MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 6926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013714	CAGAAC	2	12	2165209	2165220	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_013714	CAAG	2	8	2165281	2165288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_013714	AACCA	3	15	2165303	2165317	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5504	NC_013714	AAC	2	6	2165342	2165347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_013714	TGCC	2	8	2166503	2166510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_013714	TTC	2	6	2166540	2166545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_013714	AT	3	6	2166646	2166651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_013714	GAAA	2	8	2166667	2166674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_013714	CCT	2	6	2168847	2168852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_013714	GCCC	2	8	2168970	2168977	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5511	NC_013714	CG	3	6	2170017	2170022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_013714	GCCTT	2	10	2171078	2171087	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5513	NC_013714	ACCGG	2	10	2171134	2171143	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5514	NC_013714	TCC	2	6	2172503	2172508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_013714	GCC	2	6	2172568	2172573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_013714	ATG	3	9	2172597	2172605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_013714	TCC	2	6	2173060	2173065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_013714	AGC	2	6	2173090	2173095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_013714	CGGT	2	8	2173118	2173125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_013714	CGC	2	6	2173889	2173894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_013714	ATG	2	6	2173906	2173911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013714	ACG	2	6	2173928	2173933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_013714	TCG	2	6	2174873	2174878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_013714	CCG	2	6	2175062	2175067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_013714	TCG	2	6	2175082	2175087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_013714	AAT	2	6	2175112	2175117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013714	CGC	2	6	2179087	2179092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_013714	CTT	3	9	2179153	2179161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_013714	C	6	6	2179188	2179193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5530	NC_013714	CGC	2	6	2179207	2179212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_013714	AGACG	2	10	2179299	2179308	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5532	NC_013714	CGG	2	6	2179320	2179325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_013714	AGG	2	6	2179340	2179345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_013714	AG	3	6	2179373	2179378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_013714	GCAG	2	8	2179398	2179405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_013714	CAA	2	6	2179465	2179470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_013714	CAG	2	6	2179476	2179481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_013714	GAC	2	6	2179502	2179507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_013714	ATG	2	6	2179694	2179699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_013714	ACCGC	2	10	2179753	2179762	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5541	NC_013714	GGT	2	6	2181710	2181715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_013714	TGG	2	6	2181761	2181766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_013714	ACC	2	6	2181789	2181794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_013714	TCA	2	6	2181842	2181847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_013714	CTT	2	6	2183308	2183313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_013714	TGA	2	6	2183319	2183324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_013714	TTG	2	6	2183506	2183511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_013714	A	6	6	2183520	2183525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_013714	AT	3	6	2183551	2183556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_013714	CCTC	2	8	2184608	2184615	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5551	NC_013714	GTT	2	6	2184644	2184649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_013714	CAA	2	6	2184700	2184705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_013714	GGT	2	6	2185682	2185687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_013714	CA	3	6	2185746	2185751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_013714	TCA	2	6	2185829	2185834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_013714	CCA	2	6	2185878	2185883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_013714	GGAAT	2	10	2185886	2185895	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_013714	ATT	2	6	2185902	2185907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_013714	GGT	2	6	2185950	2185955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_013714	GTT	3	9	2187637	2187645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_013714	TTGAT	2	10	2188423	2188432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_013714	CA	3	6	2190162	2190167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_013714	CCG	2	6	2190171	2190176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_013714	ATC	2	6	2190230	2190235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_013714	TCCG	2	8	2190250	2190257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_013714	TTG	2	6	2191504	2191509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_013714	TC	3	6	2191555	2191560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_013714	GCA	2	6	2191574	2191579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_013714	ACC	2	6	2191596	2191601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_013714	TCG	2	6	2194078	2194083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_013714	ATC	3	9	2194158	2194166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_013714	TGCCT	2	10	2194185	2194194	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5573	NC_013714	CCGCA	2	10	2194208	2194217	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5574	NC_013714	TCC	2	6	2195540	2195545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_013714	GCG	2	6	2195604	2195609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_013714	AAGA	2	8	2195617	2195624	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_013714	CCG	2	6	2195731	