MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	AAAT	2	8	298	305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013129	AATT	2	8	399	406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013129	GCAA	2	8	521	528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013129	TTGC	2	8	551	558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013129	TAAT	2	8	1406	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013129	TAAT	2	8	1976	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013129	TCTA	2	8	2907	2914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013129	TAAA	2	8	4273	4280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013129	TACA	2	8	4295	4302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013129	ATGT	2	8	4307	4314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013129	TAAA	2	8	4404	4411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013129	TAAA	2	8	5175	5182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013129	ATAA	2	8	8231	8238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013129	TTAA	2	8	9312	9319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013129	TGAA	2	8	11452	11459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013129	ATAA	3	12	11462	11473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013129	TAAA	2	8	11527	11534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013129	ACTT	2	8	11600	11607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013129	ATTA	2	8	11696	11703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013129	ATTT	2	8	14880	14887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013129	TTAG	2	8	17347	17354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013129	TTAA	2	8	18126	18133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013129	TAAT	2	8	20131	20138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013129	ATTT	2	8	20643	20650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013129	AAAT	2	8	21026	21033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013129	CCTT	2	8	23256	23263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013129	GATT	2	8	23675	23682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013129	AGTA	2	8	25222	25229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013129	TAAT	2	8	25260	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013129	TTTG	2	8	27276	27283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013129	AGAA	2	8	30611	30618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013129	AGAA	2	8	30621	30628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013129	ATTA	2	8	34903	34910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013129	AATC	2	8	36526	36533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013129	TAAT	2	8	40117	40124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013129	ATTA	2	8	41099	41106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013129	ATTT	2	8	41992	41999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013129	TACA	2	8	42030	42037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013129	ATTT	2	8	42063	42070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013129	CTTG	2	8	42430	42437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013129	AATT	2	8	42440	42447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013129	TATT	2	8	42467	42474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013129	ATTA	2	8	43520	43527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013129	ATTA	2	8	45955	45962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013129	ATTA	2	8	45972	45979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013129	TTAA	2	8	45980	45987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013129	AATA	2	8	46018	46025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013129	TAAA	2	8	46026	46033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013129	ATTT	2	8	46339	46346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013129	ATTA	2	8	47220	47227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013129	ATTT	2	8	47332	47339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013129	ATTT	2	8	47342	47349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013129	ATTA	2	8	48261	48268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013129	ATTT	2	8	48343	48350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013129	ATTT	2	8	48353	48360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013129	ATTA	2	8	48516	48523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013129	ATTT	2	8	48611	48618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013129	TTTG	2	8	48690	48697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013129	TGAT	2	8	49390	49397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013129	TTAA	2	8	50872	50879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013129	TTTA	2	8	50898	50905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013129	AAAT	2	8	50948	50955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013129	AAGG	2	8	51944	51951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013129	AATT	2	8	51954	51961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.