MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013130	TAA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013130	TCT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013130	ATA	2	6	77	82	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013130	TAC	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013130	TAA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013130	TAA	2	6	245	250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013130	AAG	2	6	269	274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013130	TAT	2	6	384	389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013130	TCT	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013130	TCT	2	6	491	496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013130	TAT	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013130	TTA	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013130	ATA	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013130	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013130	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013130	CCT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013130	TAA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013130	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013130	TAA	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013130	TAA	3	9	1355	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013130	ATT	2	6	1366	1371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013130	ATT	2	6	1393	1398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013130	AAT	3	9	1420	1428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013130	ATT	2	6	2946	2951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013130	AGA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013130	ATT	2	6	4272	4277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013130	TAA	2	6	4370	4375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013130	TAA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013130	TAA	2	6	4470	4475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013130	ATT	2	6	4481	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013130	TAA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013130	TAT	2	6	5155	5160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013130	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013130	TTA	2	6	9347	9352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013130	TTA	2	6	11220	11225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013130	AGG	2	6	11284	11289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013130	AAT	2	6	11319	11324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013130	TAA	2	6	11449	11454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013130	AAT	2	6	11515	11520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013130	TAA	2	6	11530	11535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013130	TAA	2	6	11551	11556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013130	AAT	2	6	11590	11595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013130	TAT	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013130	TTA	2	6	11620	11625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013130	TTA	2	6	11630	11635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013130	ACT	2	6	11761	11766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013130	AGG	2	6	14359	14364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013130	ATT	2	6	15365	15370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013130	TTG	2	6	15877	15882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013130	TTG	2	6	15932	15937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013130	TGT	2	6	16026	16031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013130	TAA	2	6	16643	16648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013130	AGC	2	6	16650	16655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013130	TAA	2	6	16666	16671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013130	CCT	2	6	17308	17313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013130	TAT	2	6	17474	17479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013130	AAT	2	6	17638	17643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013130	AAG	2	6	17797	17802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013130	TTA	2	6	17896	17901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013130	AAC	2	6	17930	17935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013130	AAT	2	6	17994	17999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013130	TTA	2	6	18063	18068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013130	TAT	2	6	18073	18078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013130	ATT	2	6	20407	20412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013130	TAT	2	6	20436	20441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013130	TAT	2	6	20459	20464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013130	TTA	2	6	20626	20631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013130	TTA	2	6	20954	20959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013130	TTA	2	6	20963	20968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013130	ATA	2	6	20996	21001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013130	AAT	2	6	21013	21018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013130	AAT	2	6	21057	21062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013130	TTA	2	6	23354	23359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013130	CTG	3	9	23399	23407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013130	TTG	2	6	23423	23428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013130	AAG	2	6	23527	23532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013130	TTG	2	6	23544	23549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013130	AAT	2	6	23698	23703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013130	GAC	2	6	23771	23776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013130	TTA	2	6	23815	23820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013130	TAA	2	6	25420	25425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013130	ATA	3	9	25436	25444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013130	ATA	2	6	25470	25475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013130	ATT	2	6	27403	27408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013130	AAG	2	6	30099	30104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013130	AAT	2	6	35939	35944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013130	AGT	2	6	39635	39640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013130	TTC	2	6	39688	39693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013130	TAA	2	6	39851	39856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013130	TAA	2	6	41106	41111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013130	GTT	2	6	41112	41117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013130	TTA	2	6	41139	41144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013130	ATA	2	6	41148	41153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013130	CTT	2	6	41196	41201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013130	AGT	2	6	41216	41221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013130	TGA	2	6	41257	41262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013130	AAG	2	6	41335	41340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013130	TAA	2	6	41395	41400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013130	ATT	2	6	42060	42065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013130	ATT	2	6	42104	42109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013130	AAG	2	6	42259	42264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013130	TAA	2	6	42518	42523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013130	TAA	2	6	43605	43610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013130	AAG	2	6	43636	43641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013130	ATT	2	6	43698	43703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013130	TAA	2	6	44567	44572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013130	ATT	2	6	44591	44596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013130	CTT	2	6	44672	44677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013130	TAA	2	6	46002	46007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013130	TAA	2	6	46068	46073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013130	CTA	2	6	46125	46130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013130	TAT	2	6	46138	46143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013130	AAT	2	6	46298	46303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013130	TTA	2	6	46306	46311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013130	ATT	2	6	46333	46338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013130	TAT	2	6	46357	46362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013130	TTG	2	6	46378	46383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013130	GAA	2	6	46435	46440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013130	ATT	2	6	46475	46480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013130	ATA	3	9	47353	47361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013130	AAT	2	6	47374	47379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013130	ATT	3	9	47394	47402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013130	GAA	2	6	47492	47497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013130	ATT	2	6	47532	47537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013130	ATA	3	9	48355	48363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013130	AAT	2	6	48376	48381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013130	ATT	3	9	48396	48404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013130	ATA	2	6	49395	49400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013130	ATA	3	9	49428	49436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013130	TTA	3	9	49437	49445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013130	GAA	2	6	49502	49507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013130	TAT	2	6	49560	49565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013130	ATA	2	6	50264	50269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013130	ATT	3	9	50302	50310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013130	CCT	2	6	50373	50378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013130	ACC	2	6	50405	50410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013130	TAA	2	6	51430	51435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013130	TTA	2	6	51570	51575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013130	TAA	3	9	51624	51632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013130	TAT	2	6	51640	51645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013130	TTA	2	6	51696	51701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013130	ATA	2	6	51796	51801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013130	AAT	2	6	52626	52631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.