2195736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_013714	GC	3	6	2199764	2199769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_013714	TGCC	2	8	2201243	2201250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_013714	CAT	2	6	2201280	2201285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_013714	ACGA	2	8	2201328	2201335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_013714	GCG	2	6	2201436	2201441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_013714	TC	3	6	2201860	2201865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_013714	GCG	2	6	2201886	2201891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_013714	A	6	6	2202036	2202041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_013714	ACT	2	6	2206069	2206074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_013714	TCC	2	6	2206162	2206167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_013714	TCC	2	6	2206192	2206197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_013714	TCA	2	6	2206201	2206206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_013714	CCG	2	6	2207030	2207035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_013714	CAT	2	6	2207044	2207049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_013714	ATT	2	6	2207089	2207094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_013714	GAA	2	6	2207100	2207105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_013714	GAT	2	6	2207116	2207121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_013714	CCA	2	6	2207734	2207739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_013714	ATGA	2	8	2208670	2208677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_013714	GATT	2	8	2208882	2208889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_013714	CAA	2	6	2208905	2208910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_013714	CAT	2	6	2209879	2209884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_013714	CAA	2	6	2209892	2209897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_013714	CAGA	2	8	2209905	2209912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_013714	ATT	2	6	2210003	2210008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_013714	TTC	2	6	2210028	2210033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_013714	TCC	2	6	2210730	2210735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_013714	TCAG	2	8	2213004	2213011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_013714	TCA	2	6	2213429	2213434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_013714	TCA	2	6	2213456	2213461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_013714	TTC	2	6	2213471	2213476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_013714	GGT	2	6	2215664	2215669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_013714	CTACC	2	10	2216426	2216435	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5611	NC_013714	GAG	2	6	2216494	2216499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_013714	TTG	2	6	2220870	2220875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_013714	GCG	2	6	2220918	2220923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_013714	TCC	2	6	2222318	2222323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_013714	CGTT	2	8	2222329	2222336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_013714	AGCAA	2	10	2222621	2222630	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5617	NC_013714	CCT	2	6	2223464	2223469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_013714	CAA	2	6	2223497	2223502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_013714	ATT	2	6	2223610	2223615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_013714	ACA	2	6	2223629	2223634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_013714	CACG	2	8	2223639	2223646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_013714	CCT	2	6	2223650	2223655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_013714	TCG	2	6	2223741	2223746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_013714	CAT	2	6	2223752	2223757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_013714	GGCC	2	8	2223856	2223863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5626	NC_013714	TAT	2	6	2224923	2224928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_013714	TAGA	2	8	2225068	2225075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_013714	AGC	2	6	2225107	2225112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_013714	AAT	2	6	2225195	2225200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_013714	GGC	2	6	2225203	2225208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_013714	CAC	2	6	2225265	2225270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5632	NC_013714	GGT	2	6	2225418	2225423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5652	NC_013714	TCG	2	6	2232280	2232285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5653	NC_013714	A	6	6	2232299	2232304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_013714	CGG	2	6	2232355	2232360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5662	NC_013714	GGA	2	6	2235459	2235464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5685	NC_013714	TA	3	6	2246784	2246789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5731	NC_013714	TCTCA	2	10	2268325	2268334	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5732	NC_013714	CTCC	2	8	2268359	2268366	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5733	NC_013714	TTG	2	6	2268367	2268372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5735	NC_013714	CACC	2	8	2268413	2268420	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5741	NC_013714	TTG	2	6	2270303	2270308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_013714	TGT	2	6	2270334	2270339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5743	NC_013714	CCGG	2	8	2270359	2270366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5744	NC_013714	TCGGC	2	10	2270374	2270383	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5748	NC_013714	CCT	2	6	2273425	2273430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5752	NC_013714	ACC	2	6	2273576	2273581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5755	NC_013714	CGC	2	6	2273605	2273610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5756	NC_013714	CAA	2	6	2274665	2274670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5757	NC_013714	CAC	2	6	2274680	2274685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5758	NC_013714	GCAG	2	8	2274731	2274738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5760	NC_013714	TGAAG	2	10	2275669	2275678	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5894	NC_013714	TCA	2	6	2310331	2310336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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