MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013714	GGGTTG	2	12	50548	50559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013714	GCAATA	2	12	82108	82119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013714	TTAACG	2	12	149772	149783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013714	CTGCGG	2	12	188282	188293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013714	GATTGG	2	12	286267	286278	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013714	GACGGT	2	12	392308	392319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013714	GTGAAG	2	12	431333	431344	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013714	GCCGCA	2	12	482051	482062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013714	TCTCTA	2	12	487778	487789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013714	GTCACA	2	12	509537	509548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013714	GCGAGG	2	12	548203	548214	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013714	CTTTTT	2	12	576202	576213	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013714	CATCGG	2	12	683184	683195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013714	CGTGGC	2	12	708382	708393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013714	CGACGG	2	12	745487	745498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013714	ATGGTG	2	12	753094	753105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013714	TCATCT	2	12	760668	760679	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013714	CTTTCG	2	12	796222	796233	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013714	TGTGAC	2	12	803893	803904	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013714	GCAGAC	2	12	830946	830957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013714	AAGAGA	2	12	831096	831107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013714	GTTGCG	2	12	903497	903508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013714	TGCGCA	2	12	906974	906985	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013714	ATCCGC	2	12	979195	979206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013714	ACAAAT	2	12	980145	980156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013714	TGTTAT	2	12	1034891	1034902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013714	CGGCCG	2	12	1046635	1046646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013714	CCTCCC	2	12	1052170	1052181	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
29	NC_013714	GGACCG	2	12	1056492	1056503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013714	CACGGC	2	12	1102495	1102506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013714	GTATCC	2	12	1298174	1298185	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013714	TCCATG	2	12	1310531	1310542	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013714	GGTATC	2	12	1357614	1357625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013714	AAGATG	2	12	1358290	1358301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013714	TGGTCG	2	12	1392549	1392560	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013714	CTGGTA	2	12	1420276	1420287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013714	ATGTGC	2	12	1474097	1474108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013714	AGTGTG	2	12	1474263	1474274	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013714	CTTGGT	2	12	1481223	1481234	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013714	AAATCG	2	12	1557941	1557952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013714	ACGGGC	2	12	1633846	1633857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013714	CGGGCA	2	12	1635389	1635400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013714	GGCCCG	2	12	1637796	1637807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013714	ACAAGA	2	12	1646508	1646519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013714	GGAAAA	2	12	1681201	1681212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013714	ACGAAT	2	12	1744079	1744090	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013714	AGCATC	2	12	1801633	1801644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013714	GACGCA	2	12	1832839	1832850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013714	TTTTCC	2	12	1846538	1846549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013714	CCGACC	2	12	1879138	1879149	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013714	ACATCG	2	12	1904198	1904209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013714	CGAGGT	2	12	1941360	1941371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013714	GAACAG	2	12	1960377	1960388	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013714	GGCCAT	2	12	1963684	1963695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013714	GTCGCC	2	12	1973396	1973407	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013714	CACGCG	2	12	1976203	1976214	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013714	CCCGCG	2	12	1978720	1978731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013714	AGAGCA	2	12	2010235	2010246	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013714	CGTCAT	2	12	2027856	2027867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013714	GAACCG	2	12	2061875	2061886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013714	GACAAA	2	12	2095457	2095468	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013714	GCGGGA	2	12	2148212	2148223	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013714	GTTCTG	2	12	2163427	2163438	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013714	CAGAAC	2	12	2165209	2165220	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013714	TAGGCG	2	12	2235765	2235776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013714	ATCGCA	2	12	2238215	2238226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013714	GTCGCC	2	12	2367152	2367163	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013714	CACGCG	2	12	2369959	2369970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013714	ACGTCG	2	12	2373009	2373020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013714	GGATTC	2	12	2429686	2429697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013714	CCAGCA	2	12	2436749	2436760	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013714	GTCGAC	2	12	2479972	2479983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013714	GTCGCC	2	12	2549926	2549937	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013714	CACGCG	2	12	2552733	2552744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013714	GTCGCC	2	12	2602207	2602218	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013714	CACGCG	2	12	2605014	2605025	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013714	CCCGCG	2	12	2607531	2607542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013714	TTGATT	2	12	2635198	2635209	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.