MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	ATTTTT	2	12	75	86	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013129	TAAAAA	2	12	91	102	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013129	ATTAAT	2	12	564	575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013129	AATTAA	2	12	1153	1164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013129	AAATTT	2	12	4535	4546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013129	CTTAAG	2	12	4607	4618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013129	TAAAAA	2	12	4638	4649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013129	TTAAAT	2	12	17300	17311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013129	TCTTTT	2	12	24431	24442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013129	CTTTTT	2	12	38079	38090	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013129	AAAATT	2	12	39516	39527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013129	ATTAAT	2	12	41033	41044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013129	GTTTAA	2	12	41322	41333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013129	ATTGAT	2	12	42152	42163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013129	ATTAAA	2	12	42502	42513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013129	TTTAAA	2	12	46286	46297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013129	AATATA	2	12	50513	50524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013129	TTGTTT	2	12	50724	50735	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.