MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	T	8	8	123	130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013129	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013129	A	6	6	1986	1991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013129	A	7	7	2967	2973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013129	T	7	7	4371	4377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013129	A	7	7	4382	4388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013129	A	6	6	4451	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013129	A	7	7	4570	4576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013129	T	6	6	5184	5189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013129	A	8	8	5190	5197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013129	T	7	7	9261	9267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013129	A	6	6	9272	9277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013129	T	8	8	9352	9359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013129	C	6	6	11176	11181	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_013129	T	8	8	11645	11652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013129	T	6	6	11654	11659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013129	T	6	6	11677	11682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013129	T	6	6	15042	15047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013129	T	7	7	15094	15100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013129	A	6	6	15117	15122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013129	T	6	6	15838	15843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013129	T	7	7	16602	16608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013129	T	8	8	17702	17709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013129	T	6	6	17780	17785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013129	T	6	6	17808	17813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013129	T	7	7	17910	17916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013129	A	6	6	18055	18060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013129	A	6	6	18090	18095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013129	T	6	6	20186	20191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013129	A	6	6	20264	20269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013129	A	6	6	20283	20288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013129	T	8	8	20328	20335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013129	T	7	7	20344	20350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013129	T	6	6	20426	20431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013129	T	7	7	20457	20463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013129	A	7	7	20500	20506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013129	T	8	8	20532	20539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013129	T	6	6	20648	20653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013129	A	6	6	20893	20898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013129	T	6	6	20992	20997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013129	T	7	7	23281	23287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013129	T	6	6	23427	23432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013129	T	7	7	23537	23543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013129	T	6	6	23614	23619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013129	T	6	6	23681	23686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013129	A	6	6	23705	23710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013129	T	6	6	24400	24405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013129	T	6	6	24439	24444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013129	T	6	6	25201	25206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013129	T	6	6	25297	25302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013129	A	6	6	25394	25399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013129	A	6	6	27321	27326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013129	A	6	6	27334	27339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013129	T	7	7	30596	30602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013129	A	6	6	30604	30609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013129	A	8	8	30632	30639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013129	T	7	7	35802	35808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013129	T	6	6	35859	35864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013129	A	6	6	36566	36571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013129	T	6	6	38067	38072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013129	A	6	6	39373	39378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013129	T	6	6	39404	39409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013129	T	7	7	39484	39490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013129	T	7	7	39509	39515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013129	T	6	6	39636	39641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013129	T	6	6	41018	41023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013129	A	6	6	41110	41115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013129	T	6	6	42006	42011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013129	T	8	8	42126	42133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013129	A	6	6	42143	42148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013129	A	6	6	42517	42522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013129	C	6	6	42549	42554	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_013129	A	10	10	43589	43598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013129	T	6	6	43633	43638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013129	A	8	8	44591	44598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013129	T	8	8	44618	44625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013129	T	6	6	44653	44658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013129	A	6	6	46031	46036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013129	T	6	6	46054	46059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013129	T	6	6	46191	46196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013129	A	9	9	46366	46374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013129	T	8	8	46421	46428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013129	A	10	10	47369	47378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013129	T	6	6	47397	47402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013129	T	7	7	47427	47433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013129	A	7	7	48380	48386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013129	T	7	7	48405	48411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013129	T	6	6	48432	48437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013129	A	9	9	48636	48644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013129	T	7	7	48663	48669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013129	A	6	6	48670	48675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013129	A	6	6	49463	49468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013129	T	7	7	49503	49509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013129	A	8	8	50461	50468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013129	T	7	7	50549	50555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013129	T	7	7	50598	50604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013129	A	8	8	50605	50612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013129	T	6	6	50632	50637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013129	T	6	6	50708	50713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013129	A	6	6	50878	50883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013129	T	6	6	51825	51830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013129	T	6	6	52827	52832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.