2387698	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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159	NC_014103	TAAAAA	2	12	2540180	2540191	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_014103	CTCTTT	2	12	3636574	3636585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_014103	TACCTG	2	12	3645424	3645435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_014103	AAGTTG	2	12	3673038	3673049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_014103	ATTTCT	2	12	3683663	3683674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_014103	CAGCAT	2	12	3743505	3743516	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_014103	GGTTTT	2	12	3751549	3751560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014103	TCGGGT	2	12	3754355	3754366	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_014103	TTTCCT	2	12	3768874	3768885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_014103	TCATAA	2	12	3782448	3782459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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259	NC_014103	CATATA	2	12	3786138	3786149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_014103	TATTTT	2	12	3790071	3790082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_014103	TAAAAA	2	12	3951378	3951389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_014103	TATTTT	2	12	3999908	3999919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_014103	TTTAAA	2	12	4045817	4045828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014103	CATTTC	2	12	4123045	4123056	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_014103	TAAATA	2	12	4178095	4178106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.