MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 6926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013714	CGTT	2	8	193479	193486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_013714	CCT	2	6	194627	194632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_013714	CAA	2	6	194726	194731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013714	CCT	2	6	197200	197205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_013714	GAA	2	6	197337	197342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013714	AAG	2	6	197398	197403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013714	ACG	2	6	198729	198734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013714	GGAG	2	8	198751	198758	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013714	CCG	2	6	198768	198773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_013714	CGGGC	2	10	201479	201488	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
511	NC_013714	TTCCC	2	10	202871	202880	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
512	NC_013714	ACA	2	6	203056	203061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013714	TTC	2	6	203065	203070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013714	TTC	2	6	203085	203090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013714	TGT	2	6	203108	203113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013714	GA	4	8	203177	203184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013714	CCA	2	6	205640	205645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_013714	TCA	2	6	211101	211106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_013714	TG	3	6	211203	211208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013714	CAA	2	6	211271	211276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_013714	CAAAG	2	10	212429	212438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
522	NC_013714	GCG	2	6	212449	212454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013714	AAT	2	6	212481	212486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013714	AT	3	6	212600	212605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013714	GAAA	2	8	212641	212648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013714	ATTC	2	8	212657	212664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_013714	GAAT	2	8	212682	212689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013714	GTC	2	6	212717	212722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013714	ACAT	2	8	212732	212739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_013714	GGC	2	6	212746	212751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013714	CAA	2	6	213887	213892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013714	CAG	2	6	213921	213926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013714	GA	3	6	213983	213988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013714	CT	3	6	216542	216547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_013714	CCAA	2	8	216601	216608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_013714	AGAA	2	8	216618	216625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013714	ACA	2	6	217593	217598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013714	C	6	6	217621	217626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
539	NC_013714	ATG	2	6	218182	218187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013714	GCG	2	6	223936	223941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013714	TCT	2	6	223979	223984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013714	TGT	2	6	224025	224030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013714	ACG	2	6	224043	224048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_013714	CG	3	6	226312	226317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_013714	TCC	2	6	226324	226329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_013714	CATGT	2	10	226479	226488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
547	NC_013714	T	6	6	226581	226586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013714	GGA	2	6	227904	227909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013714	CGG	2	6	227927	227932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013714	TCC	2	6	228187	228192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_013714	TTC	2	6	228216	228221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013714	AC	3	6	228259	228264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_013714	GTG	2	6	228273	228278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013714	CG	3	6	228282	228287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_013714	CAC	2	6	228291	228296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_013714	C	7	7	228706	228712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
557	NC_013714	GCT	2	6	228749	228754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013714	AT	3	6	228852	228857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013714	CGT	2	6	228867	228872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_013714	CCG	2	6	229391	229396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_013714	TTC	2	6	230459	230464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013714	CTC	2	6	231468	231473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_013714	GGAC	2	8	232899	232906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
564	NC_013714	CGAC	2	8	232921	232928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_013714	TTC	2	6	232969	232974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_013714	TGCC	2	8	232985	232992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_013714	GTT	2	6	234407	234412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013714	GGTT	2	8	234416	234423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013714	GCG	2	6	234534	234539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013714	AAAGA	2	10	234595	234604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013714	GAGG	2	8	234605	234612	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013714	TCC	2	6	236367	236372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_013714	GCG	2	6	236400	236405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013714	CGT	2	6	238346	238351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013714	TGT	2	6	238473	238478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013714	GC	4	8	238613	238620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_013714	ATCC	2	8	238659	238666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_013714	ACC	2	6	238669	238674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_013714	TAT	2	6	238694	238699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013714	ATCGA	2	10	238713	238722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_013714	TGA	2	6	238737	238742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013714	CGGT	2	8	242561	242568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_013714	ATCT	2	8	242662	242669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_013714	CAT	2	6	242682	242687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013714	TTGC	2	8	242718	242725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_013714	AGG	2	6	242744	242749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013714	TTCA	2	8	242760	242767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_013714	GAA	2	6	242778	242783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013714	ACC	2	6	242800	242805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_013714	TTCG	2	8	243065	243072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_013714	GTG	2	6	243125	243130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013714	TGG	2	6	245066	245071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013714	AGG	2	6	245101	245106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013714	C	9	9	246133	246141	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
595	NC_013714	TG	3	6	246159	246164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013714	GTT	2	6	246173	246178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013714	AGG	2	6	246182	246187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013714	AGC	2	6	246201	246206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013714	TGC	2	6	252385	252390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013714	CGG	2	6	252465	252470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013714	AAC	2	6	252477	252482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013714	GA	3	6	252488	252493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013714	GCT	2	6	254279	254284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013714	TCG	2	6	254348	254353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013714	GA	3	6	254399	254404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013714	GGC	2	6	254436	254441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013714	TC	3	6	254470	254475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_013714	TGT	2	6	254579	254584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013714	GAA	2	6	256388	256393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013714	A	6	6	256445	256450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013714	GGA	2	6	256501	256506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013714	C	6	6	256531	256536	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
613	NC_013714	CGG	2	6	256589	256594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013714	CGA	2	6	258433	258438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013714	TCT	2	6	258473	258478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013714	AACGG	2	10	258490	258499	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
617	NC_013714	ACT	2	6	260746	260751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_013714	TCG	2	6	260763	260768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013714	ACG	2	6	260783	260788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013714	CGG	2	6	260928	260933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_013714	TGG	2	6	260949	260954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013714	GCC	2	6	261109	261114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_013714	AAC	2	6	261143	261148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013714	CAGAG	2	10	261153	261162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
625	NC_013714	GTT	2	6	261190	261195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013714	TGT	2	6	261238	261243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013714	CTT	2	6	261264	261269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013714	CGG	2	6	261287	261292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013714	TCT	2	6	261294	261299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013714	T	6	6	261299	261304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013714	GAT	2	6	261360	261365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013714	TTAA	2	8	262131	262138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013714	GAT	2	6	262155	262160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013714	ATCA	2	8	265629	265636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_013714	GCGG	2	8	265641	265648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
636	NC_013714	GCC	2	6	265684	265689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_013714	GGT	2	6	265726	265731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013714	CGG	2	6	265739	265744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013714	CGG	2	6	265836	265841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013714	ACC	2	6	265854	265859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_013714	TGG	2	6	268626	268631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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676	NC_013714	TCG	2	6	291425	291430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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912	NC_013714	CCG	2	6	396924	396929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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